MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC100

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001869	CG	3	6	602	607	0 %	0 %	50 %	50 %	10803548
2	NC_001869	GT	3	6	1680	1685	0 %	50 %	50 %	0 %	10803550
3	NC_001869	GA	3	6	1898	1903	50 %	0 %	50 %	0 %	10803551
4	NC_001869	CG	3	6	3405	3410	0 %	0 %	50 %	50 %	10803552
5	NC_001869	GC	3	6	3533	3538	0 %	0 %	50 %	50 %	10803552
6	NC_001869	AG	3	6	4718	4723	50 %	0 %	50 %	0 %	10803554
7	NC_001869	AT	3	6	4761	4766	50 %	50 %	0 %	0 %	10803554
8	NC_001869	AG	3	6	5075	5080	50 %	0 %	50 %	0 %	10803555
9	NC_001869	AC	3	6	5324	5329	50 %	0 %	0 %	50 %	10803555
10	NC_001869	CT	3	6	5373	5378	0 %	50 %	0 %	50 %	10803555
11	NC_001869	TG	3	6	5723	5728	0 %	50 %	50 %	0 %	10803556
12	NC_001869	CT	3	6	7848	7853	0 %	50 %	0 %	50 %	10803556
13	NC_001869	TC	3	6	8174	8179	0 %	50 %	0 %	50 %	10803557
14	NC_001869	CT	3	6	9456	9461	0 %	50 %	0 %	50 %	10803558
15	NC_001869	CG	3	6	10529	10534	0 %	0 %	50 %	50 %	10803558
16	NC_001869	TC	3	6	14501	14506	0 %	50 %	0 %	50 %	10803559
17	NC_001869	TC	3	6	14673	14678	0 %	50 %	0 %	50 %	10803559
18	NC_001869	CA	3	6	15797	15802	50 %	0 %	0 %	50 %	10803560
19	NC_001869	GT	3	6	16679	16684	0 %	50 %	50 %	0 %	10803562
20	NC_001869	GC	3	6	19839	19844	0 %	0 %	50 %	50 %	10803569
21	NC_001869	TC	3	6	20106	20111	0 %	50 %	0 %	50 %	10803570
22	NC_001869	GA	3	6	21356	21361	50 %	0 %	50 %	0 %	10803571
23	NC_001869	GT	3	6	22566	22571	0 %	50 %	50 %	0 %	10803572
24	NC_001869	CA	3	6	22993	22998	50 %	0 %	0 %	50 %	10803573
25	NC_001869	AT	3	6	23249	23254	50 %	50 %	0 %	0 %	10803573
26	NC_001869	TC	3	6	23645	23650	0 %	50 %	0 %	50 %	10803573
27	NC_001869	CG	4	8	24260	24267	0 %	0 %	50 %	50 %	10803574
28	NC_001869	CT	3	6	25123	25128	0 %	50 %	0 %	50 %	10803575
29	NC_001869	CG	3	6	25141	25146	0 %	0 %	50 %	50 %	10803575
30	NC_001869	CG	3	6	26717	26722	0 %	0 %	50 %	50 %	10803577
31	NC_001869	GC	3	6	28278	28283	0 %	0 %	50 %	50 %	10803577
32	NC_001869	AT	3	6	28621	28626	50 %	50 %	0 %	0 %	10803577
33	NC_001869	TC	3	6	30115	30120	0 %	50 %	0 %	50 %	10803578
34	NC_001869	GA	3	6	31526	31531	50 %	0 %	50 %	0 %	10803579
35	NC_001869	AT	3	6	34014	34019	50 %	50 %	0 %	0 %	10803580
36	NC_001869	CA	3	6	34724	34729	50 %	0 %	0 %	50 %	10803581
37	NC_001869	AC	3	6	35024	35029	50 %	0 %	0 %	50 %	10803581
38	NC_001869	CG	3	6	35190	35195	0 %	0 %	50 %	50 %	10803581
39	NC_001869	TG	3	6	35228	35233	0 %	50 %	50 %	0 %	10803581
40	NC_001869	CT	3	6	36026	36031	0 %	50 %	0 %	50 %	10803582
41	NC_001869	GA	3	6	36081	36086	50 %	0 %	50 %	0 %	10803582
42	NC_001869	GC	3	6	36705	36710	0 %	0 %	50 %	50 %	10803582
43	NC_001869	GC	3	6	36734	36739	0 %	0 %	50 %	50 %	10803582
44	NC_001869	GA	3	6	37103	37108	50 %	0 %	50 %	0 %	10803583
45	NC_001869	AG	3	6	37358	37363	50 %	0 %	50 %	0 %	10803583
46	NC_001869	CG	3	6	37517	37522	0 %	0 %	50 %	50 %	10803583
47	NC_001869	CT	3	6	42308	42313	0 %	50 %	0 %	50 %	10803586
48	NC_001869	TC	4	8	42374	42381	0 %	50 %	0 %	50 %	10803586
