MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp36

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001855	TA	3	6	12	17	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001855	AT	3	6	116	121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001855	TA	3	6	339	344	50 %	50 %	0 %	0 %	11496795
4	NC_001855	AG	3	6	895	900	50 %	0 %	50 %	0 %	11496795
5	NC_001855	TG	3	6	1161	1166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001855	TA	4	8	1720	1727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001855	CT	3	6	2023	2028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_001855	TA	4	8	2357	2364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001855	AT	3	6	2385	2390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001855	AT	3	6	3287	3292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001855	AT	3	6	3912	3917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001855	TA	3	6	4127	4132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001855	TA	3	6	4949	4954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001855	AT	3	6	6072	6077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001855	AT	3	6	6488	6493	50 %	50 %	0 %	0 %	11496803
16	NC_001855	TA	4	8	8066	8073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001855	GT	3	6	8090	8095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001855	AT	4	8	8508	8515	50 %	50 %	0 %	0 %	364556720
19	NC_001855	AT	3	6	8836	8841	50 %	50 %	0 %	0 %	364556720
20	NC_001855	AT	3	6	8883	8888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001855	AG	3	6	9826	9831	50 %	0 %	50 %	0 %	11496781
22	NC_001855	TA	3	6	10160	10165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001855	AT	3	6	11788	11793	50 %	50 %	0 %	0 %	11496787
24	NC_001855	TG	3	6	12056	12061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001855	TA	3	6	12340	12345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001855	AT	4	8	12995	13002	50 %	50 %	0 %	0 %	11496820
27	NC_001855	TA	3	6	13694	13699	50 %	50 %	0 %	0 %	11496789
28	NC_001855	TA	3	6	14506	14511	50 %	50 %	0 %	0 %	11496790
29	NC_001855	TA	4	8	15208	15215	50 %	50 %	0 %	0 %	11496822
30	NC_001855	TA	3	6	15218	15223	50 %	50 %	0 %	0 %	11496822
31	NC_001855	TA	4	8	15385	15392	50 %	50 %	0 %	0 %	11496822
32	NC_001855	TC	3	6	15517	15522	0 %	50 %	0 %	50 %	11496822
33	NC_001855	TG	3	6	15780	15785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001855	TA	3	6	15810	15815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001855	TA	3	6	16043	16048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001855	AT	3	6	16149	16154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001855	AT	3	6	16647	16652	50 %	50 %	0 %	0 %	11496791
38	NC_001855	CT	3	6	17090	17095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_001855	TA	3	6	17178	17183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001855	TA	3	6	17459	17464	50 %	50 %	0 %	0 %	364556723
41	NC_001855	TA	3	6	18313	18318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001855	AT	3	6	18414	18419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001855	AG	3	6	18589	18594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001855	TA	3	6	18647	18652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001855	AT	3	6	18755	18760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001855	AT	3	6	19267	19272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001855	AT	3	6	19870	19875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001855	GA	3	6	20379	20384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001855	AT	3	6	21076	21081	50 %	50 %	0 %	0 %	11496782
50	NC_001855	TA	3	6	22057	22062	50 %	50 %	0 %	0 %	11496814
51	NC_001855	AT	3	6	23704	23709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001855	AT	3	6	23869	23874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001855	AG	3	6	24030	24035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001855	GT	3	6	24478	24483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001855	TG	4	8	24622	24629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001855	TG	3	6	25021	25026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001855	AT	3	6	25580	25585	50 %	50 %	0 %	0 %	11496792
58	NC_001855	GT	3	6	26175	26180	0 %	50 %	50 %	0 %	364556722
59	NC_001855	CT	3	6	26346	26351	0 %	50 %	0 %	50 %	364556722
60	NC_001855	TG	3	6	26677	26682	0 %	50 %	50 %	0 %	11496827
61	NC_001855	AG	3	6	26972	26977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001855	AT	5	10	27029	27038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001855	AG	3	6	29150	29155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001855	AT	3	6	29272	29277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001855	AT	3	6	29399	29404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001855	TA	3	6	29429	29434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001855	AT	3	6	29488	29493	50 %	50 %	0 %	0 %	11496830
68	NC_001855	TA	3	6	30505	30510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001855	AT	4	8	30749	30756	50 %	50 %	0 %	0 %	11496794
70	NC_001855	AT	3	6	31780	31785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001855	AT	3	6	31838	31843	50 %	50 %	0 %	0 %	11496817
72	NC_001855	AT	3	6	31900	31905	50 %	50 %	0 %	0 %	11496817
73	NC_001855	AT	4	8	33111	33118	50 %	50 %	0 %	0 %	11496783
74	NC_001855	AG	3	6	33388	33393	50 %	0 %	50 %	0 %	11496783
75	NC_001855	AT	3	6	34135	34140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001855	CA	3	6	34513	34518	50 %	0 %	0 %	50 %	364556725
77	NC_001855	TA	4	8	35402	35409	50 %	50 %	0 %	0 %	11496784
78	NC_001855	AT	3	6	35413	35418	50 %	50 %	0 %	0 %	11496784
79	NC_001855	AT	4	8	35424	35431	50 %	50 %	0 %	0 %	11496784
80	NC_001855	TG	3	6	35627	35632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001855	AT	3	6	35864	35869	50 %	50 %	0 %	0 %	11496785

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.