MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-3

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001853	AAAT	2	8	385	392	75 %	25 %	0 %	0 %	11496704
2	NC_001853	AAAG	2	8	568	575	75 %	0 %	25 %	0 %	11496704
3	NC_001853	ATAC	2	8	741	748	50 %	25 %	0 %	25 %	11496704
4	NC_001853	AATA	2	8	1174	1181	75 %	25 %	0 %	0 %	11496698
5	NC_001853	ATTA	2	8	1261	1268	50 %	50 %	0 %	0 %	11496698
6	NC_001853	ATAA	2	8	1439	1446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001853	TTAT	2	8	1729	1736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001853	AAAG	2	8	1931	1938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001853	ATTT	2	8	2365	2372	25 %	75 %	0 %	0 %	11496710
10	NC_001853	AATT	2	8	2641	2648	50 %	50 %	0 %	0 %	11496710
11	NC_001853	ATTA	2	8	3122	3129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001853	AAGA	2	8	3518	3525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001853	GTAA	2	8	3630	3637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001853	ACCA	2	8	3722	3729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_001853	TTAA	2	8	3892	3899	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
16	NC_001853	TATC	2	8	4545	4552	25 %	50 %	0 %	25 %	11496712
17	NC_001853	CTTT	2	8	4568	4575	0 %	75 %	0 %	25 %	11496712
18	NC_001853	TTAA	2	8	4754	4761	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
19	NC_001853	TAGT	2	8	5051	5058	25 %	50 %	25 %	0 %	11496712
20	NC_001853	TTAA	2	8	5627	5634	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
21	NC_001853	CTTT	2	8	6059	6066	0 %	75 %	0 %	25 %	11496712
22	NC_001853	TTTC	2	8	6298	6305	0 %	75 %	0 %	25 %	11496712
23	NC_001853	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	11496712
24	NC_001853	TCTT	2	8	7078	7085	0 %	75 %	0 %	25 %	11496712
25	NC_001853	TAAA	2	8	7101	7108	75 %	25 %	0 %	0 %	11496712
26	NC_001853	TTAT	2	8	7733	7740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001853	ATTT	2	8	7846	7853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001853	AATT	2	8	7913	7920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001853	ATTT	2	8	7931	7938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001853	TTAA	2	8	7953	7960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001853	GCAA	2	8	8122	8129	50 %	0 %	25 %	25 %	364556673
32	NC_001853	AGGA	2	8	8344	8351	50 %	0 %	50 %	0 %	364556673
33	NC_001853	TTAA	2	8	8568	8575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001853	TAAA	2	8	8734	8741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001853	TAAT	2	8	8973	8980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001853	TAAA	2	8	9133	9140	75 %	25 %	0 %	0 %	364556674
37	NC_001853	TAAA	2	8	9261	9268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001853	ATCT	2	8	10052	10059	25 %	50 %	0 %	25 %	11496699
39	NC_001853	ATCT	2	8	10106	10113	25 %	50 %	0 %	25 %	11496699
40	NC_001853	ATCT	2	8	10160	10167	25 %	50 %	0 %	25 %	11496699
41	NC_001853	ATCT	2	8	10214	10221	25 %	50 %	0 %	25 %	11496699
42	NC_001853	ATCT	2	8	10268	10275	25 %	50 %	0 %	25 %	11496699
43	NC_001853	TCAC	2	8	10520	10527	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_001853	TCTA	2	8	11040	11047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_001853	TTTA	2	8	11684	11691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001853	TTTC	2	8	11808	11815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_001853	ATTA	2	8	12007	12014	50 %	50 %	0 %	0 %	11496733
48	NC_001853	GTTG	2	8	12171	12178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001853	TAAT	2	8	12358	12365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001853	TTTG	2	8	12734	12741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001853	AGAA	2	8	12853	12860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001853	AATT	2	8	12963	12970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001853	TATG	2	8	13335	13342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001853	AAAT	2	8	13506	13513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001853	GCTT	2	8	13659	13666	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_001853	CTAT	2	8	13702	13709	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_001853	ATTT	2	8	14119	14126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001853	TTAA	2	8	14374	14381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001853	ATTT	2	8	14648	14655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001853	CAAA	2	8	14754	14761	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_001853	GAAA	2	8	15488	15495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001853	AAGA	2	8	15634	15641	75 %	0 %	25 %	0 %	11496722
