MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp54

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001857	TTAAAC	2	12	1641	1652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11496894
2	NC_001857	CTGTAT	2	12	3712	3723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11496896
3	NC_001857	ACAATA	2	12	5587	5598	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496898
4	NC_001857	ATTGAG	2	12	6117	6128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496899
5	NC_001857	AAAAGT	2	12	10947	10958	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365823348
6	NC_001857	AAAGCA	2	12	13018	13029	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	11496913
7	NC_001857	GATAAA	2	12	14343	14354	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11496915
8	NC_001857	TAAAGA	2	12	14493	14504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11496915
9	NC_001857	TTTTTA	2	12	17115	17126	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	11496911
10	NC_001857	TTCCAA	2	12	23165	23176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496929
11	NC_001857	ATCAAA	2	12	24671	24682	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496966
12	NC_001857	TTTTTA	2	12	25091	25102	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	11496966
13	NC_001857	TGAAGA	2	12	25746	25757	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365823351
14	NC_001857	ATTATG	2	12	25937	25948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365823351
15	NC_001857	GTTTTA	2	12	30575	30586	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	11496921
16	NC_001857	GCTTAA	2	12	31671	31682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11496945
17	NC_001857	TTCCAA	2	12	31907	31918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496946
18	NC_001857	TACAAA	2	12	34594	34605	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496950
19	NC_001857	AAATAT	2	12	35309	35320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496904
20	NC_001857	ACAAAA	2	12	35334	35345	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	11496904
21	NC_001857	TTTGGG	2	12	38369	38380	0 %	50 %	50 %	0 %	11496937
22	NC_001857	GTATTA	2	12	38564	38575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11496937
23	NC_001857	CTTTGT	2	12	44443	44454	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	11496951
24	NC_001857	TTGTCA	2	12	45751	45762	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11496923
25	NC_001857	GGAATT	2	12	52221	52232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496925

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.