MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-4

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001854	AAATT	2	10	782	791	60 %	40 %	0 %	0 %	11496742
2	NC_001854	CAAAA	2	10	2701	2710	80 %	0 %	0 %	20 %	11496743
3	NC_001854	TATAT	2	10	2833	2842	40 %	60 %	0 %	0 %	11496743
4	NC_001854	TAAAA	2	10	3054	3063	80 %	20 %	0 %	0 %	11496743
5	NC_001854	AAATT	2	10	12814	12823	60 %	40 %	0 %	0 %	11496739
6	NC_001854	ATTAT	2	10	12842	12851	40 %	60 %	0 %	0 %	11496739
7	NC_001854	AAAGA	2	10	13353	13362	80 %	0 %	20 %	0 %	11496740
8	NC_001854	CAAAA	2	10	13665	13674	80 %	0 %	0 %	20 %	11496740
9	NC_001854	TATCG	2	10	18590	18599	20 %	40 %	20 %	20 %	11496772
10	NC_001854	TGCTA	2	10	18821	18830	20 %	40 %	20 %	20 %	11496772
11	NC_001854	GTTTT	2	10	22233	22242	0 %	80 %	20 %	0 %	11496748
12	NC_001854	TTTGA	2	10	22667	22676	20 %	60 %	20 %	0 %	11496748
13	NC_001854	ATTTA	2	10	22911	22920	40 %	60 %	0 %	0 %	11496748
14	NC_001854	GTTTT	2	10	23297	23306	0 %	80 %	20 %	0 %	11496761
15	NC_001854	TTTGA	2	10	23731	23740	20 %	60 %	20 %	0 %	11496761
16	NC_001854	ATTTA	2	10	23975	23984	40 %	60 %	0 %	0 %	11496761
17	NC_001854	GTTTT	2	10	24361	24370	0 %	80 %	20 %	0 %	11496762
18	NC_001854	TTTGA	2	10	24801	24810	20 %	60 %	20 %	0 %	11496762
19	NC_001854	GTTTT	2	10	24942	24951	0 %	80 %	20 %	0 %	11496762
20	NC_001854	ATTTA	2	10	25069	25078	40 %	60 %	0 %	0 %	11496762

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.