MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp54

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001857	AAAT	2	8	314	321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001857	AATT	2	8	414	421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001857	GCAA	2	8	536	543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_001857	TTGC	2	8	566	573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_001857	ATTT	2	8	803	810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001857	AGCA	2	8	966	973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_001857	TAAT	2	8	1422	1429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001857	TAAT	2	8	1992	1999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001857	TTAA	2	8	2049	2056	50 %	50 %	0 %	0 %	11496895
10	NC_001857	CAAA	2	8	2548	2555	75 %	0 %	0 %	25 %	11496895
11	NC_001857	ATTT	2	8	2656	2663	25 %	75 %	0 %	0 %	11496895
12	NC_001857	TCTA	2	8	2922	2929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_001857	CAAT	2	8	3620	3627	50 %	25 %	0 %	25 %	11496896
14	NC_001857	CCAC	2	8	3753	3760	25 %	0 %	0 %	75 %	11496896
15	NC_001857	AACA	2	8	4209	4216	75 %	0 %	0 %	25 %	11496896
16	NC_001857	TAAA	2	8	4288	4295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001857	TACA	2	8	4310	4317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_001857	ATGT	2	8	4322	4329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001857	TAAA	2	8	4419	4426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001857	CTTT	2	8	4841	4848	0 %	75 %	0 %	25 %	365823347
21	NC_001857	TAAA	2	8	5190	5197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001857	ACAA	2	8	5800	5807	75 %	0 %	0 %	25 %	11496899
23	NC_001857	GCAA	2	8	6068	6075	50 %	0 %	25 %	25 %	11496899
24	NC_001857	ACAA	2	8	6486	6493	75 %	0 %	0 %	25 %	11496899
25	NC_001857	CAAA	2	8	7588	7595	75 %	0 %	0 %	25 %	11496901
26	NC_001857	TTGA	2	8	7650	7657	25 %	50 %	25 %	0 %	11496901
27	NC_001857	AAAT	2	8	7690	7697	75 %	25 %	0 %	0 %	11496901
28	NC_001857	ATTT	2	8	8019	8026	25 %	75 %	0 %	0 %	11496901
29	NC_001857	ATAA	2	8	8246	8253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001857	TAAA	2	8	8423	8430	75 %	25 %	0 %	0 %	11496902
31	NC_001857	TCAA	2	8	8751	8758	50 %	25 %	0 %	25 %	11496903
32	NC_001857	ATCA	2	8	9123	9130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_001857	TTAA	2	8	9327	9334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001857	TATT	2	8	9466	9473	25 %	75 %	0 %	0 %	11496927
35	NC_001857	GAAG	2	8	10864	10871	50 %	0 %	50 %	0 %	365823348
36	NC_001857	TGAA	2	8	11459	11466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001857	ATAA	3	12	11469	11480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001857	TAAA	2	8	11534	11541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001857	ACTT	2	8	11607	11614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_001857	ATTA	2	8	11703	11710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001857	TTTA	2	8	11896	11903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001857	TAAA	2	8	11905	11912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001857	GAAA	2	8	11919	11926	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001857	AAAT	2	8	12160	12167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001857	GAAA	2	8	13339	13346	75 %	0 %	25 %	0 %	11496913
46	NC_001857	TCAA	2	8	13648	13655	50 %	25 %	0 %	25 %	11496914
47	NC_001857	TGTA	2	8	13983	13990	25 %	50 %	25 %	0 %	11496914
48	NC_001857	ATTT	2	8	14045	14052	25 %	75 %	0 %	0 %	11496914
49	NC_001857	TAAT	2	8	14096	14103	50 %	50 %	0 %	0 %	11496914
