MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp36

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001855	TAAAT	2	10	1139	1148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001855	TTTGA	2	10	2143	2152	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001855	TAAGT	2	10	2444	2453	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001855	ATATT	2	10	3370	3379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001855	ATTGA	2	10	4173	4182	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001855	TAAAC	2	10	4185	4194	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_001855	TAAGC	2	10	8026	8035	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_001855	ATTTA	2	10	12188	12197	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001855	ATTTT	2	10	12484	12493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001855	ATTAA	2	10	12581	12590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001855	AATAA	2	10	13257	13266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001855	AGAAT	2	10	15965	15974	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001855	TCTTT	2	10	17153	17162	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_001855	AAGAA	2	10	17954	17963	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001855	TTTAT	2	10	18475	18484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001855	AAGAA	2	10	18498	18507	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001855	GTAAT	2	10	18524	18533	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001855	TTTAT	2	10	19574	19583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001855	TTAGT	2	10	20262	20271	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001855	ATTAT	2	10	22814	22823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001855	TTATT	2	10	23914	23923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001855	TCTAT	2	10	24731	24740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_001855	CTTTT	2	10	26419	26428	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_001855	GGACG	2	10	27194	27203	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_001855	TGTTT	2	10	29002	29011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001855	ATAAA	2	10	29182	29191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001855	CAAAC	2	10	29316	29325	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_001855	AGTAG	2	10	29341	29350	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001855	TATAA	2	10	30538	30547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001855	TATAA	2	10	32897	32906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001855	TAAAA	2	10	36608	36617	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001855	TAAAC	2	10	36650	36659	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.