MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp54

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001857	TA	3	6	187	192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001857	AC	3	6	716	721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_001857	TA	3	6	1964	1969	50 %	50 %	0 %	0 %	11496894
4	NC_001857	CT	4	8	2424	2431	0 %	50 %	0 %	50 %	11496895
5	NC_001857	TC	3	6	2819	2824	0 %	50 %	0 %	50 %	11496895
6	NC_001857	TA	3	6	3048	3053	50 %	50 %	0 %	0 %	11496896
7	NC_001857	CA	4	8	5149	5156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_001857	AT	3	6	5224	5229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001857	CA	3	6	6410	6415	50 %	0 %	0 %	50 %	11496899
10	NC_001857	AG	3	6	6608	6613	50 %	0 %	50 %	0 %	11496900
11	NC_001857	AT	3	6	7442	7447	50 %	50 %	0 %	0 %	11496901
12	NC_001857	CA	3	6	7566	7571	50 %	0 %	0 %	50 %	11496901
13	NC_001857	AC	3	6	7895	7900	50 %	0 %	0 %	50 %	11496901
14	NC_001857	TA	3	6	8546	8551	50 %	50 %	0 %	0 %	11496903
15	NC_001857	AG	3	6	8698	8703	50 %	0 %	50 %	0 %	11496903
16	NC_001857	AT	3	6	9450	9455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001857	TA	3	6	11179	11184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001857	TA	3	6	11250	11255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001857	AC	3	6	11878	11883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_001857	TA	4	8	12206	12213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001857	AT	4	8	13754	13761	50 %	50 %	0 %	0 %	11496914
22	NC_001857	TA	3	6	13930	13935	50 %	50 %	0 %	0 %	11496914
23	NC_001857	GA	4	8	14185	14192	50 %	0 %	50 %	0 %	11496914
24	NC_001857	AG	3	6	15643	15648	50 %	0 %	50 %	0 %	365823349
25	NC_001857	TC	3	6	16092	16097	0 %	50 %	0 %	50 %	11496917
26	NC_001857	AT	3	6	17975	17980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001857	AT	3	6	18154	18159	50 %	50 %	0 %	0 %	11496963
28	NC_001857	AG	3	6	18587	18592	50 %	0 %	50 %	0 %	11496963
29	NC_001857	AG	3	6	18612	18617	50 %	0 %	50 %	0 %	11496963
30	NC_001857	GA	3	6	18652	18657	50 %	0 %	50 %	0 %	11496963
31	NC_001857	AT	3	6	19651	19656	50 %	50 %	0 %	0 %	11496928
32	NC_001857	AG	3	6	19752	19757	50 %	0 %	50 %	0 %	11496928
33	NC_001857	GC	3	6	19875	19880	0 %	0 %	50 %	50 %	11496928
34	NC_001857	AG	3	6	20572	20577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001857	AG	3	6	20835	20840	50 %	0 %	50 %	0 %	11496960
36	NC_001857	AG	3	6	20880	20885	50 %	0 %	50 %	0 %	11496960
37	NC_001857	AT	3	6	21095	21100	50 %	50 %	0 %	0 %	11496964
38	NC_001857	TA	3	6	21106	21111	50 %	50 %	0 %	0 %	11496964
39	NC_001857	AG	3	6	21596	21601	50 %	0 %	50 %	0 %	11496964
40	NC_001857	AT	3	6	21956	21961	50 %	50 %	0 %	0 %	11496929
41	NC_001857	GT	3	6	22740	22745	0 %	50 %	50 %	0 %	11496929
42	NC_001857	GA	4	8	22775	22782	50 %	0 %	50 %	0 %	11496929
43	NC_001857	AT	4	8	23548	23555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001857	CA	3	6	24834	24839	50 %	0 %	0 %	50 %	11496966
45	NC_001857	CT	3	6	25150	25155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_001857	GA	3	6	25885	25890	50 %	0 %	50 %	0 %	365823351
47	NC_001857	AG	3	6	26227	26232	50 %	0 %	50 %	0 %	365823351
48	NC_001857	GA	3	6	28343	28348	50 %	0 %	50 %	0 %	11496918
49	NC_001857	GA	3	6	28587	28592	50 %	0 %	50 %	0 %	11496918
50	NC_001857	AT	3	6	28764	28769	50 %	50 %	0 %	0 %	11496918
51	NC_001857	CT	3	6	29363	29368	0 %	50 %	0 %	50 %	11496919
52	NC_001857	TA	3	6	29431	29436	50 %	50 %	0 %	0 %	11496920
53	NC_001857	AG	3	6	30624	30629	50 %	0 %	50 %	0 %	11496921
54	NC_001857	TC	3	6	31426	31431	0 %	50 %	0 %	50 %	11496945
55	NC_001857	GA	3	6	31782	31787	50 %	0 %	50 %	0 %	11496946
56	NC_001857	AG	3	6	32473	32478	50 %	0 %	50 %	0 %	11496947
57	NC_001857	GA	3	6	33839	33844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001857	TC	3	6	34555	34560	0 %	50 %	0 %	50 %	11496950
59	NC_001857	AG	3	6	35383	35388	50 %	0 %	50 %	0 %	11496904
60	NC_001857	AG	3	6	35684	35689	50 %	0 %	50 %	0 %	11496904
61	NC_001857	AG	3	6	35735	35740	50 %	0 %	50 %	0 %	11496904
62	NC_001857	AG	4	8	36408	36415	50 %	0 %	50 %	0 %	11496934
63	NC_001857	GA	3	6	36946	36951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001857	AG	3	6	37017	37022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001857	AG	3	6	37137	37142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001857	AG	3	6	37492	37497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001857	GT	3	6	37596	37601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001857	CT	3	6	38647	38652	0 %	50 %	0 %	50 %	11496937
69	NC_001857	AG	3	6	38702	38707	50 %	0 %	50 %	0 %	11496937
70	NC_001857	AT	3	6	39582	39587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001857	AT	3	6	39796	39801	50 %	50 %	0 %	0 %	11496938
72	NC_001857	CT	3	6	39889	39894	0 %	50 %	0 %	50 %	11496905
73	NC_001857	TA	3	6	40150	40155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001857	TG	3	6	40705	40710	0 %	50 %	50 %	0 %	11496906
75	NC_001857	TA	3	6	41076	41081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001857	GT	3	6	41358	41363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001857	TC	3	6	43068	43073	0 %	50 %	0 %	50 %	365823352
78	NC_001857	AG	3	6	43459	43464	50 %	0 %	50 %	0 %	365823352
79	NC_001857	CT	3	6	43658	43663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_001857	GT	3	6	45176	45181	0 %	50 %	50 %	0 %	11496923
81	NC_001857	AT	3	6	46238	46243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001857	AT	3	6	47453	47458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001857	AT	3	6	48461	48466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001857	TC	3	6	50484	50489	0 %	50 %	0 %	50 %	11496924
85	NC_001857	GT	3	6	50645	50650	0 %	50 %	50 %	0 %	11496924
86	NC_001857	TA	3	6	51618	51623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001857	AT	3	6	52484	52489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001857	AG	3	6	52810	52815	50 %	0 %	50 %	0 %	11496909
89	NC_001857	CA	3	6	52865	52870	50 %	0 %	0 %	50 %	11496909
90	NC_001857	AG	3	6	52991	52996	50 %	0 %	50 %	0 %	11496909
91	NC_001857	TA	3	6	53190	53195	50 %	50 %	0 %	0 %	11496909
92	NC_001857	GT	3	6	53510	53515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.