MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp36

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001855	AGATA	2	10	727	736	60 %	20 %	20 %	0 %	11496795
2	NC_001855	TAAAT	2	10	1139	1148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001855	TTTGA	2	10	2143	2152	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001855	TAAGT	2	10	2444	2453	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001855	ATATT	2	10	3370	3379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001855	ATTGA	2	10	4173	4182	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001855	TAAAC	2	10	4185	4194	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_001855	TAAGC	2	10	8026	8035	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_001855	TTCTT	2	10	10471	10480	0 %	80 %	0 %	20 %	11496787
10	NC_001855	TGTTT	2	10	11043	11052	0 %	80 %	20 %	0 %	11496787
11	NC_001855	TTAAT	2	10	11091	11100	40 %	60 %	0 %	0 %	11496787
12	NC_001855	ATTTA	2	10	12188	12197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001855	ATTTT	2	10	12484	12493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001855	ATTAA	2	10	12581	12590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001855	ACACT	2	10	12765	12774	40 %	20 %	0 %	40 %	11496820
16	NC_001855	GAAAA	2	10	13215	13224	80 %	0 %	20 %	0 %	11496820
17	NC_001855	AATAA	2	10	13257	13266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001855	ATTTT	2	10	14082	14091	20 %	80 %	0 %	0 %	11496789
19	NC_001855	ATTGA	2	10	14407	14416	40 %	40 %	20 %	0 %	11496790
20	NC_001855	TATTT	2	10	14588	14597	20 %	80 %	0 %	0 %	11496790
21	NC_001855	AGAAT	2	10	15965	15974	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001855	TCTTT	2	10	17153	17162	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_001855	AAGAA	2	10	17954	17963	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001855	TTTAT	2	10	18475	18484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001855	AAGAA	2	10	18498	18507	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001855	GTAAT	2	10	18524	18533	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001855	TTTAT	2	10	19574	19583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001855	TTAGT	2	10	20262	20271	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001855	ATGAA	2	10	20465	20474	60 %	20 %	20 %	0 %	11496782
30	NC_001855	AGAAA	2	10	20731	20740	80 %	0 %	20 %	0 %	11496782
31	NC_001855	TACTA	2	10	21949	21958	40 %	40 %	0 %	20 %	11496814
32	NC_001855	ATTAT	2	10	22814	22823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001855	TTATT	2	10	23914	23923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001855	TCTAT	2	10	24731	24740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_001855	GATAA	2	10	25915	25924	60 %	20 %	20 %	0 %	364556722
36	NC_001855	ATCTT	2	10	26102	26111	20 %	60 %	0 %	20 %	364556722
37	NC_001855	CTTTT	2	10	26419	26428	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_001855	GGACG	2	10	27194	27203	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_001855	ACTTT	2	10	27804	27813	20 %	60 %	0 %	20 %	364556721
40	NC_001855	TTATT	2	10	27856	27865	20 %	80 %	0 %	0 %	364556721
41	NC_001855	TGTTT	2	10	29002	29011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001855	ATAAA	2	10	29182	29191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001855	CAAAC	2	10	29316	29325	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_001855	AGTAG	2	10	29341	29350	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001855	TATAA	2	10	30538	30547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001855	CTAGG	2	10	31075	31084	20 %	20 %	40 %	20 %	11496794
47	NC_001855	AAAAT	2	10	31543	31552	80 %	20 %	0 %	0 %	11496794
48	NC_001855	TTTCT	2	10	31850	31859	0 %	80 %	0 %	20 %	11496817
49	NC_001855	TTAGA	2	10	32177	32186	40 %	40 %	20 %	0 %	11496817
50	NC_001855	TATAA	2	10	32897	32906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001855	CTTTT	2	10	33314	33323	0 %	80 %	0 %	20 %	11496783
52	NC_001855	TTATC	2	10	33521	33530	20 %	60 %	0 %	20 %	11496783
53	NC_001855	TACTT	2	10	33771	33780	20 %	60 %	0 %	20 %	11496783
54	NC_001855	AATAA	2	10	35389	35398	80 %	20 %	0 %	0 %	11496784
55	NC_001855	TAAAA	2	10	36608	36617	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001855	TAAAC	2	10	36650	36659	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.