MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp36

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001855	A	7	7	276	282	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
2	NC_001855	A	6	6	360	365	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
3	NC_001855	A	8	8	489	496	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
4	NC_001855	A	6	6	502	507	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
5	NC_001855	A	7	7	689	695	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
6	NC_001855	T	6	6	845	850	0 %	100 %	0 %	0 %	11496795
7	NC_001855	A	6	6	1073	1078	100 %	0 %	0 %	0 %	11496795
8	NC_001855	T	6	6	5384	5389	0 %	100 %	0 %	0 %	11496801
9	NC_001855	T	6	6	5704	5709	0 %	100 %	0 %	0 %	11496801
10	NC_001855	T	7	7	5781	5787	0 %	100 %	0 %	0 %	11496801
11	NC_001855	T	6	6	5801	5806	0 %	100 %	0 %	0 %	11496801
12	NC_001855	T	6	6	5875	5880	0 %	100 %	0 %	0 %	11496801
13	NC_001855	A	6	6	6512	6517	100 %	0 %	0 %	0 %	11496803
14	NC_001855	T	8	8	6520	6527	0 %	100 %	0 %	0 %	11496803
15	NC_001855	T	6	6	6629	6634	0 %	100 %	0 %	0 %	11496803
16	NC_001855	T	8	8	8205	8212	0 %	100 %	0 %	0 %	364556720
17	NC_001855	C	6	6	8407	8412	0 %	0 %	0 %	100 %	364556720
18	NC_001855	T	7	7	8456	8462	0 %	100 %	0 %	0 %	364556720
19	NC_001855	T	6	6	8486	8491	0 %	100 %	0 %	0 %	364556720
20	NC_001855	A	9	9	8606	8614	100 %	0 %	0 %	0 %	364556720
21	NC_001855	T	6	6	8774	8779	0 %	100 %	0 %	0 %	364556720
22	NC_001855	A	8	8	9736	9743	100 %	0 %	0 %	0 %	11496781
23	NC_001855	T	6	6	9801	9806	0 %	100 %	0 %	0 %	11496781
24	NC_001855	A	6	6	10401	10406	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
25	NC_001855	A	7	7	10601	10607	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
26	NC_001855	T	9	9	10619	10627	0 %	100 %	0 %	0 %	11496787
27	NC_001855	A	6	6	11021	11026	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
28	NC_001855	T	6	6	11132	11137	0 %	100 %	0 %	0 %	11496787
29	NC_001855	A	6	6	11354	11359	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
30	NC_001855	A	6	6	11563	11568	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
31	NC_001855	G	6	6	11689	11694	0 %	0 %	100 %	0 %	11496787
32	NC_001855	A	6	6	11715	11720	100 %	0 %	0 %	0 %	11496787
33	NC_001855	A	6	6	12605	12610	100 %	0 %	0 %	0 %	11496820
34	NC_001855	T	6	6	12657	12662	0 %	100 %	0 %	0 %	11496820
35	NC_001855	A	6	6	12869	12874	100 %	0 %	0 %	0 %	11496820
36	NC_001855	A	6	6	12932	12937	100 %	0 %	0 %	0 %	11496820
37	NC_001855	A	7	7	12949	12955	100 %	0 %	0 %	0 %	11496820
38	NC_001855	A	6	6	13022	13027	100 %	0 %	0 %	0 %	11496820
39	NC_001855	A	6	6	13046	13051	100 %	0 %	0 %	0 %	11496820
40	NC_001855	T	6	6	13587	13592	0 %	100 %	0 %	0 %	11496789
41	NC_001855	T	6	6	14216	14221	0 %	100 %	0 %	0 %	11496789
42	NC_001855	A	6	6	14245	14250	100 %	0 %	0 %	0 %	11496789
43	NC_001855	T	8	8	14312	14319	0 %	100 %	0 %	0 %	11496789
44	NC_001855	C	7	7	14337	14343	0 %	0 %	0 %	100 %	11496790
45	NC_001855	T	6	6	14353	14358	0 %	100 %	0 %	0 %	11496790
46	NC_001855	T	8	8	14377	14384	0 %	100 %	0 %	0 %	11496790
47	NC_001855	T	7	7	14388	14394	0 %	100 %	0 %	0 %	11496790
48	NC_001855	T	6	6	14438	14443	0 %	100 %	0 %	0 %	11496790
