MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	TTTATT	2	12	6121	6132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	11496832
2	NC_001856	CAAATT	2	12	6222	6233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11496832
3	NC_001856	ATCAGA	3	18	6589	6606	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11496832
4	NC_001856	ATTCTG	2	12	6615	6626	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11496832
5	NC_001856	TAAAAC	2	12	11481	11492	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496835
6	NC_001856	TAAATT	2	12	12059	12070	50 %	50 %	0 %	0 %	11496836
7	NC_001856	ATAAAA	2	12	15275	15286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	364556753
8	NC_001856	TTTTTA	2	12	18223	18234	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	364556749
9	NC_001856	GTCTTC	2	12	18885	18896	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	364556749
10	NC_001856	CAAAGG	2	12	19760	19771	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	11496838
11	NC_001856	GATAAT	2	12	23747	23758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11496853
12	NC_001856	TATCTC	2	12	27777	27788	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	11496858
13	NC_001856	CTTTTC	2	12	28040	28051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496858
14	NC_001856	GTTTAA	2	12	30335	30346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11496839
15	NC_001856	GATAAT	2	12	32877	32888	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11496875

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.