MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-3

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001853	GTC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496704
2	NC_001853	ATT	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496704
3	NC_001853	ATA	2	6	476	481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496704
4	NC_001853	CTA	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496704
5	NC_001853	GGA	2	6	649	654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496704
6	NC_001853	ACA	2	6	701	706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496704
7	NC_001853	CGA	2	6	726	731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496704
8	NC_001853	AAT	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496704
9	NC_001853	TAG	4	12	783	794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496704
10	NC_001853	TTA	2	6	795	800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496704
11	NC_001853	ATA	2	6	814	819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496704
12	NC_001853	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496704
13	NC_001853	ATT	2	6	1068	1073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496698
14	NC_001853	AAT	2	6	1087	1092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496698
15	NC_001853	ATA	2	6	1142	1147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496698
16	NC_001853	CAA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496698
17	NC_001853	TAT	2	6	1252	1257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496698
18	NC_001853	CAA	2	6	1289	1294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496698
19	NC_001853	ACT	2	6	1301	1306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496698
20	NC_001853	CTA	3	9	1355	1363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496698
21	NC_001853	TAA	2	6	1529	1534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496703
22	NC_001853	ACA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496703
23	NC_001853	TAG	2	6	1590	1595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496703
24	NC_001853	TAA	2	6	2263	2268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496710
25	NC_001853	CAG	2	6	2307	2312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496710
26	NC_001853	CTT	2	6	2328	2333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496710
27	NC_001853	ATT	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496710
28	NC_001853	CTT	2	6	2357	2362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496710
29	NC_001853	CAA	2	6	2481	2486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496710
30	NC_001853	CAA	2	6	2496	2501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496710
31	NC_001853	AGA	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496710
32	NC_001853	ACA	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496710
33	NC_001853	CAT	2	6	2598	2603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496710
34	NC_001853	ATC	2	6	2635	2640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496710
35	NC_001853	TTC	2	6	2671	2676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496710
36	NC_001853	TTA	2	6	2702	2707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496710
37	NC_001853	ATA	2	6	2789	2794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496710
38	NC_001853	AAT	2	6	2844	2849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496710
39	NC_001853	CAA	2	6	2862	2867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496710
40	NC_001853	CTA	2	6	2903	2908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496710
41	NC_001853	ATA	2	6	2919	2924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496710
42	NC_001853	AAT	2	6	3915	3920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496712
43	NC_001853	TTA	2	6	3933	3938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496712
44	NC_001853	TTC	2	6	3952	3957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
45	NC_001853	TCT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
46	NC_001853	TTA	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496712
47	NC_001853	TCT	3	9	4235	4243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
48	NC_001853	TCT	2	6	4306	4311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
49	NC_001853	ATA	2	6	4349	4354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496712
50	NC_001853	AAT	2	6	4355	4360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496712
51	NC_001853	TGA	2	6	4610	4615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496712
52	NC_001853	ATT	2	6	4651	4656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496712
53	NC_001853	AAT	2	6	4789	4794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496712
54	NC_001853	ATC	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496712
55	NC_001853	TAT	2	6	4866	4871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496712
56	NC_001853	TTA	2	6	5142	5147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496712
57	NC_001853	CAC	3	9	5190	5198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496712
58	NC_001853	TTG	2	6	5231	5236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496712
59	NC_001853	GAT	2	6	5283	5288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496712
60	NC_001853	GGA	2	6	5405	5410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496712
61	NC_001853	CTT	2	6	5433	5438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
62	NC_001853	ATT	2	6	5642	5647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496712
63	NC_001853	TTC	2	6	5671	5676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
64	NC_001853	TCT	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
65	NC_001853	ATG	2	6	5884	5889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496712
66	NC_001853	AGC	2	6	5999	6004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496712
67	NC_001853	CTC	2	6	6052	6057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496712
68	NC_001853	AAT	2	6	6070	6075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496712
