MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-3

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001853	AACTA	2	10	1343	1352	60 %	20 %	0 %	20 %	11496698
2	NC_001853	TAAAC	2	10	1644	1653	60 %	20 %	0 %	20 %	11496703
3	NC_001853	TAATT	2	10	4837	4846	40 %	60 %	0 %	0 %	11496712
4	NC_001853	TTTAT	2	10	5312	5321	20 %	80 %	0 %	0 %	11496712
5	NC_001853	TAAAA	2	10	6853	6862	80 %	20 %	0 %	0 %	11496712
6	NC_001853	ATATT	2	10	7053	7062	40 %	60 %	0 %	0 %	11496712
7	NC_001853	ATTTT	2	10	7580	7589	20 %	80 %	0 %	0 %	11496712
8	NC_001853	TAAAT	2	10	10067	10076	60 %	40 %	0 %	0 %	11496699
9	NC_001853	TAAAT	2	10	10121	10130	60 %	40 %	0 %	0 %	11496699
10	NC_001853	TAAAT	2	10	10175	10184	60 %	40 %	0 %	0 %	11496699
11	NC_001853	TAAAT	2	10	10229	10238	60 %	40 %	0 %	0 %	11496699
12	NC_001853	TAAAT	2	10	10283	10292	60 %	40 %	0 %	0 %	11496699
13	NC_001853	CTAAG	2	10	17206	17215	40 %	20 %	20 %	20 %	11496723
14	NC_001853	TATAC	2	10	17519	17528	40 %	40 %	0 %	20 %	11496705
15	NC_001853	AAAGT	2	10	17888	17897	60 %	20 %	20 %	0 %	11496705
16	NC_001853	AAATT	2	10	18929	18938	60 %	40 %	0 %	0 %	11496707
17	NC_001853	AAGAA	2	10	21544	21553	80 %	0 %	20 %	0 %	11496708
18	NC_001853	TTATT	2	10	25761	25770	20 %	80 %	0 %	0 %	11496730
19	NC_001853	GATTC	2	10	27704	27713	20 %	40 %	20 %	20 %	11496701

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.