MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	ACCA	2	8	4899	4906	50 %	0 %	0 %	50 %	11496844
2	NC_001856	GTAT	2	8	5048	5055	25 %	50 %	25 %	0 %	11496844
3	NC_001856	CTTT	2	8	5270	5277	0 %	75 %	0 %	25 %	11496844
4	NC_001856	TAAA	2	8	5369	5376	75 %	25 %	0 %	0 %	11496844
5	NC_001856	TAAA	3	12	6860	6871	75 %	25 %	0 %	0 %	11496832
6	NC_001856	CTTT	2	8	11992	11999	0 %	75 %	0 %	25 %	11496836
7	NC_001856	CCAT	2	8	12144	12151	25 %	25 %	0 %	50 %	11496836
8	NC_001856	TAAA	2	8	12197	12204	75 %	25 %	0 %	0 %	11496836
9	NC_001856	TTCT	2	8	12350	12357	0 %	75 %	0 %	25 %	11496836
10	NC_001856	TTTA	2	8	12366	12373	25 %	75 %	0 %	0 %	11496836
11	NC_001856	TAAT	2	8	13340	13347	50 %	50 %	0 %	0 %	11496837
12	NC_001856	ATTT	2	8	15317	15324	25 %	75 %	0 %	0 %	364556753
13	NC_001856	GAAG	2	8	16787	16794	50 %	0 %	50 %	0 %	364556748
14	NC_001856	AAGC	2	8	16966	16973	50 %	0 %	25 %	25 %	364556748
15	NC_001856	AAAG	2	8	17207	17214	75 %	0 %	25 %	0 %	364556748
16	NC_001856	CTTA	2	8	17650	17657	25 %	50 %	0 %	25 %	11496868
17	NC_001856	TTCT	2	8	18155	18162	0 %	75 %	0 %	25 %	11496868
18	NC_001856	GCTT	2	8	18459	18466	0 %	50 %	25 %	25 %	364556749
19	NC_001856	GGTT	2	8	18561	18568	0 %	50 %	50 %	0 %	364556749
20	NC_001856	TCTT	2	8	18748	18755	0 %	75 %	0 %	25 %	364556749
21	NC_001856	ATTT	2	8	19052	19059	25 %	75 %	0 %	0 %	364556749
22	NC_001856	AATG	2	8	19537	19544	50 %	25 %	25 %	0 %	11496838
23	NC_001856	GAAA	2	8	20174	20181	75 %	0 %	25 %	0 %	364556750
24	NC_001856	ATAG	2	8	20262	20269	50 %	25 %	25 %	0 %	364556750
25	NC_001856	TATT	2	8	20857	20864	25 %	75 %	0 %	0 %	364556750
26	NC_001856	AATG	2	8	21215	21222	50 %	25 %	25 %	0 %	364556750
27	NC_001856	TCAA	2	8	21651	21658	50 %	25 %	0 %	25 %	364556745
28	NC_001856	TAGG	2	8	22290	22297	25 %	25 %	50 %	0 %	364556746
29	NC_001856	AAAG	2	8	22430	22437	75 %	0 %	25 %	0 %	364556746
30	NC_001856	TAAG	2	8	23448	23455	50 %	25 %	25 %	0 %	11496853
31	NC_001856	AAAT	2	8	23733	23740	75 %	25 %	0 %	0 %	11496853
32	NC_001856	AAAG	2	8	23785	23792	75 %	0 %	25 %	0 %	11496853
33	NC_001856	GCTT	2	8	24067	24074	0 %	50 %	25 %	25 %	11496853
34	NC_001856	TTAT	3	12	25333	25344	25 %	75 %	0 %	0 %	11496856
35	NC_001856	AGAA	2	8	25670	25677	75 %	0 %	25 %	0 %	11496856
36	NC_001856	GCTT	2	8	27221	27228	0 %	50 %	25 %	25 %	11496858
37	NC_001856	GGCT	2	8	27285	27292	0 %	25 %	50 %	25 %	11496858
38	NC_001856	AGCA	2	8	27820	27827	50 %	0 %	25 %	25 %	11496858
39	NC_001856	TTGT	2	8	27886	27893	0 %	75 %	25 %	0 %	11496858
40	NC_001856	TTAG	2	8	31419	31426	25 %	50 %	25 %	0 %	11496873
41	NC_001856	AAAG	2	8	31560	31567	75 %	0 %	25 %	0 %	11496873
42	NC_001856	TAAG	2	8	32578	32585	50 %	25 %	25 %	0 %	11496875
43	NC_001856	AAAT	2	8	32863	32870	75 %	25 %	0 %	0 %	11496875
44	NC_001856	AAAG	2	8	32915	32922	75 %	0 %	25 %	0 %	11496875
45	NC_001856	GCTT	2	8	33197	33204	0 %	50 %	25 %	25 %	11496875
46	NC_001856	TAAA	2	8	35037	35044	75 %	25 %	0 %	0 %	11496877
47	NC_001856	CTAT	2	8	35435	35442	25 %	50 %	0 %	25 %	11496877
48	NC_001856	CAAA	2	8	35504	35511	75 %	0 %	0 %	25 %	11496877
49	NC_001856	TTGT	2	8	35975	35982	0 %	75 %	25 %	0 %	364556751
50	NC_001856	TAAA	2	8	35998	36005	75 %	25 %	0 %	0 %	364556751
51	NC_001856	AATA	2	8	36163	36170	75 %	25 %	0 %	0 %	364556751
52	NC_001856	TAGC	2	8	36201	36208	25 %	25 %	25 %	25 %	364556751

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.