MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-3

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001853	ATAA	2	8	1439	1446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001853	TTAT	2	8	1729	1736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001853	AAAG	2	8	1931	1938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001853	ATTA	2	8	3122	3129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001853	AAGA	2	8	3518	3525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001853	GTAA	2	8	3630	3637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001853	ACCA	2	8	3722	3729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_001853	TTAT	2	8	7733	7740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001853	ATTT	2	8	7846	7853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001853	AATT	2	8	7913	7920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001853	ATTT	2	8	7931	7938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001853	TTAA	2	8	7953	7960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001853	TTAA	2	8	8568	8575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001853	TAAA	2	8	8734	8741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001853	TAAT	2	8	8973	8980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001853	TAAA	2	8	9261	9268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001853	TCAC	2	8	10520	10527	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_001853	TCTA	2	8	11040	11047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_001853	TTTA	2	8	11684	11691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001853	TTTC	2	8	11808	11815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_001853	GTTG	2	8	12171	12178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001853	TAAT	2	8	12358	12365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001853	TTTG	2	8	12734	12741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001853	AGAA	2	8	12853	12860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001853	AATT	2	8	12963	12970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001853	TATG	2	8	13335	13342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001853	AAAT	2	8	13506	13513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001853	GCTT	2	8	13659	13666	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_001853	CTAT	2	8	13702	13709	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_001853	ATTT	2	8	14119	14126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001853	TTAA	2	8	14374	14381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001853	ATTT	2	8	14648	14655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001853	CAAA	2	8	14754	14761	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_001853	GAAA	2	8	15488	15495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001853	GTTG	2	8	15820	15827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001853	AACA	2	8	15892	15899	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_001853	TTTA	2	8	15900	15907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001853	AAAT	2	8	16244	16251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001853	TTAG	2	8	16433	16440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001853	ACTA	2	8	18713	18720	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_001853	AAAT	2	8	19902	19909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001853	TTTA	2	8	19973	19980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001853	ATTT	2	8	20082	20089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001853	TATT	2	8	20093	20100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001853	CAAA	2	8	20322	20329	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_001853	AAAT	2	8	20342	20349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001853	GAAT	2	8	20527	20534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001853	ATTG	2	8	20580	20587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001853	AGAT	2	8	21248	21255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001853	AAAT	2	8	21324	21331	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001853	TATT	2	8	21346	21353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001853	TAAG	2	8	21451	21458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001853	TAAA	2	8	22462	22469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001853	ATAA	2	8	22670	22677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001853	ATTA	2	8	23026	23033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001853	ATTA	2	8	23040	23047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001853	AAGG	2	8	23055	23062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001853	TTTA	2	8	23625	23632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001853	ATGG	2	8	24043	24050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001853	AATA	2	8	24228	24235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001853	TGAA	2	8	24587	24594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001853	CACT	2	8	24749	24756	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_001853	AAAT	2	8	24888	24895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001853	TTAA	2	8	26396	26403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001853	TTTG	2	8	26434	26441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001853	ATAA	2	8	26456	26463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001853	AATT	2	8	26464	26471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001853	ATTC	2	8	26619	26626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_001853	TTTA	2	8	26834	26841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.