MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp54

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001857	GAATT	2	10	1594	1603	40 %	40 %	20 %	0 %	11496894
2	NC_001857	AGCAA	2	10	1605	1614	60 %	0 %	20 %	20 %	11496894
3	NC_001857	TTTTA	2	10	2081	2090	20 %	80 %	0 %	0 %	11496895
4	NC_001857	GGCAT	2	10	2454	2463	20 %	20 %	40 %	20 %	11496895
5	NC_001857	TAAAT	2	10	4256	4265	60 %	40 %	0 %	0 %	11496896
6	NC_001857	TTAAA	2	10	4903	4912	60 %	40 %	0 %	0 %	365823347
7	NC_001857	AAGAA	2	10	5098	5107	80 %	0 %	20 %	0 %	365823347
8	NC_001857	CAATT	2	10	5756	5765	40 %	40 %	0 %	20 %	11496899
9	NC_001857	TAAAA	2	10	5837	5846	80 %	20 %	0 %	0 %	11496899
10	NC_001857	CATTG	2	10	6676	6685	20 %	40 %	20 %	20 %	11496900
11	NC_001857	AATTT	2	10	8386	8395	40 %	60 %	0 %	0 %	11496902
12	NC_001857	AAGAG	2	10	8726	8735	60 %	0 %	40 %	0 %	11496903
13	NC_001857	TGAAA	2	10	9564	9573	60 %	20 %	20 %	0 %	11496927
14	NC_001857	AGTAA	2	10	9706	9715	60 %	20 %	20 %	0 %	11496927
15	NC_001857	AGTAA	2	10	10612	10621	60 %	20 %	20 %	0 %	365823348
16	NC_001857	ATTCA	2	10	13854	13863	40 %	40 %	0 %	20 %	11496914
17	NC_001857	TTAAA	2	10	13886	13895	60 %	40 %	0 %	0 %	11496914
18	NC_001857	GATTT	2	10	14225	14234	20 %	60 %	20 %	0 %	11496914
19	NC_001857	TCTAA	2	10	16470	16479	40 %	40 %	0 %	20 %	11496917
20	NC_001857	AATAA	2	10	18119	18128	80 %	20 %	0 %	0 %	11496963
21	NC_001857	AAAAG	2	10	19113	19122	80 %	0 %	20 %	0 %	11496928
22	NC_001857	TTCTT	2	10	19794	19803	0 %	80 %	0 %	20 %	11496928
23	NC_001857	CAAAA	2	10	19972	19981	80 %	0 %	0 %	20 %	11496928
24	NC_001857	TGATT	2	10	21578	21587	20 %	60 %	20 %	0 %	11496964
25	NC_001857	AATTA	2	10	23109	23118	60 %	40 %	0 %	0 %	11496929
26	NC_001857	CAAAT	2	10	28495	28504	60 %	20 %	0 %	20 %	11496918
27	NC_001857	TTTAA	2	10	29223	29232	40 %	60 %	0 %	0 %	11496919
28	NC_001857	GTTTT	2	10	30359	30368	0 %	80 %	20 %	0 %	11496921
29	NC_001857	TTAAT	2	10	31725	31734	40 %	60 %	0 %	0 %	11496945
30	NC_001857	TAATG	2	10	31869	31878	40 %	40 %	20 %	0 %	11496946
31	NC_001857	CCAAG	2	10	35657	35666	40 %	0 %	20 %	40 %	11496904
32	NC_001857	AGCAT	2	10	36165	36174	40 %	20 %	20 %	20 %	11496933
33	NC_001857	TATTT	2	10	36291	36300	20 %	80 %	0 %	0 %	11496934
34	NC_001857	CAAAT	2	10	36516	36525	60 %	20 %	0 %	20 %	11496934
35	NC_001857	TGCTC	2	10	39878	39887	0 %	40 %	20 %	40 %	11496905
36	NC_001857	AGAAT	2	10	40024	40033	60 %	20 %	20 %	0 %	11496905
37	NC_001857	ATTTG	2	10	40825	40834	20 %	60 %	20 %	0 %	11496906
38	NC_001857	CAAGA	2	10	40996	41005	60 %	0 %	20 %	20 %	11496906
39	NC_001857	AGATG	2	10	42338	42347	40 %	20 %	40 %	0 %	11496908
40	NC_001857	TCCTT	2	10	43404	43413	0 %	60 %	0 %	40 %	365823352
41	NC_001857	TGTAT	2	10	43802	43811	20 %	60 %	20 %	0 %	11496951
42	NC_001857	ATTTT	2	10	44518	44527	20 %	80 %	0 %	0 %	11496951
43	NC_001857	TTCTT	2	10	44868	44877	0 %	80 %	0 %	20 %	11496923
44	NC_001857	TTTGT	2	10	45533	45542	0 %	80 %	20 %	0 %	11496923
45	NC_001857	ATTTT	2	10	50704	50713	20 %	80 %	0 %	0 %	11496924
46	NC_001857	AAAAG	2	10	52820	52829	80 %	0 %	20 %	0 %	11496909

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.