MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	AGTGG	2	10	141	150	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001856	ATTAT	2	10	455	464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001856	CAAAA	2	10	868	877	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_001856	GTTAT	2	10	1213	1222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001856	AGCAA	2	10	1363	1372	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_001856	AAAAC	2	10	2334	2343	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_001856	AAAAT	2	10	2456	2465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001856	TCTTT	2	10	3069	3078	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_001856	TAATA	2	10	3995	4004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001856	AGAGG	2	10	4223	4232	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001856	AATTA	2	10	8153	8162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001856	CTTTT	2	10	9348	9357	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_001856	ATATA	2	10	9815	9824	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001856	CTTAA	2	10	13754	13763	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_001856	AATTT	2	10	15839	15848	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001856	TTGTT	2	10	16079	16088	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001856	AATTT	2	10	18183	18192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001856	TATAT	2	10	23022	23031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001856	TAAAT	2	10	24872	24881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001856	GAGAG	2	10	26870	26879	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001856	TGTTT	2	10	26899	26908	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001856	ATTTT	2	10	26982	26991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001856	ATTTA	2	10	29681	29690	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001856	AATTT	2	10	29788	29797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001856	AATTT	2	10	30878	30887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001856	ATATT	2	10	32153	32162	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001856	TGCCT	2	10	34260	34269	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_001856	TAAAA	2	10	34881	34890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001856	GACTT	2	10	36314	36323	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_001856	GTTTA	2	10	36703	36712	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001856	ATTTA	2	10	37034	37043	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.