MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp54

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001857	ATTTA	2	10	873	882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001857	GAATT	2	10	1594	1603	40 %	40 %	20 %	0 %	11496894
3	NC_001857	AGCAA	2	10	1605	1614	60 %	0 %	20 %	20 %	11496894
4	NC_001857	TTTTA	2	10	2081	2090	20 %	80 %	0 %	0 %	11496895
5	NC_001857	GGCAT	2	10	2454	2463	20 %	20 %	40 %	20 %	11496895
6	NC_001857	TAAAT	2	10	4256	4265	60 %	40 %	0 %	0 %	11496896
7	NC_001857	TTAAA	2	10	4903	4912	60 %	40 %	0 %	0 %	365823347
8	NC_001857	AAGAA	2	10	5098	5107	80 %	0 %	20 %	0 %	365823347
9	NC_001857	CAATT	2	10	5756	5765	40 %	40 %	0 %	20 %	11496899
10	NC_001857	TAAAA	2	10	5837	5846	80 %	20 %	0 %	0 %	11496899
11	NC_001857	CATTG	2	10	6676	6685	20 %	40 %	20 %	20 %	11496900
12	NC_001857	AATTT	2	10	8386	8395	40 %	60 %	0 %	0 %	11496902
13	NC_001857	AAGAG	2	10	8726	8735	60 %	0 %	40 %	0 %	11496903
14	NC_001857	CTTTT	2	10	9242	9251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_001857	ATTTT	2	10	9361	9370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001857	TATAA	2	10	9403	9412	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001857	TGAAA	2	10	9564	9573	60 %	20 %	20 %	0 %	11496927
18	NC_001857	AGTAA	2	10	9706	9715	60 %	20 %	20 %	0 %	11496927
19	NC_001857	AGTAA	2	10	10612	10621	60 %	20 %	20 %	0 %	365823348
20	NC_001857	TACTT	2	10	11676	11685	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_001857	ATAAA	2	10	12517	12526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001857	ATTCA	2	10	13854	13863	40 %	40 %	0 %	20 %	11496914
23	NC_001857	TTAAA	2	10	13886	13895	60 %	40 %	0 %	0 %	11496914
24	NC_001857	GATTT	2	10	14225	14234	20 %	60 %	20 %	0 %	11496914
25	NC_001857	TTTGA	2	10	15031	15040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001857	TCTAA	2	10	16470	16479	40 %	40 %	0 %	20 %	11496917
27	NC_001857	ATAAA	3	15	17317	17331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001857	TTTTA	2	10	17394	17403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001857	AATTA	2	10	18057	18066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001857	AATAA	2	10	18119	18128	80 %	20 %	0 %	0 %	11496963
31	NC_001857	AAAAG	2	10	19113	19122	80 %	0 %	20 %	0 %	11496928
32	NC_001857	TTCTT	2	10	19794	19803	0 %	80 %	0 %	20 %	11496928
33	NC_001857	CAAAA	2	10	19972	19981	80 %	0 %	0 %	20 %	11496928
34	NC_001857	TAATT	2	10	20404	20413	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001857	TGATT	2	10	21578	21587	20 %	60 %	20 %	0 %	11496964
36	NC_001857	AATTA	2	10	23109	23118	60 %	40 %	0 %	0 %	11496929
37	NC_001857	TATTT	2	10	23369	23378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001857	TTAAT	2	10	25190	25199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001857	CAAAT	2	10	28495	28504	60 %	20 %	0 %	20 %	11496918
40	NC_001857	TTTAA	2	10	29223	29232	40 %	60 %	0 %	0 %	11496919
41	NC_001857	GTTTT	2	10	30359	30368	0 %	80 %	20 %	0 %	11496921
42	NC_001857	TTAAT	2	10	31725	31734	40 %	60 %	0 %	0 %	11496945
43	NC_001857	TAATG	2	10	31869	31878	40 %	40 %	20 %	0 %	11496946
44	NC_001857	TAGAT	2	10	33526	33535	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001857	AAATA	2	10	33796	33805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001857	CCAAG	2	10	35657	35666	40 %	0 %	20 %	40 %	11496904
47	NC_001857	AGCAT	2	10	36165	36174	40 %	20 %	20 %	20 %	11496933
48	NC_001857	TATTT	2	10	36291	36300	20 %	80 %	0 %	0 %	11496934
49	NC_001857	CAAAT	2	10	36516	36525	60 %	20 %	0 %	20 %	11496934
50	NC_001857	ATTTT	2	10	39467	39476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001857	TGCTC	2	10	39878	39887	0 %	40 %	20 %	40 %	11496905
52	NC_001857	AGAAT	2	10	40024	40033	60 %	20 %	20 %	0 %	11496905
53	NC_001857	TATTT	2	10	40184	40193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001857	ATTTG	2	10	40825	40834	20 %	60 %	20 %	0 %	11496906
55	NC_001857	CAAGA	2	10	40996	41005	60 %	0 %	20 %	20 %	11496906
56	NC_001857	TAATA	2	10	42231	42240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001857	AGATG	2	10	42338	42347	40 %	20 %	40 %	0 %	11496908
58	NC_001857	ATTAA	2	10	42540	42549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001857	TCCTT	2	10	43404	43413	0 %	60 %	0 %	40 %	365823352
60	NC_001857	TGTAT	2	10	43802	43811	20 %	60 %	20 %	0 %	11496951
61	NC_001857	ATTTT	2	10	44518	44527	20 %	80 %	0 %	0 %	11496951
62	NC_001857	TTCTT	2	10	44868	44877	0 %	80 %	0 %	20 %	11496923
63	NC_001857	TTTGT	2	10	45533	45542	0 %	80 %	20 %	0 %	11496923
64	NC_001857	CTTTT	2	10	48665	48674	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_001857	CTTTT	2	10	49666	49675	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_001857	ATTTT	2	10	50704	50713	20 %	80 %	0 %	0 %	11496924
67	NC_001857	ATATA	2	10	52605	52614	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001857	AAAAG	2	10	52820	52829	80 %	0 %	20 %	0 %	11496909
69	NC_001857	TAAAT	2	10	53613	53622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.