MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-3

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001853	TAAAC	2	10	1758	1767	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_001853	AGATT	2	10	9605	9614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001853	TTTAT	2	10	10713	10722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001853	GCTTT	2	10	11014	11023	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_001853	ATTTT	2	10	11198	11207	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001853	ATAGA	2	10	12259	12268	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001853	GATAT	2	10	15977	15986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001853	TATTT	2	10	16362	16371	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001853	CAAAA	2	10	19599	19608	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_001853	AAATA	2	10	20006	20015	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001853	TTAAT	2	10	20116	20125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001853	TAATT	2	10	20592	20601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001853	ATATT	2	10	21361	21370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001853	TATTT	2	10	22572	22581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001853	TATTT	2	10	23811	23820	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001853	TTTGG	2	10	23978	23987	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001853	AATTA	2	10	24096	24105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001853	CTATA	2	10	24523	24532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_001853	AAAAT	2	10	25049	25058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001853	ATCAA	2	10	26675	26684	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_001853	ATTTT	2	10	28254	28263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001853	GAATT	2	10	28266	28275	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.