MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	AAAAAT	2	12	391	402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001856	TAGGAA	2	12	1810	1821	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001856	TTTTCA	2	12	2311	2322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_001856	TAAAAA	2	12	2620	2631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001856	AAAATA	2	12	4267	4278	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001856	TATAAA	2	12	4441	4452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001856	TTTATT	2	12	6121	6132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	11496832
8	NC_001856	CAAATT	2	12	6222	6233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11496832
9	NC_001856	ATCAGA	3	18	6589	6606	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11496832
10	NC_001856	ATTCTG	2	12	6615	6626	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11496832
11	NC_001856	TAATTT	2	12	9913	9924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001856	ATTTTC	2	12	10020	10031	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_001856	TAAAAC	2	12	11481	11492	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496835
14	NC_001856	TAAATT	2	12	12059	12070	50 %	50 %	0 %	0 %	11496836
15	NC_001856	ACTATT	2	12	14206	14217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_001856	ATAAAA	2	12	15275	15286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	364556753
17	NC_001856	TTTTTA	2	12	18223	18234	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	364556749
18	NC_001856	GTCTTC	2	12	18885	18896	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	364556749
19	NC_001856	CAAAGG	2	12	19760	19771	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	11496838
20	NC_001856	GATAAT	2	12	23747	23758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11496853
21	NC_001856	CTATTA	2	12	24501	24512	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_001856	AAATGT	2	12	24758	24769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001856	TATCTC	2	12	27777	27788	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11496858
24	NC_001856	CTTTTC	2	12	28040	28051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496858
25	NC_001856	GTTTAA	2	12	30335	30346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11496839
26	NC_001856	GATAAT	2	12	32877	32888	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11496875
27	NC_001856	CTATTA	2	12	33632	33643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_001856	CTTTAT	2	12	36651	36662	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_001856	TAAATA	2	12	36876	36887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001856	ATCACC	2	12	37527	37538	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_001856	CAGTAT	2	12	38236	38247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.