MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp36

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001855	TTTA	2	8	82	89	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001855	GTTT	2	8	198	205	0 %	75 %	25 %	0 %	11496795
3	NC_001855	TAAT	2	8	405	412	50 %	50 %	0 %	0 %	11496795
4	NC_001855	AATT	2	8	603	610	50 %	50 %	0 %	0 %	11496795
5	NC_001855	AGAT	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	11496795
6	NC_001855	TGAT	2	8	804	811	25 %	50 %	25 %	0 %	11496795
7	NC_001855	CTTT	2	8	840	847	0 %	75 %	0 %	25 %	11496795
8	NC_001855	AAAT	2	8	1123	1130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001855	CTTT	2	8	1892	1899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_001855	TTTC	2	8	2214	2221	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_001855	ATTA	2	8	2884	2891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001855	TTAA	2	8	2951	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001855	TAAT	2	8	3050	3057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001855	TTTC	2	8	3623	3630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_001855	AATA	2	8	3718	3725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001855	AAAT	2	8	3900	3907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001855	CAAA	2	8	3970	3977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_001855	TATT	2	8	4247	4254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001855	GATT	2	8	4568	4575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001855	ATTC	2	8	4818	4825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_001855	TATT	2	8	4860	4867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001855	CAAA	2	8	5030	5037	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_001855	CTCA	2	8	5345	5352	25 %	25 %	0 %	50 %	11496801
24	NC_001855	ATTA	2	8	5675	5682	50 %	50 %	0 %	0 %	11496801
25	NC_001855	TAAT	2	8	6644	6651	50 %	50 %	0 %	0 %	11496803
26	NC_001855	AAAG	2	8	6725	6732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001855	TAAG	2	8	6777	6784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001855	TATT	2	8	6884	6891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001855	TAAA	2	8	6918	6925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001855	TAAT	2	8	7693	7700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001855	AATA	2	8	8060	8067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001855	TAAT	2	8	8421	8428	50 %	50 %	0 %	0 %	364556720
33	NC_001855	ATTT	2	8	8906	8913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001855	TTTA	2	8	9244	9251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001855	ATTT	2	8	9288	9295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001855	TAAA	2	8	9314	9321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001855	ATAA	2	8	9406	9413	75 %	25 %	0 %	0 %	11496781
38	NC_001855	TAAA	2	8	9911	9918	75 %	25 %	0 %	0 %	11496781
39	NC_001855	GCTA	2	8	10093	10100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_001855	TATT	2	8	10121	10128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001855	ATAA	2	8	10294	10301	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
42	NC_001855	ATTT	2	8	10305	10312	25 %	75 %	0 %	0 %	11496787
43	NC_001855	ATAA	2	8	10589	10596	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
44	NC_001855	TAAA	2	8	10788	10795	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
45	NC_001855	GAAG	2	8	10964	10971	50 %	0 %	50 %	0 %	11496787
46	NC_001855	GCAT	2	8	11153	11160	25 %	25 %	25 %	25 %	11496787
47	NC_001855	ATAA	2	8	11255	11262	75 %	25 %	0 %	0 %	11496787
48	NC_001855	TGAT	2	8	11448	11455	25 %	50 %	25 %	0 %	11496787
49	NC_001855	ATAA	2	8	12149	12156	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001855	AATA	2	8	12234	12241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001855	TTGT	2	8	12272	12279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001855	ATTA	2	8	12304	12311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001855	AAAT	2	8	12383	12390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001855	ATTA	2	8	12508	12515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001855	TAAA	2	8	12567	12574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001855	TAGA	2	8	13158	13165	50 %	25 %	25 %	0 %	11496820
57	NC_001855	TAAT	2	8	13471	13478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001855	TTTC	2	8	13621	13628	0 %	75 %	0 %	25 %	11496789
59	NC_001855	AAAT	2	8	14068	14075	75 %	25 %	0 %	0 %	11496789
60	NC_001855	ATCA	2	8	14201	14208	50 %	25 %	0 %	25 %	11496789
61	NC_001855	ATTT	2	8	14325	14332	25 %	75 %	0 %	0 %	11496789
62	NC_001855	AAAT	2	8	14626	14633	75 %	25 %	0 %	0 %	11496790
63	NC_001855	AAGT	2	8	14673	14680	50 %	25 %	25 %	0 %	11496790
64	NC_001855	TTTG	2	8	14695	14702	0 %	75 %	25 %	0 %	11496790
65	NC_001855	ACTA	2	8	14713	14720	50 %	25 %	0 %	25 %	11496790
66	NC_001855	CTTT	2	8	15277	15284	0 %	75 %	0 %	25 %	11496822
67	NC_001855	TCTT	2	8	15303	15310	0 %	75 %	0 %	25 %	11496822
68	NC_001855	TTTA	2	8	15644	15651	25 %	75 %	0 %	0 %	11496822
69	NC_001855	AATA	2	8	15975	15982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001855	GAAA	2	8	16283	16290	75 %	0 %	25 %	0 %	11496791
71	NC_001855	AAAT	2	8	16681	16688	75 %	25 %	0 %	0 %	11496791
72	NC_001855	ACAA	2	8	16704	16711	75 %	0 %	0 %	25 %	11496791
73	NC_001855	AATA	2	8	16878	16885	75 %	25 %	0 %	0 %	11496791
