MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp38

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001856	TC	3	6	273	278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_001856	TA	3	6	1080	1085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001856	AT	3	6	2156	2161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001856	TA	3	6	2766	2771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001856	TA	3	6	2890	2895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001856	TA	3	6	3453	3458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001856	AT	3	6	3793	3798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001856	AT	3	6	4489	4494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001856	AT	4	8	4525	4532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001856	TA	3	6	4583	4588	50 %	50 %	0 %	0 %	11496844
11	NC_001856	AT	3	6	5524	5529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001856	CT	3	6	5558	5563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_001856	AT	3	6	5597	5602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001856	TA	3	6	5772	5777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001856	TA	3	6	7026	7031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001856	AT	3	6	7612	7617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001856	TA	4	8	7781	7788	50 %	50 %	0 %	0 %	11496846
18	NC_001856	TA	3	6	8178	8183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001856	AT	3	6	8323	8328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001856	TA	3	6	8883	8888	50 %	50 %	0 %	0 %	11496848
21	NC_001856	AT	3	6	9487	9492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001856	TA	3	6	9746	9751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001856	AT	3	6	9875	9880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001856	AT	4	8	9885	9892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001856	TA	4	8	10387	10394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001856	TC	3	6	10564	10569	0 %	50 %	0 %	50 %	11496834
27	NC_001856	TA	3	6	10631	10636	50 %	50 %	0 %	0 %	11496834
28	NC_001856	TA	3	6	10892	10897	50 %	50 %	0 %	0 %	11496834
29	NC_001856	TA	3	6	11275	11280	50 %	50 %	0 %	0 %	11496835
30	NC_001856	TA	3	6	11295	11300	50 %	50 %	0 %	0 %	11496835
31	NC_001856	TA	3	6	11891	11896	50 %	50 %	0 %	0 %	11496836
32	NC_001856	TA	3	6	11933	11938	50 %	50 %	0 %	0 %	11496836
33	NC_001856	AT	3	6	12306	12311	50 %	50 %	0 %	0 %	11496836
34	NC_001856	TA	4	8	12915	12922	50 %	50 %	0 %	0 %	11496837
35	NC_001856	TA	4	8	12937	12944	50 %	50 %	0 %	0 %	11496837
36	NC_001856	TA	4	8	13071	13078	50 %	50 %	0 %	0 %	11496837
37	NC_001856	TA	3	6	13296	13301	50 %	50 %	0 %	0 %	11496837
38	NC_001856	AT	3	6	13539	13544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001856	TA	3	6	13962	13967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001856	AT	3	6	14012	14017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001856	AT	3	6	14046	14051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001856	AT	3	6	14180	14185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001856	TA	3	6	14269	14274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001856	AT	3	6	14765	14770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001856	TA	3	6	15116	15121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001856	AT	3	6	15346	15351	50 %	50 %	0 %	0 %	364556753
47	NC_001856	AT	3	6	15919	15924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001856	GT	3	6	15942	15947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001856	GA	3	6	16522	16527	50 %	0 %	50 %	0 %	364556748
50	NC_001856	TA	5	10	16673	16682	50 %	50 %	0 %	0 %	364556748
51	NC_001856	AT	3	6	17166	17171	50 %	50 %	0 %	0 %	364556748
52	NC_001856	AT	3	6	17221	17226	50 %	50 %	0 %	0 %	364556748
53	NC_001856	TA	4	8	17455	17462	50 %	50 %	0 %	0 %	11496868
54	NC_001856	TG	3	6	17638	17643	0 %	50 %	50 %	0 %	11496868
55	NC_001856	TA	3	6	17911	17916	50 %	50 %	0 %	0 %	11496868
56	NC_001856	AT	3	6	19744	19749	50 %	50 %	0 %	0 %	11496838
57	NC_001856	GT	3	6	19999	20004	0 %	50 %	50 %	0 %	11496838
58	NC_001856	AT	3	6	20105	20110	50 %	50 %	0 %	0 %	364556750
59	NC_001856	AG	3	6	20121	20126	50 %	0 %	50 %	0 %	364556750
60	NC_001856	AG	3	6	20907	20912	50 %	0 %	50 %	0 %	364556750
61	NC_001856	CT	3	6	20960	20965	0 %	50 %	0 %	50 %	364556750
62	NC_001856	AT	3	6	21670	21675	50 %	50 %	0 %	0 %	364556745
63	NC_001856	TA	3	6	21937	21942	50 %	50 %	0 %	0 %	364556745
64	NC_001856	AT	3	6	22923	22928	50 %	50 %	0 %	0 %	364556746
65	NC_001856	AG	3	6	23271	23276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001856	AT	3	6	23294	23299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001856	AT	3	6	24078	24083	50 %	50 %	0 %	0 %	11496853
68	NC_001856	TA	3	6	24106	24111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001856	TA	3	6	24129	24134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001856	CT	3	6	24464	24469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_001856	AT	3	6	24629	24634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001856	AT	3	6	24921	24926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001856	AT	3	6	24988	24993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001856	TG	3	6	25180	25185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001856	TC	3	6	26287	26292	0 %	50 %	0 %	50 %	11496856
76	NC_001856	TA	3	6	26465	26470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001856	AT	3	6	26475	26480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001856	AT	3	6	26581	26586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001856	AT	3	6	26612	26617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001856	AT	3	6	26619	26624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001856	CA	3	6	27021	27026	50 %	0 %	0 %	50 %	11496858
82	NC_001856	AT	3	6	28032	28037	50 %	50 %	0 %	0 %	11496858
83	NC_001856	AG	3	6	28135	28140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001856	TA	3	6	29103	29108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001856	TA	3	6	29714	29719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001856	AT	3	6	32053	32058	50 %	50 %	0 %	0 %	11496873
87	NC_001856	AG	3	6	32401	32406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001856	AT	3	6	32424	32429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001856	TA	3	6	33259	33264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001856	AT	4	8	33797	33804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001856	TA	3	6	33821	33826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001856	CA	3	6	34603	34608	50 %	0 %	0 %	50 %	11496876
93	NC_001856	TA	3	6	34688	34693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001856	AT	3	6	34708	34713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001856	TA	3	6	34785	34790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001856	TA	5	10	36282	36291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001856	AT	3	6	36523	36528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001856	AT	3	6	37207	37212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001856	TA	3	6	38588	38593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001856	AT	3	6	38606	38611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.