MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp36

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001855	TTTA	2	8	82	89	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001855	AAAT	2	8	1123	1130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001855	CTTT	2	8	1892	1899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_001855	TTTC	2	8	2214	2221	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_001855	ATTA	2	8	2884	2891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001855	TTAA	2	8	2951	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001855	TAAT	2	8	3050	3057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001855	TTTC	2	8	3623	3630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_001855	AATA	2	8	3718	3725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001855	AAAT	2	8	3900	3907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001855	CAAA	2	8	3970	3977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_001855	TATT	2	8	4247	4254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001855	GATT	2	8	4568	4575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001855	ATTC	2	8	4818	4825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_001855	TATT	2	8	4860	4867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001855	CAAA	2	8	5030	5037	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_001855	AAAG	2	8	6725	6732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001855	TAAG	2	8	6777	6784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001855	TATT	2	8	6884	6891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001855	TAAA	2	8	6918	6925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001855	TAAT	2	8	7693	7700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001855	AATA	2	8	8060	8067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001855	ATTT	2	8	8906	8913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001855	TTTA	2	8	9244	9251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001855	ATTT	2	8	9288	9295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001855	TAAA	2	8	9314	9321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001855	GCTA	2	8	10093	10100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_001855	TATT	2	8	10121	10128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001855	ATAA	2	8	12149	12156	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001855	AATA	2	8	12234	12241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001855	TTGT	2	8	12272	12279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001855	ATTA	2	8	12304	12311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001855	AAAT	2	8	12383	12390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001855	ATTA	2	8	12508	12515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001855	TAAA	2	8	12567	12574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001855	TAAT	2	8	13471	13478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001855	AATA	2	8	15975	15982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001855	TTAA	2	8	16914	16921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001855	TAAT	2	8	17079	17086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001855	TATT	2	8	17252	17259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001855	ATTT	2	8	17349	17356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001855	TAAT	2	8	17662	17669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001855	CTTA	2	8	18236	18243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_001855	TACA	2	8	19240	19247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_001855	TTTA	2	8	19308	19315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001855	ACTC	2	8	19352	19359	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_001855	TCCT	2	8	19693	19700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_001855	TTTA	2	8	20127	20134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001855	AAAG	2	8	20220	20227	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001855	ATAA	2	8	20245	20252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001855	AGTA	2	8	21662	21669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001855	AATA	2	8	22885	22892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001855	TATT	2	8	23033	23040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001855	CTTT	2	8	23218	23225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_001855	AAGC	2	8	23448	23455	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_001855	CTGC	2	8	23648	23655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_001855	TAAG	2	8	23771	23778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001855	ACTT	2	8	23811	23818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_001855	AAGT	2	8	23827	23834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001855	AAAG	2	8	24323	24330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001855	TTAT	2	8	24654	24661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001855	GAAT	2	8	24670	24677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001855	AATA	2	8	24874	24881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001855	AGAA	2	8	24967	24974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001855	AGAA	2	8	27155	27162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001855	TTAT	2	8	27340	27347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001855	AAGT	2	8	27348	27355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001855	TTTA	2	8	28412	28419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001855	AAGC	2	8	28796	28803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_001855	ATCT	2	8	29211	29218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_001855	TAAA	2	8	33016	33023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001855	AGAT	2	8	34172	34179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001855	TAAA	2	8	34212	34219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001855	ATAA	2	8	34244	34251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001855	ATTT	2	8	34252	34259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001855	TTTC	2	8	35465	35472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_001855	ATCT	2	8	35766	35773	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_001855	AGGT	2	8	35849	35856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001855	GTTT	2	8	36492	36499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.