63	NC_001853	GTGA	2	8	15778	15785	25 %	25 %	50 %	0 %	11496722
64	NC_001853	TCAT	2	8	15802	15809	25 %	50 %	0 %	25 %	11496722
65	NC_001853	GTTG	2	8	15820	15827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001853	AACA	2	8	15892	15899	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_001853	TTTA	2	8	15900	15907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001853	AAAT	2	8	16244	16251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001853	TTAG	2	8	16433	16440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001853	TAAA	2	8	16618	16625	75 %	25 %	0 %	0 %	11496723
71	NC_001853	ACTT	2	8	16942	16949	25 %	50 %	0 %	25 %	11496723
72	NC_001853	AGAA	2	8	16966	16973	75 %	0 %	25 %	0 %	11496723
73	NC_001853	CTTT	2	8	17062	17069	0 %	75 %	0 %	25 %	11496723
74	NC_001853	TAAA	2	8	17323	17330	75 %	25 %	0 %	0 %	11496723
75	NC_001853	ATGG	2	8	17681	17688	25 %	25 %	50 %	0 %	11496705
76	NC_001853	AAAG	2	8	17836	17843	75 %	0 %	25 %	0 %	11496705
77	NC_001853	AATG	2	8	18171	18178	50 %	25 %	25 %	0 %	11496706
78	NC_001853	AGAA	2	8	18471	18478	75 %	0 %	25 %	0 %	11496706
79	NC_001853	ACTA	2	8	18713	18720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_001853	AAAT	2	8	19246	19253	75 %	25 %	0 %	0 %	11496707
81	NC_001853	AAAT	2	8	19902	19909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001853	TTTA	2	8	19973	19980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001853	ATTT	2	8	20082	20089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001853	TATT	2	8	20093	20100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001853	CAAA	2	8	20322	20329	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_001853	AAAT	2	8	20342	20349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001853	GAAT	2	8	20527	20534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001853	ATTG	2	8	20580	20587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001853	AGAT	2	8	21248	21255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001853	AAAT	2	8	21324	21331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001853	TATT	2	8	21346	21353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001853	TAAG	2	8	21451	21458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001853	TTTG	3	12	21496	21507	0 %	75 %	25 %	0 %	11496708
94	NC_001853	TAAG	2	8	21557	21564	50 %	25 %	25 %	0 %	11496708
95	NC_001853	GTAT	2	8	21731	21738	25 %	50 %	25 %	0 %	11496708
96	NC_001853	TTTG	2	8	22011	22018	0 %	75 %	25 %	0 %	11496708
97	NC_001853	TAAA	2	8	22462	22469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001853	ATAA	2	8	22670	22677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001853	CTAG	2	8	22734	22741	25 %	25 %	25 %	25 %	11496726
100	NC_001853	ATTA	2	8	23026	23033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001853	ATTA	2	8	23040	23047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001853	AAGG	2	8	23055	23062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001853	TTTA	2	8	23625	23632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001853	ATGG	2	8	24043	24050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001853	AATA	2	8	24228	24235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001853	TGAA	2	8	24587	24594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001853	CACT	2	8	24749	24756	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_001853	AAAT	2	8	24888	24895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001853	ACTT	2	8	25437	25444	25 %	50 %	0 %	25 %	11496730
110	NC_001853	GCTT	2	8	25949	25956	0 %	50 %	25 %	25 %	11496730
111	NC_001853	TGGT	2	8	26025	26032	0 %	50 %	50 %	0 %	11496730
112	NC_001853	TTAA	2	8	26396	26403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001853	TTTG	2	8	26434	26441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001853	ATAA	2	8	26456	26463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001853	AATT	2	8	26464	26471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001853	ATTC	2	8	26619	26626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_001853	TTTA	2	8	26834	26841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001853	TCTT	2	8	27322	27329	0 %	75 %	0 %	25 %	11496700
119	NC_001853	CATT	2	8	27437	27444	25 %	50 %	0 %	25 %	11496700
120	NC_001853	TAAT	2	8	27620	27627	50 %	50 %	0 %	0 %	11496701
121	NC_001853	AAAT	2	8	27753	27760	75 %	25 %	0 %	0 %	11496701
122	NC_001853	AAAT	2	8	27962	27969	75 %	25 %	0 %	0 %	11496701
123	NC_001853	TGAA	2	8	28077	28084	50 %	25 %	25 %	0 %	11496701

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.