MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp54

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001857	TA	3	6	1964	1969	50 %	50 %	0 %	0 %	11496894
2	NC_001857	CT	4	8	2424	2431	0 %	50 %	0 %	50 %	11496895
3	NC_001857	TC	3	6	2819	2824	0 %	50 %	0 %	50 %	11496895
4	NC_001857	TA	3	6	3048	3053	50 %	50 %	0 %	0 %	11496896
5	NC_001857	CA	3	6	6410	6415	50 %	0 %	0 %	50 %	11496899
6	NC_001857	AG	3	6	6608	6613	50 %	0 %	50 %	0 %	11496900
7	NC_001857	AT	3	6	7442	7447	50 %	50 %	0 %	0 %	11496901
8	NC_001857	CA	3	6	7566	7571	50 %	0 %	0 %	50 %	11496901
9	NC_001857	AC	3	6	7895	7900	50 %	0 %	0 %	50 %	11496901
10	NC_001857	TA	3	6	8546	8551	50 %	50 %	0 %	0 %	11496903
11	NC_001857	AG	3	6	8698	8703	50 %	0 %	50 %	0 %	11496903
12	NC_001857	AT	4	8	13754	13761	50 %	50 %	0 %	0 %	11496914
13	NC_001857	TA	3	6	13930	13935	50 %	50 %	0 %	0 %	11496914
14	NC_001857	GA	4	8	14185	14192	50 %	0 %	50 %	0 %	11496914
15	NC_001857	AG	3	6	15643	15648	50 %	0 %	50 %	0 %	365823349
16	NC_001857	TC	3	6	16092	16097	0 %	50 %	0 %	50 %	11496917
17	NC_001857	AT	3	6	18154	18159	50 %	50 %	0 %	0 %	11496963
18	NC_001857	AG	3	6	18587	18592	50 %	0 %	50 %	0 %	11496963
19	NC_001857	AG	3	6	18612	18617	50 %	0 %	50 %	0 %	11496963
20	NC_001857	GA	3	6	18652	18657	50 %	0 %	50 %	0 %	11496963
21	NC_001857	AT	3	6	19651	19656	50 %	50 %	0 %	0 %	11496928
22	NC_001857	AG	3	6	19752	19757	50 %	0 %	50 %	0 %	11496928
23	NC_001857	GC	3	6	19875	19880	0 %	0 %	50 %	50 %	11496928
24	NC_001857	AG	3	6	20835	20840	50 %	0 %	50 %	0 %	11496960
25	NC_001857	AG	3	6	20880	20885	50 %	0 %	50 %	0 %	11496960
26	NC_001857	AT	3	6	21095	21100	50 %	50 %	0 %	0 %	11496964
27	NC_001857	TA	3	6	21106	21111	50 %	50 %	0 %	0 %	11496964
28	NC_001857	AG	3	6	21596	21601	50 %	0 %	50 %	0 %	11496964
29	NC_001857	AT	3	6	21956	21961	50 %	50 %	0 %	0 %	11496929
30	NC_001857	GT	3	6	22740	22745	0 %	50 %	50 %	0 %	11496929
31	NC_001857	GA	4	8	22775	22782	50 %	0 %	50 %	0 %	11496929
32	NC_001857	CA	3	6	24834	24839	50 %	0 %	0 %	50 %	11496966
33	NC_001857	GA	3	6	25885	25890	50 %	0 %	50 %	0 %	365823351
34	NC_001857	AG	3	6	26227	26232	50 %	0 %	50 %	0 %	365823351
35	NC_001857	GA	3	6	28343	28348	50 %	0 %	50 %	0 %	11496918
36	NC_001857	GA	3	6	28587	28592	50 %	0 %	50 %	0 %	11496918
37	NC_001857	AT	3	6	28764	28769	50 %	50 %	0 %	0 %	11496918
38	NC_001857	CT	3	6	29363	29368	0 %	50 %	0 %	50 %	11496919
39	NC_001857	TA	3	6	29431	29436	50 %	50 %	0 %	0 %	11496920
40	NC_001857	AG	3	6	30624	30629	50 %	0 %	50 %	0 %	11496921
41	NC_001857	TC	3	6	31426	31431	0 %	50 %	0 %	50 %	11496945
42	NC_001857	GA	3	6	31782	31787	50 %	0 %	50 %	0 %	11496946
43	NC_001857	AG	3	6	32473	32478	50 %	0 %	50 %	0 %	11496947
44	NC_001857	TC	3	6	34555	34560	0 %	50 %	0 %	50 %	11496950
45	NC_001857	AG	3	6	35383	35388	50 %	0 %	50 %	0 %	11496904
46	NC_001857	AG	3	6	35684	35689	50 %	0 %	50 %	0 %	11496904
47	NC_001857	AG	3	6	35735	35740	50 %	0 %	50 %	0 %	11496904
48	NC_001857	AG	4	8	36408	36415	50 %	0 %	50 %	0 %	11496934
49	NC_001857	CT	3	6	38647	38652	0 %	50 %	0 %	50 %	11496937
50	NC_001857	AG	3	6	38702	38707	50 %	0 %	50 %	0 %	11496937
51	NC_001857	AT	3	6	39796	39801	50 %	50 %	0 %	0 %	11496938
52	NC_001857	CT	3	6	39889	39894	0 %	50 %	0 %	50 %	11496905
53	NC_001857	TG	3	6	40705	40710	0 %	50 %	50 %	0 %	11496906
54	NC_001857	TC	3	6	43068	43073	0 %	50 %	0 %	50 %	365823352
55	NC_001857	AG	3	6	43459	43464	50 %	0 %	50 %	0 %	365823352
56	NC_001857	GT	3	6	45176	45181	0 %	50 %	50 %	0 %	11496923
57	NC_001857	TC	3	6	50484	50489	0 %	50 %	0 %	50 %	11496924
58	NC_001857	GT	3	6	50645	50650	0 %	50 %	50 %	0 %	11496924
59	NC_001857	AG	3	6	52810	52815	50 %	0 %	50 %	0 %	11496909
60	NC_001857	CA	3	6	52865	52870	50 %	0 %	0 %	50 %	11496909
61	NC_001857	AG	3	6	52991	52996	50 %	0 %	50 %	0 %	11496909
62	NC_001857	TA	3	6	53190	53195	50 %	50 %	0 %	0 %	11496909

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.