MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp54

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001857	TTAA	2	8	2049	2056	50 %	50 %	0 %	0 %	11496895
2	NC_001857	CAAA	2	8	2548	2555	75 %	0 %	0 %	25 %	11496895
3	NC_001857	ATTT	2	8	2656	2663	25 %	75 %	0 %	0 %	11496895
4	NC_001857	CAAT	2	8	3620	3627	50 %	25 %	0 %	25 %	11496896
5	NC_001857	CCAC	2	8	3753	3760	25 %	0 %	0 %	75 %	11496896
6	NC_001857	AACA	2	8	4209	4216	75 %	0 %	0 %	25 %	11496896
7	NC_001857	CTTT	2	8	4841	4848	0 %	75 %	0 %	25 %	365823347
8	NC_001857	ACAA	2	8	5800	5807	75 %	0 %	0 %	25 %	11496899
9	NC_001857	GCAA	2	8	6068	6075	50 %	0 %	25 %	25 %	11496899
10	NC_001857	ACAA	2	8	6486	6493	75 %	0 %	0 %	25 %	11496899
11	NC_001857	CAAA	2	8	7588	7595	75 %	0 %	0 %	25 %	11496901
12	NC_001857	TTGA	2	8	7650	7657	25 %	50 %	25 %	0 %	11496901
13	NC_001857	AAAT	2	8	7690	7697	75 %	25 %	0 %	0 %	11496901
14	NC_001857	ATTT	2	8	8019	8026	25 %	75 %	0 %	0 %	11496901
15	NC_001857	TAAA	2	8	8423	8430	75 %	25 %	0 %	0 %	11496902
16	NC_001857	TCAA	2	8	8751	8758	50 %	25 %	0 %	25 %	11496903
17	NC_001857	TATT	2	8	9466	9473	25 %	75 %	0 %	0 %	11496927
18	NC_001857	GAAG	2	8	10864	10871	50 %	0 %	50 %	0 %	365823348
19	NC_001857	GAAA	2	8	13339	13346	75 %	0 %	25 %	0 %	11496913
20	NC_001857	TCAA	2	8	13648	13655	50 %	25 %	0 %	25 %	11496914
21	NC_001857	TGTA	2	8	13983	13990	25 %	50 %	25 %	0 %	11496914
22	NC_001857	ATTT	2	8	14045	14052	25 %	75 %	0 %	0 %	11496914
23	NC_001857	TAAT	2	8	14096	14103	50 %	50 %	0 %	0 %	11496914
24	NC_001857	TAAA	2	8	14282	14289	75 %	25 %	0 %	0 %	11496914
25	NC_001857	AAAG	2	8	14680	14687	75 %	0 %	25 %	0 %	11496915
26	NC_001857	CTTT	2	8	14793	14800	0 %	75 %	0 %	25 %	11496915
27	NC_001857	GAAA	2	8	15752	15759	75 %	0 %	25 %	0 %	365823349
28	NC_001857	TAGT	2	8	16528	16535	25 %	50 %	25 %	0 %	11496917
29	NC_001857	ATTT	2	8	16694	16701	25 %	75 %	0 %	0 %	11496911
30	NC_001857	GCAA	2	8	16799	16806	50 %	0 %	25 %	25 %	11496911
31	NC_001857	TTCT	2	8	17175	17182	0 %	75 %	0 %	25 %	11496911
32	NC_001857	AAAT	2	8	18241	18248	75 %	25 %	0 %	0 %	11496963
33	NC_001857	ACCA	2	8	18817	18824	50 %	0 %	0 %	50 %	11496928
34	NC_001857	AAAT	2	8	18847	18854	75 %	25 %	0 %	0 %	11496928
35	NC_001857	TCAA	2	8	19536	19543	50 %	25 %	0 %	25 %	11496928
36	NC_001857	GTGG	2	8	19592	19599	0 %	25 %	75 %	0 %	11496928
37	NC_001857	TGCT	2	8	19692	19699	0 %	50 %	25 %	25 %	11496928
38	NC_001857	TTTG	2	8	19888	19895	0 %	75 %	25 %	0 %	11496928
39	NC_001857	GAAA	2	8	21161	21168	75 %	0 %	25 %	0 %	11496964
40	NC_001857	CTTT	2	8	21204	21211	0 %	75 %	0 %	25 %	11496964
41	NC_001857	TGAC	2	8	21262	21269	25 %	25 %	25 %	25 %	11496964
42	NC_001857	TAAG	2	8	21418	21425	50 %	25 %	25 %	0 %	11496964
43	NC_001857	TTGT	2	8	21730	21737	0 %	75 %	25 %	0 %	11496929
44	NC_001857	TGCT	2	8	22946	22953	0 %	50 %	25 %	25 %	11496929
45	NC_001857	GCAA	2	8	24140	24147	50 %	0 %	25 %	25 %	365823350
46	NC_001857	GATT	2	8	24872	24879	25 %	50 %	25 %	0 %	11496966