50	NC_001857	TAAA	2	8	14282	14289	75 %	25 %	0 %	0 %	11496914
51	NC_001857	AAAG	2	8	14680	14687	75 %	0 %	25 %	0 %	11496915
52	NC_001857	CTTT	2	8	14793	14800	0 %	75 %	0 %	25 %	11496915
53	NC_001857	ATTT	2	8	14887	14894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001857	GAAA	2	8	15752	15759	75 %	0 %	25 %	0 %	365823349
55	NC_001857	TTGG	2	8	15958	15965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001857	TAGT	2	8	16528	16535	25 %	50 %	25 %	0 %	11496917
57	NC_001857	ATTT	2	8	16694	16701	25 %	75 %	0 %	0 %	11496911
58	NC_001857	GCAA	2	8	16799	16806	50 %	0 %	25 %	25 %	11496911
59	NC_001857	TTCT	2	8	17175	17182	0 %	75 %	0 %	25 %	11496911
60	NC_001857	TTAG	2	8	17332	17339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001857	TTAA	2	8	18111	18118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001857	AAAT	2	8	18241	18248	75 %	25 %	0 %	0 %	11496963
63	NC_001857	ACCA	2	8	18817	18824	50 %	0 %	0 %	50 %	11496928
64	NC_001857	AAAT	2	8	18847	18854	75 %	25 %	0 %	0 %	11496928
65	NC_001857	TCAA	2	8	19536	19543	50 %	25 %	0 %	25 %	11496928
66	NC_001857	GTGG	2	8	19592	19599	0 %	25 %	75 %	0 %	11496928
67	NC_001857	TGCT	2	8	19692	19699	0 %	50 %	25 %	25 %	11496928
68	NC_001857	TTTG	2	8	19888	19895	0 %	75 %	25 %	0 %	11496928
69	NC_001857	TAAT	2	8	20116	20123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001857	TAAA	2	8	20214	20221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001857	TAAA	2	8	20225	20232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001857	TAAA	2	8	20236	20243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001857	TAAA	2	8	20247	20254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001857	TAAA	2	8	20258	20265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001857	ATTT	2	8	20672	20679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001857	AAAT	2	8	21055	21062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001857	GAAA	2	8	21161	21168	75 %	0 %	25 %	0 %	11496964
78	NC_001857	CTTT	2	8	21204	21211	0 %	75 %	0 %	25 %	11496964
79	NC_001857	TGAC	2	8	21262	21269	25 %	25 %	25 %	25 %	11496964
80	NC_001857	TAAG	2	8	21418	21425	50 %	25 %	25 %	0 %	11496964
81	NC_001857	TTGT	2	8	21730	21737	0 %	75 %	25 %	0 %	11496929
82	NC_001857	TGCT	2	8	22946	22953	0 %	50 %	25 %	25 %	11496929
83	NC_001857	CCTT	2	8	23284	23291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_001857	GATT	2	8	23704	23711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001857	GCAA	2	8	24140	24147	50 %	0 %	25 %	25 %	365823350
86	NC_001857	GATT	2	8	24872	24879	25 %	50 %	25 %	0 %	11496966
87	NC_001857	CAGA	2	8	25000	25007	50 %	0 %	25 %	25 %	11496966
88	NC_001857	AGTA	2	8	25251	25258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001857	TAAT	2	8	25289	25296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001857	AATC	2	8	25512	25519	50 %	25 %	0 %	25 %	365823351
91	NC_001857	AATT	2	8	25596	25603	50 %	50 %	0 %	0 %	365823351
92	NC_001857	CTTG	2	8	25622	25629	0 %	50 %	25 %	25 %	365823351
93	NC_001857	AAAG	2	8	25630	25637	75 %	0 %	25 %	0 %	365823351
94	NC_001857	ATTT	2	8	26014	26021	25 %	75 %	0 %	0 %	365823351
95	NC_001857	CAAA	2	8	26180	26187	75 %	0 %	0 %	25 %	365823351
96	NC_001857	ATAA	2	8	26889	26896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001857	GAAT	2	8	27263	27270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001857	TTTG	2	8	27315	27322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001857	TACT	2	8	28286	28293	25 %	50 %	0 %	25 %	11496918
100	NC_001857	AATT	2	8	28571	28578	50 %	50 %	0 %	0 %	11496918
