MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-3

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001853	AT	3	6	1187	1192	50 %	50 %	0 %	0 %	11496698
2	NC_001853	AT	3	6	1242	1247	50 %	50 %	0 %	0 %	11496698
3	NC_001853	AT	3	6	1424	1429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001853	AC	3	6	1544	1549	50 %	0 %	0 %	50 %	11496703
5	NC_001853	TA	3	6	1695	1700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001853	TA	4	8	1843	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001853	GA	3	6	1868	1873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001853	AG	3	6	1986	1991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001853	TA	3	6	2045	2050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001853	CT	3	6	2213	2218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_001853	TA	3	6	3073	3078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001853	TC	3	6	3131	3136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_001853	TA	3	6	3199	3204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001853	TA	3	6	3623	3628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001853	TA	4	8	4396	4403	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
16	NC_001853	TA	3	6	4482	4487	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
17	NC_001853	AT	3	6	4712	4717	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
18	NC_001853	AT	4	8	5061	5068	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
19	NC_001853	TA	3	6	5659	5664	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
20	NC_001853	AG	3	6	5862	5867	50 %	0 %	50 %	0 %	11496712
21	NC_001853	AT	3	6	6830	6835	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
22	NC_001853	AT	4	8	6937	6944	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
23	NC_001853	TC	3	6	6979	6984	0 %	50 %	0 %	50 %	11496712
24	NC_001853	TC	3	6	6993	6998	0 %	50 %	0 %	50 %	11496712
25	NC_001853	AT	3	6	7169	7174	50 %	50 %	0 %	0 %	11496712
26	NC_001853	CT	3	6	8211	8216	0 %	50 %	0 %	50 %	364556673
27	NC_001853	TA	4	8	8626	8633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001853	TA	3	6	9248	9253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001853	AT	3	6	9318	9323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001853	TA	3	6	9354	9359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001853	CT	3	6	10463	10468	0 %	50 %	0 %	50 %	11496699
32	NC_001853	AT	3	6	10469	10474	50 %	50 %	0 %	0 %	11496699
33	NC_001853	TA	5	10	10532	10541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001853	CA	3	6	10608	10613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_001853	AT	3	6	10620	10625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001853	TA	3	6	10743	10748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001853	CT	3	6	12937	12942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_001853	TA	3	6	13309	13314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001853	AG	3	6	13647	13652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001853	AT	3	6	13843	13848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001853	TC	3	6	14138	14143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_001853	CT	3	6	14303	14308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_001853	CT	3	6	14427	14432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_001853	CT	3	6	16032	16037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_001853	TA	4	8	16877	16884	50 %	50 %	0 %	0 %	11496723
46	NC_001853	TA	3	6	17011	17016	50 %	50 %	0 %	0 %	11496723
47	NC_001853	AT	3	6	17024	17029	50 %	50 %	0 %	0 %	11496723
48	NC_001853	AT	4	8	17032	17039	50 %	50 %	0 %	0 %	11496723
49	NC_001853	AT	3	6	18110	18115	50 %	50 %	0 %	0 %	11496706
50	NC_001853	TA	3	6	18198	18203	50 %	50 %	0 %	0 %	11496706
51	NC_001853	AT	3	6	18480	18485	50 %	50 %	0 %	0 %	11496706
52	NC_001853	AT	3	6	18572	18577	50 %	50 %	0 %	0 %	11496706
53	NC_001853	TA	3	6	18831	18836	50 %	50 %	0 %	0 %	11496707
54	NC_001853	TA	3	6	19052	19057	50 %	50 %	0 %	0 %	11496707
55	NC_001853	AT	3	6	19193	19198	50 %	50 %	0 %	0 %	11496707
56	NC_001853	AT	3	6	19440	19445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001853	AG	3	6	19463	19468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001853	TC	4	8	19473	19480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_001853	TA	3	6	19531	19536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001853	TA	3	6	20819	20824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001853	TG	3	6	21181	21186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001853	AT	3	6	21383	21388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001853	AT	3	6	21398	21403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001853	GA	3	6	21781	21786	50 %	0 %	50 %	0 %	11496708
65	NC_001853	AT	3	6	22204	22209	50 %	50 %	0 %	0 %	11496708
66	NC_001853	TA	4	8	22223	22230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001853	TC	3	6	22261	22266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_001853	TA	3	6	22803	22808	50 %	50 %	0 %	0 %	11496726
69	NC_001853	TA	4	8	23387	23394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001853	AT	3	6	23589	23594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001853	TC	3	6	23640	23645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_001853	TA	3	6	23710	23715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001853	AT	3	6	23963	23968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001853	CT	3	6	24257	24262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_001853	AT	3	6	24418	24423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001853	AG	3	6	25365	25370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001853	AT	3	6	25406	25411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001853	TA	3	6	25413	25418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001853	CA	3	6	25877	25882	50 %	0 %	0 %	50 %	11496730
80	NC_001853	TA	3	6	26319	26324	50 %	50 %	0 %	0 %	11496730
81	NC_001853	AT	4	8	26373	26380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001853	TA	3	6	26424	26429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001853	AT	3	6	26509	26514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001853	AT	3	6	26757	26762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001853	TA	3	6	27064	27069	50 %	50 %	0 %	0 %	11496700
86	NC_001853	AT	3	6	27408	27413	50 %	50 %	0 %	0 %	11496700
87	NC_001853	TA	3	6	28551	28556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.