69	NC_001853	GCT	2	6	6231	6236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496712
70	NC_001853	TGA	2	6	6244	6249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496712
71	NC_001853	ATC	2	6	6271	6276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496712
72	NC_001853	CTT	2	6	6384	6389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
73	NC_001853	CAA	2	6	6417	6422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496712
74	NC_001853	AGT	2	6	6433	6438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496712
75	NC_001853	TTC	2	6	6574	6579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
76	NC_001853	ATT	2	6	6607	6612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496712
77	NC_001853	TCC	2	6	6643	6648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496712
78	NC_001853	TTA	2	6	6705	6710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496712
79	NC_001853	TCA	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496712
80	NC_001853	AGA	2	6	6772	6777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496712
81	NC_001853	TCT	2	6	6794	6799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
82	NC_001853	ATC	2	6	6970	6975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496712
83	NC_001853	TTC	2	6	7132	7137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
84	NC_001853	TCT	2	6	7283	7288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
85	NC_001853	CTT	2	6	7290	7295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
86	NC_001853	ATG	2	6	7323	7328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496712
87	NC_001853	ATT	2	6	7378	7383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496712
88	NC_001853	CTT	2	6	7392	7397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
89	NC_001853	AGT	2	6	7442	7447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496712
90	NC_001853	TGT	2	6	7490	7495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496712
91	NC_001853	TTC	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496712
92	NC_001853	TCT	2	6	8091	8096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556673
93	NC_001853	ACA	2	6	8172	8177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556673
94	NC_001853	ATA	2	6	8181	8186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556673
95	NC_001853	TAA	2	6	8323	8328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556673
96	NC_001853	ACA	2	6	8361	8366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556673
97	NC_001853	TTC	2	6	8372	8377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556673
98	NC_001853	TAG	2	6	8418	8423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556673
99	NC_001853	TAC	2	6	9088	9093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556674
100	NC_001853	TTA	2	6	9219	9224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556674
101	NC_001853	TAG	2	6	9869	9874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496699
102	NC_001853	TAT	2	6	9914	9919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496699
103	NC_001853	TAA	3	9	9925	9933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496699
104	NC_001853	TTA	2	6	9934	9939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496699
105	NC_001853	CTT	2	6	9991	9996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496699
106	NC_001853	ATA	2	6	10406	10411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496699
107	NC_001853	CCA	2	6	11845	11850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496733
108	NC_001853	TAA	2	6	11932	11937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496733
109	NC_001853	ATT	2	6	11955	11960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496733
110	NC_001853	ACC	2	6	15619	15624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496722
111	NC_001853	AAG	2	6	15651	15656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496722
112	NC_001853	ATA	2	6	15702	15707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496722
113	NC_001853	ATT	2	6	15723	15728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496722
114	NC_001853	ACC	2	6	16543	16548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496723
115	NC_001853	TAA	2	6	16655	16660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496723
116	NC_001853	TCA	3	9	16700	16708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496723
117	NC_001853	TAA	2	6	16925	16930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496723
118	NC_001853	AAT	2	6	17084	17089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496723
119	NC_001853	TTA	2	6	17130	17135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496723
120	NC_001853	TAC	2	6	17306	17311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496723
121	NC_001853	ATA	2	6	17358	17363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496723
122	NC_001853	AAT	2	6	17367	17372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496723
123	NC_001853	AGA	2	6	17496	17501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496705
124	NC_001853	TAA	3	9	17604	17612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496705
125	NC_001853	ATT	3	9	17621	17629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496705
126	NC_001853	CTT	2	6	17706	17711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496705
127	NC_001853	TAT	2	6	17755	17760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496705
128	NC_001853	TAT	2	6	17851	17856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496705
129	NC_001853	ATC	2	6	17870	17875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496705
130	NC_001853	GGA	2	6	17929	17934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496705
131	NC_001853	GAG	2	6	17992	17997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496706
132	NC_001853	CTT	2	6	18094	18099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496706
133	NC_001853	ATA	2	6	18133	18138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496706
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.