49	NC_001855	T	6	6	14519	14524	0 %	100 %	0 %	0 %	11496790
50	NC_001855	T	6	6	14548	14553	0 %	100 %	0 %	0 %	11496790
51	NC_001855	A	6	6	14557	14562	100 %	0 %	0 %	0 %	11496790
52	NC_001855	T	6	6	14790	14795	0 %	100 %	0 %	0 %	11496790
53	NC_001855	T	7	7	14805	14811	0 %	100 %	0 %	0 %	11496790
54	NC_001855	T	6	6	15123	15128	0 %	100 %	0 %	0 %	11496822
55	NC_001855	T	6	6	15144	15149	0 %	100 %	0 %	0 %	11496822
56	NC_001855	T	8	8	15172	15179	0 %	100 %	0 %	0 %	11496822
57	NC_001855	A	6	6	15180	15185	100 %	0 %	0 %	0 %	11496822
58	NC_001855	T	6	6	15314	15319	0 %	100 %	0 %	0 %	11496822
59	NC_001855	T	6	6	15442	15447	0 %	100 %	0 %	0 %	11496822
60	NC_001855	T	6	6	15509	15514	0 %	100 %	0 %	0 %	11496822
61	NC_001855	T	8	8	15629	15636	0 %	100 %	0 %	0 %	11496822
62	NC_001855	T	7	7	15673	15679	0 %	100 %	0 %	0 %	11496822
63	NC_001855	T	6	6	15760	15765	0 %	100 %	0 %	0 %	11496822
64	NC_001855	A	6	6	16305	16310	100 %	0 %	0 %	0 %	11496791
65	NC_001855	A	7	7	16486	16492	100 %	0 %	0 %	0 %	11496791
66	NC_001855	T	7	7	17546	17552	0 %	100 %	0 %	0 %	364556723
67	NC_001855	A	6	6	20392	20397	100 %	0 %	0 %	0 %	11496782
68	NC_001855	T	6	6	20658	20663	0 %	100 %	0 %	0 %	11496782
69	NC_001855	A	7	7	20666	20672	100 %	0 %	0 %	0 %	11496782
70	NC_001855	A	6	6	20738	20743	100 %	0 %	0 %	0 %	11496782
71	NC_001855	A	7	7	21197	21203	100 %	0 %	0 %	0 %	11496782
72	NC_001855	A	7	7	21779	21785	100 %	0 %	0 %	0 %	11496808
73	NC_001855	T	6	6	22002	22007	0 %	100 %	0 %	0 %	11496814
74	NC_001855	A	6	6	25497	25502	100 %	0 %	0 %	0 %	11496792
75	NC_001855	T	7	7	26590	26596	0 %	100 %	0 %	0 %	11496827
76	NC_001855	T	6	6	26724	26729	0 %	100 %	0 %	0 %	11496827
77	NC_001855	A	6	6	27783	27788	100 %	0 %	0 %	0 %	364556721
78	NC_001855	T	8	8	28038	28045	0 %	100 %	0 %	0 %	364556721
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80	NC_001855	T	6	6	29598	29603	0 %	100 %	0 %	0 %	11496830
81	NC_001855	T	7	7	30241	30247	0 %	100 %	0 %	0 %	11496830
82	NC_001855	T	6	6	30368	30373	0 %	100 %	0 %	0 %	11496830
83	NC_001855	A	7	7	30402	30408	100 %	0 %	0 %	0 %	11496830
84	NC_001855	T	6	6	30743	30748	0 %	100 %	0 %	0 %	11496794
85	NC_001855	T	6	6	31361	31366	0 %	100 %	0 %	0 %	11496794
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88	NC_001855	T	6	6	32727	32732	0 %	100 %	0 %	0 %	11496817
89	NC_001855	A	7	7	32761	32767	100 %	0 %	0 %	0 %	11496817
90	NC_001855	T	6	6	33105	33110	0 %	100 %	0 %	0 %	11496783
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92	NC_001855	T	7	7	33754	33760	0 %	100 %	0 %	0 %	11496783
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94	NC_001855	T	8	8	34952	34959	0 %	100 %	0 %	0 %	11496784
95	NC_001855	T	6	6	35006	35011	0 %	100 %	0 %	0 %	11496784
96	NC_001855	A	7	7	35057	35063	100 %	0 %	0 %	0 %	11496784
97	NC_001855	A	6	6	35083	35088	100 %	0 %	0 %	0 %	11496784
98	NC_001855	A	6	6	35379	35384	100 %	0 %	0 %	0 %	11496784
99	NC_001855	T	7	7	35957	35963	0 %	100 %	0 %	0 %	11496785
100	NC_001855	A	6	6	36068	36073	100 %	0 %	0 %	0 %	11496785
101	NC_001855	A	6	6	36215	36220	100 %	0 %	0 %	0 %	11496785

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.