MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp36

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001855	TTTTCT	2	12	1382	1393	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_001855	ATTTTC	2	12	2986	2997	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_001855	ATTTTG	2	12	4906	4917	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001855	TTCTTT	2	12	6837	6848	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_001855	TTAATA	2	12	8925	8936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001855	CATATA	2	12	10454	10465	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11496787
7	NC_001855	TCTTAA	2	12	12285	12296	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_001855	GTTTAT	2	12	12627	12638	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	11496820
9	NC_001855	AAAAGA	2	12	12781	12792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	11496820
10	NC_001855	CAAGAG	2	12	13142	13153	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	11496820
11	NC_001855	AATCAA	2	12	13954	13965	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11496789
12	NC_001855	TAAAAA	2	12	16814	16825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	11496791
13	NC_001855	TAAACA	2	12	17868	17879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_001855	TCAAAA	2	12	19910	19921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_001855	AAAGGT	2	12	20557	20568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11496782
16	NC_001855	AGAGGA	2	12	20934	20945	50 %	0 %	50 %	0 %	11496782
17	NC_001855	AATTTA	2	12	22032	22043	50 %	50 %	0 %	0 %	11496814
18	NC_001855	TTTTAA	2	12	23835	23846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001855	TAAGGT	2	12	24102	24113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556724
20	NC_001855	TAATGA	2	12	24914	24925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001855	AATACT	2	12	24943	24954	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_001855	AGTGTA	2	12	25663	25674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001855	TATTTT	2	12	30316	30327	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	11496830
24	NC_001855	TAATGC	2	12	30341	30352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11496830
25	NC_001855	TTTTAC	2	12	30707	30718	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_001855	TATTTT	2	12	32675	32686	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	11496817
27	NC_001855	TAATGC	2	12	32700	32711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11496817
28	NC_001855	TTTTAC	2	12	33069	33080	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.