MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	ATAAA	2	10	5162	5171	80 %	20 %	0 %	0 %	11496844
2	NC_001856	TTAAT	2	10	6381	6390	40 %	60 %	0 %	0 %	11496832
3	NC_001856	ATAAA	2	10	6732	6741	80 %	20 %	0 %	0 %	11496832
4	NC_001856	ATTTT	2	10	12626	12635	20 %	80 %	0 %	0 %	11496837
5	NC_001856	TTAAT	2	10	16926	16935	40 %	60 %	0 %	0 %	364556748
6	NC_001856	AACAA	2	10	17280	17289	80 %	0 %	0 %	20 %	364556748
7	NC_001856	TGATT	2	10	17681	17690	20 %	60 %	20 %	0 %	11496868
8	NC_001856	ATTTT	2	10	18365	18374	20 %	80 %	0 %	0 %	364556749
9	NC_001856	ATCAT	2	10	18657	18666	40 %	40 %	0 %	20 %	364556749
10	NC_001856	TCAAC	2	10	19515	19524	40 %	20 %	0 %	40 %	11496838
11	NC_001856	TAGAA	2	10	19960	19969	60 %	20 %	20 %	0 %	11496838
12	NC_001856	ATATA	2	10	21121	21130	60 %	40 %	0 %	0 %	364556750
13	NC_001856	AGCAA	2	10	21183	21192	60 %	0 %	20 %	20 %	364556750
14	NC_001856	CAAAA	2	10	22069	22078	80 %	0 %	0 %	20 %	364556746
15	NC_001856	ATTTT	2	10	22275	22284	20 %	80 %	0 %	0 %	364556746
16	NC_001856	AAGAC	2	10	22624	22633	60 %	0 %	20 %	20 %	364556746
17	NC_001856	ATATT	2	10	22696	22705	40 %	60 %	0 %	0 %	364556746
18	NC_001856	AGATA	2	10	23704	23713	60 %	20 %	20 %	0 %	11496853
19	NC_001856	TTTTC	2	10	25707	25716	0 %	80 %	0 %	20 %	11496856
20	NC_001856	TTTCT	2	10	27353	27362	0 %	80 %	0 %	20 %	11496858
21	NC_001856	ATTTA	2	10	27751	27760	40 %	60 %	0 %	0 %	11496858
22	NC_001856	GTTTT	2	10	30043	30052	0 %	80 %	20 %	0 %	11496839
23	NC_001856	TTTGA	2	10	30481	30490	20 %	60 %	20 %	0 %	11496839
24	NC_001856	GTTTT	2	10	30622	30631	0 %	80 %	20 %	0 %	11496839
25	NC_001856	ATTTA	2	10	30749	30758	40 %	60 %	0 %	0 %	11496839
26	NC_001856	GTTTT	2	10	31133	31142	0 %	80 %	20 %	0 %	11496872
27	NC_001856	ATTTT	2	10	31405	31414	20 %	80 %	0 %	0 %	11496873
28	NC_001856	AAGAC	2	10	31754	31763	60 %	0 %	20 %	20 %	11496873
29	NC_001856	ATATT	2	10	31826	31835	40 %	60 %	0 %	0 %	11496873
30	NC_001856	ATTTA	2	10	35107	35116	40 %	60 %	0 %	0 %	11496877
31	NC_001856	TAATA	2	10	35551	35560	60 %	40 %	0 %	0 %	11496877

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.