47	NC_001857	CAGA	2	8	25000	25007	50 %	0 %	25 %	25 %	11496966
48	NC_001857	AATC	2	8	25512	25519	50 %	25 %	0 %	25 %	365823351
49	NC_001857	AATT	2	8	25596	25603	50 %	50 %	0 %	0 %	365823351
50	NC_001857	CTTG	2	8	25622	25629	0 %	50 %	25 %	25 %	365823351
51	NC_001857	AAAG	2	8	25630	25637	75 %	0 %	25 %	0 %	365823351
52	NC_001857	ATTT	2	8	26014	26021	25 %	75 %	0 %	0 %	365823351
53	NC_001857	CAAA	2	8	26180	26187	75 %	0 %	0 %	25 %	365823351
54	NC_001857	TACT	2	8	28286	28293	25 %	50 %	0 %	25 %	11496918
55	NC_001857	AATT	2	8	28571	28578	50 %	50 %	0 %	0 %	11496918
56	NC_001857	TGTT	2	8	29161	29168	0 %	75 %	25 %	0 %	11496919
57	NC_001857	TTAA	2	8	29549	29556	50 %	50 %	0 %	0 %	11496920
58	NC_001857	GCAA	2	8	31215	31222	50 %	0 %	25 %	25 %	11496945
59	NC_001857	CAAG	2	8	31259	31266	50 %	0 %	25 %	25 %	11496945
60	NC_001857	AGCA	2	8	31884	31891	50 %	0 %	25 %	25 %	11496946
61	NC_001857	CAAT	2	8	32171	32178	50 %	25 %	0 %	25 %	11496946
62	NC_001857	ACAT	2	8	32299	32306	50 %	25 %	0 %	25 %	11496947
63	NC_001857	GGTT	2	8	32574	32581	0 %	50 %	50 %	0 %	11496947
64	NC_001857	TACA	2	8	32840	32847	50 %	25 %	0 %	25 %	11496948
65	NC_001857	AGCA	2	8	34444	34451	50 %	0 %	25 %	25 %	11496950
66	NC_001857	GTAT	2	8	35107	35114	25 %	50 %	25 %	0 %	11496904
67	NC_001857	TTTA	2	8	35825	35832	25 %	75 %	0 %	0 %	11496904
68	NC_001857	AATT	2	8	35961	35968	50 %	50 %	0 %	0 %	11496933
69	NC_001857	TAAT	2	8	36126	36133	50 %	50 %	0 %	0 %	11496933
70	NC_001857	GTTG	2	8	38248	38255	0 %	50 %	50 %	0 %	11496937
71	NC_001857	AGTG	2	8	38760	38767	25 %	25 %	50 %	0 %	11496937
72	NC_001857	AATA	2	8	40071	40078	75 %	25 %	0 %	0 %	11496905
73	NC_001857	AAAT	2	8	40088	40095	75 %	25 %	0 %	0 %	11496905
74	NC_001857	GCTT	2	8	40792	40799	0 %	50 %	25 %	25 %	11496906
75	NC_001857	TTTA	2	8	40977	40984	25 %	75 %	0 %	0 %	11496906
76	NC_001857	ATTT	2	8	41044	41051	25 %	75 %	0 %	0 %	11496906
77	NC_001857	ACTT	2	8	41462	41469	25 %	50 %	0 %	25 %	11496907
78	NC_001857	TTGC	2	8	42313	42320	0 %	50 %	25 %	25 %	11496908
79	NC_001857	GTTT	2	8	42863	42870	0 %	75 %	25 %	0 %	365823352
80	NC_001857	AATT	2	8	43512	43519	50 %	50 %	0 %	0 %	365823352
81	NC_001857	GTTT	2	8	44059	44066	0 %	75 %	25 %	0 %	11496951
82	NC_001857	TTTG	2	8	44342	44349	0 %	75 %	25 %	0 %	11496951
83	NC_001857	ATTT	2	8	44988	44995	25 %	75 %	0 %	0 %	11496923
84	NC_001857	GAAA	2	8	45012	45019	75 %	0 %	25 %	0 %	11496923
85	NC_001857	ATTT	2	8	45149	45156	25 %	75 %	0 %	0 %	11496923
86	NC_001857	TTTG	2	8	45409	45416	0 %	75 %	25 %	0 %	11496923
87	NC_001857	AATC	2	8	46740	46747	50 %	25 %	0 %	25 %	11496953
88	NC_001857	GATT	2	8	48171	48178	25 %	50 %	25 %	0 %	11496954
89	NC_001857	CTTT	2	8	49965	49972	0 %	75 %	0 %	25 %	365823353
90	NC_001857	TATT	2	8	50810	50817	25 %	75 %	0 %	0 %	11496924
91	NC_001857	TAAA	2	8	52199	52206	75 %	25 %	0 %	0 %	11496925
92	NC_001857	ATTG	3	12	53495	53506	25 %	50 %	25 %	0 %	11496909

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.