74	NC_001855	TTAA	2	8	16914	16921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001855	TAAT	2	8	17079	17086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001855	TATT	2	8	17252	17259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001855	ATTT	2	8	17349	17356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001855	TAAT	2	8	17662	17669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001855	CTTA	2	8	18236	18243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_001855	TACA	2	8	19240	19247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_001855	TTTA	2	8	19308	19315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001855	ACTC	2	8	19352	19359	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_001855	TCCT	2	8	19693	19700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_001855	TTTA	2	8	20127	20134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001855	AAAG	2	8	20220	20227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001855	ATAA	2	8	20245	20252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001855	AGAA	2	8	20578	20585	75 %	0 %	25 %	0 %	11496782
88	NC_001855	AAGT	2	8	21230	21237	50 %	25 %	25 %	0 %	11496782
89	NC_001855	AGTA	2	8	21662	21669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001855	ATTT	2	8	21974	21981	25 %	75 %	0 %	0 %	11496814
91	NC_001855	AATA	2	8	22885	22892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001855	TATT	2	8	23033	23040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001855	CTTT	2	8	23218	23225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_001855	AAGC	2	8	23448	23455	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_001855	CTGC	2	8	23648	23655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_001855	TAAG	2	8	23771	23778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001855	ACTT	2	8	23811	23818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_001855	AAGT	2	8	23827	23834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001855	AAAG	2	8	24323	24330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001855	TTAT	2	8	24654	24661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001855	GAAT	2	8	24670	24677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001855	AATA	2	8	24874	24881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001855	AGAA	2	8	24967	24974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001855	TCTG	2	8	26069	26076	0 %	50 %	25 %	25 %	364556722
105	NC_001855	ATAA	2	8	26146	26153	75 %	25 %	0 %	0 %	364556722
106	NC_001855	CTTT	2	8	26328	26335	0 %	75 %	0 %	25 %	364556722
107	NC_001855	GCTT	2	8	26646	26653	0 %	50 %	25 %	25 %	11496827
108	NC_001855	AGAA	2	8	27155	27162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001855	TTAT	2	8	27340	27347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001855	AAGT	2	8	27348	27355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001855	TTTA	2	8	27419	27426	25 %	75 %	0 %	0 %	364556721
112	NC_001855	CTTT	2	8	28047	28054	0 %	75 %	0 %	25 %	364556721
113	NC_001855	TTTA	2	8	28412	28419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001855	AAGC	2	8	28796	28803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_001855	ATCT	2	8	29211	29218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_001855	ATGC	2	8	29559	29566	25 %	25 %	25 %	25 %	11496830
117	NC_001855	TTGC	2	8	29740	29747	0 %	50 %	25 %	25 %	11496830
118	NC_001855	ATTT	2	8	30091	30098	25 %	75 %	0 %	0 %	11496830
119	NC_001855	TAAG	2	8	31156	31163	50 %	25 %	25 %	0 %	11496794
120	NC_001855	GCTT	2	8	31181	31188	0 %	50 %	25 %	25 %	11496794
121	NC_001855	TGTA	2	8	31501	31508	25 %	50 %	25 %	0 %	11496794
122	NC_001855	AATA	2	8	31559	31566	75 %	25 %	0 %	0 %	11496794
123	NC_001855	ATTA	2	8	31571	31578	50 %	50 %	0 %	0 %	11496794
124	NC_001855	TTGC	2	8	32087	32094	0 %	50 %	25 %	25 %	11496817
125	NC_001855	ATTT	2	8	32450	32457	25 %	75 %	0 %	0 %	11496817
126	NC_001855	TAAA	2	8	33016	33023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001855	CTTT	2	8	33763	33770	0 %	75 %	0 %	25 %	11496783
128	NC_001855	CTTT	2	8	33817	33824	0 %	75 %	0 %	25 %	11496783
129	NC_001855	ATTT	2	8	33992	33999	25 %	75 %	0 %	0 %	11496783
130	NC_001855	AGAT	2	8	34172	34179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001855	TAAA	2	8	34212	34219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001855	ATAA	2	8	34244	34251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001855	ATTT	2	8	34252	34259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001855	TATT	2	8	34539	34546	25 %	75 %	0 %	0 %	364556725
135	NC_001855	TCAT	2	8	34595	34602	25 %	50 %	0 %	25 %	11496784
136	NC_001855	AATT	2	8	34867	34874	50 %	50 %	0 %	0 %	11496784
137	NC_001855	TATT	2	8	34939	34946	25 %	75 %	0 %	0 %	11496784
138	NC_001855	AAAG	2	8	35244	35251	75 %	0 %	25 %	0 %	11496784
139	NC_001855	TTTC	2	8	35465	35472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_001855	ATCT	2	8	35766	35773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_001855	AGGT	2	8	35849	35856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_001855	TTGG	2	8	35877	35884	0 %	50 %	50 %	0 %	11496785
143	NC_001855	AGTG	2	8	36122	36129	25 %	25 %	50 %	0 %	11496785
144	NC_001855	TTCT	2	8	36156	36163	0 %	75 %	0 %	25 %	11496785
145	NC_001855	GTTT	2	8	36492	36499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.