49	NC_001869	AG	3	6	43375	43380	50 %	0 %	50 %	0 %	10803586
50	NC_001869	CG	3	6	43948	43953	0 %	0 %	50 %	50 %	10803587
51	NC_001869	CT	3	6	44397	44402	0 %	50 %	0 %	50 %	10803587
52	NC_001869	GC	3	6	44467	44472	0 %	0 %	50 %	50 %	10803587
53	NC_001869	GA	3	6	44552	44557	50 %	0 %	50 %	0 %	10803587
54	NC_001869	CG	4	8	45318	45325	0 %	0 %	50 %	50 %	10803588
55	NC_001869	GT	3	6	45369	45374	0 %	50 %	50 %	0 %	10803588
56	NC_001869	GC	3	6	46227	46232	0 %	0 %	50 %	50 %	10803590
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58	NC_001869	GC	3	6	46723	46728	0 %	0 %	50 %	50 %	10803590
59	NC_001869	GC	3	6	46737	46742	0 %	0 %	50 %	50 %	10803590
60	NC_001869	GC	3	6	46804	46809	0 %	0 %	50 %	50 %	10803590
61	NC_001869	CT	3	6	47057	47062	0 %	50 %	0 %	50 %	10803590
62	NC_001869	CG	3	6	47430	47435	0 %	0 %	50 %	50 %	10803591
63	NC_001869	CG	3	6	47779	47784	0 %	0 %	50 %	50 %	10803592
64	NC_001869	TC	3	6	49574	49579	0 %	50 %	0 %	50 %	10803595
65	NC_001869	TC	4	8	50443	50450	0 %	50 %	0 %	50 %	10803596
66	NC_001869	GC	3	6	51835	51840	0 %	0 %	50 %	50 %	10803597
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69	NC_001869	GC	4	8	53543	53550	0 %	0 %	50 %	50 %	10803599
70	NC_001869	GC	4	8	55204	55211	0 %	0 %	50 %	50 %	10803602
71	NC_001869	GC	3	6	56581	56586	0 %	0 %	50 %	50 %	10803603
72	NC_001869	CG	3	6	56785	56790	0 %	0 %	50 %	50 %	10803603
73	NC_001869	GC	3	6	56828	56833	0 %	0 %	50 %	50 %	10803603
74	NC_001869	GC	4	8	56987	56994	0 %	0 %	50 %	50 %	10803603
75	NC_001869	CG	3	6	60290	60295	0 %	0 %	50 %	50 %	10803607
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81	NC_001869	AG	3	6	62847	62852	50 %	0 %	50 %	0 %	10803609
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104	NC_001869	GT	3	6	76628	76633	0 %	50 %	50 %	0 %	10803622
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111	NC_001869	GC	3	6	84203	84208	0 %	0 %	50 %	50 %	10803627
112	NC_001869	CG	3	6	84637	84642	0 %	0 %	50 %	50 %	10803627
113	NC_001869	GT	3	6	85363	85368	0 %	50 %	50 %	0 %	10803628
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115	NC_001869	GA	3	6	86876	86881	50 %	0 %	50 %	0 %	10803631
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121	NC_001869	CG	3	6	93721	93726	0 %	0 %	50 %	50 %	10803638
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124	NC_001869	TC	3	6	95360	95365	0 %	50 %	0 %	50 %	10803639
125	NC_001869	AG	3	6	95602	95607	50 %	0 %	50 %	0 %	10803640
126	NC_001869	GA	3	6	95763	95768	50 %	0 %	50 %	0 %	10803640
127	NC_001869	GT	3	6	96668	96673	0 %	50 %	50 %	0 %	10803640
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134	NC_001869	GC	3	6	98981	98986	0 %	0 %	50 %	50 %	10803642
135	NC_001869	TC	3	6	99288	99293	0 %	50 %	0 %	50 %	10803642
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142	NC_001869	AG	3	6	105161	105166	50 %	0 %	50 %	0 %	10803643
143	NC_001869	GA	3	6	108854	108859	50 %	0 %	50 %	0 %	10803644
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.