101	NC_001857	TGTT	2	8	29161	29168	0 %	75 %	25 %	0 %	11496919
102	NC_001857	TTAA	2	8	29549	29556	50 %	50 %	0 %	0 %	11496920
103	NC_001857	CAAA	2	8	29894	29901	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_001857	AGAA	2	8	30650	30657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001857	AGAA	2	8	30660	30667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001857	AGAA	2	8	30670	30677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001857	GCAA	2	8	31215	31222	50 %	0 %	25 %	25 %	11496945
108	NC_001857	CAAG	2	8	31259	31266	50 %	0 %	25 %	25 %	11496945
109	NC_001857	AGCA	2	8	31884	31891	50 %	0 %	25 %	25 %	11496946
110	NC_001857	CAAT	2	8	32171	32178	50 %	25 %	0 %	25 %	11496946
111	NC_001857	ACAT	2	8	32299	32306	50 %	25 %	0 %	25 %	11496947
112	NC_001857	GGTT	2	8	32574	32581	0 %	50 %	50 %	0 %	11496947
113	NC_001857	TACA	2	8	32840	32847	50 %	25 %	0 %	25 %	11496948
114	NC_001857	AGCA	2	8	34444	34451	50 %	0 %	25 %	25 %	11496950
115	NC_001857	ATTA	2	8	34952	34959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001857	GTAT	2	8	35107	35114	25 %	50 %	25 %	0 %	11496904
117	NC_001857	TTTA	2	8	35825	35832	25 %	75 %	0 %	0 %	11496904
118	NC_001857	AATT	2	8	35961	35968	50 %	50 %	0 %	0 %	11496933
119	NC_001857	TAAT	2	8	36126	36133	50 %	50 %	0 %	0 %	11496933
120	NC_001857	AATC	2	8	36575	36582	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_001857	ATGA	2	8	37105	37112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001857	ATTT	2	8	37251	37258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001857	TTTG	2	8	37317	37324	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001857	AGAC	2	8	37428	37435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_001857	GTTG	2	8	38248	38255	0 %	50 %	50 %	0 %	11496937
126	NC_001857	AGTG	2	8	38760	38767	25 %	25 %	50 %	0 %	11496937
127	NC_001857	AATA	2	8	40071	40078	75 %	25 %	0 %	0 %	11496905
128	NC_001857	AAAT	2	8	40088	40095	75 %	25 %	0 %	0 %	11496905
129	NC_001857	TAAT	2	8	40166	40173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001857	GCTT	2	8	40792	40799	0 %	50 %	25 %	25 %	11496906
131	NC_001857	TTTA	2	8	40977	40984	25 %	75 %	0 %	0 %	11496906
132	NC_001857	ATTT	2	8	41044	41051	25 %	75 %	0 %	0 %	11496906
133	NC_001857	ATTA	2	8	41148	41155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001857	ACTT	2	8	41462	41469	25 %	50 %	0 %	25 %	11496907
135	NC_001857	ATTT	2	8	42041	42048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001857	TACA	2	8	42079	42086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_001857	ATTT	2	8	42112	42119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001857	TTGC	2	8	42313	42320	0 %	50 %	25 %	25 %	11496908
139	NC_001857	CTTG	2	8	42479	42486	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_001857	AATT	2	8	42489	42496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001857	TATT	2	8	42516	42523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_001857	GTTT	2	8	42863	42870	0 %	75 %	25 %	0 %	365823352
143	NC_001857	AATT	2	8	43512	43519	50 %	50 %	0 %	0 %	365823352
144	NC_001857	ATTA	2	8	43569	43576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001857	GTTT	2	8	44059	44066	0 %	75 %	25 %	0 %	11496951
146	NC_001857	TTTG	2	8	44342	44349	0 %	75 %	25 %	0 %	11496951
147	NC_001857	ATTT	2	8	44988	44995	25 %	75 %	0 %	0 %	11496923
148	NC_001857	GAAA	2	8	45012	45019	75 %	0 %	25 %	0 %	11496923
149	NC_001857	ATTT	2	8	45149	45156	25 %	75 %	0 %	0 %	11496923
150	NC_001857	TTTG	2	8	45409	45416	0 %	75 %	25 %	0 %	11496923
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.