MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-3

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001853	A	6	6	857	862	100 %	0 %	0 %	0 %	11496704
2	NC_001853	A	8	8	1100	1107	100 %	0 %	0 %	0 %	11496698
3	NC_001853	A	6	6	1135	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	11496698
4	NC_001853	A	6	6	1196	1201	100 %	0 %	0 %	0 %	11496698
5	NC_001853	A	6	6	1572	1577	100 %	0 %	0 %	0 %	11496703
6	NC_001853	A	6	6	2318	2323	100 %	0 %	0 %	0 %	11496710
7	NC_001853	T	6	6	2332	2337	0 %	100 %	0 %	0 %	11496710
8	NC_001853	T	6	6	2467	2472	0 %	100 %	0 %	0 %	11496710
9	NC_001853	T	6	6	2560	2565	0 %	100 %	0 %	0 %	11496710
10	NC_001853	T	6	6	2722	2727	0 %	100 %	0 %	0 %	11496710
11	NC_001853	A	6	6	2954	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	11496710
12	NC_001853	T	7	7	2961	2967	0 %	100 %	0 %	0 %	11496710
13	NC_001853	T	6	6	3968	3973	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
14	NC_001853	T	6	6	4196	4201	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
15	NC_001853	T	6	6	4360	4365	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
16	NC_001853	T	6	6	4491	4496	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
17	NC_001853	A	6	6	4591	4596	100 %	0 %	0 %	0 %	11496712
18	NC_001853	T	6	6	4816	4821	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
19	NC_001853	T	6	6	5013	5018	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
20	NC_001853	T	7	7	5252	5258	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
21	NC_001853	T	6	6	5394	5399	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
22	NC_001853	T	6	6	5508	5513	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
23	NC_001853	T	6	6	5742	5747	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
24	NC_001853	T	7	7	5787	5793	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
25	NC_001853	T	6	6	5822	5827	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
26	NC_001853	A	6	6	5836	5841	100 %	0 %	0 %	0 %	11496712
27	NC_001853	T	7	7	6097	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
28	NC_001853	A	6	6	6167	6172	100 %	0 %	0 %	0 %	11496712
29	NC_001853	T	6	6	6523	6528	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
30	NC_001853	T	7	7	6539	6545	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
31	NC_001853	T	7	7	6711	6717	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
32	NC_001853	T	6	6	6731	6736	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
33	NC_001853	A	8	8	6750	6757	100 %	0 %	0 %	0 %	11496712
34	NC_001853	A	6	6	6841	6846	100 %	0 %	0 %	0 %	11496712
35	NC_001853	T	6	6	6944	6949	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
36	NC_001853	T	6	6	7005	7010	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
37	NC_001853	T	6	6	7176	7181	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
38	NC_001853	T	8	8	7382	7389	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
39	NC_001853	T	6	6	7402	7407	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
40	NC_001853	T	6	6	7586	7591	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
41	NC_001853	A	7	7	7592	7598	100 %	0 %	0 %	0 %	11496712
42	NC_001853	A	6	6	7600	7605	100 %	0 %	0 %	0 %	11496712
43	NC_001853	T	6	6	7607	7612	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
44	NC_001853	T	7	7	7630	7636	0 %	100 %	0 %	0 %	11496712
45	NC_001853	A	7	7	8031	8037	100 %	0 %	0 %	0 %	364556673
46	NC_001853	A	6	6	8139	8144	100 %	0 %	0 %	0 %	364556673
47	NC_001853	A	6	6	8224	8229	100 %	0 %	0 %	0 %	364556673
48	NC_001853	T	6	6	8254	8259	0 %	100 %	0 %	0 %	364556673
49	NC_001853	A	6	6	8305	8310	100 %	0 %	0 %	0 %	364556673
50	NC_001853	T	6	6	8335	8340	0 %	100 %	0 %	0 %	364556673
51	NC_001853	A	7	7	8407	8413	100 %	0 %	0 %	0 %	364556673
52	NC_001853	A	6	6	9108	9113	100 %	0 %	0 %	0 %	364556674
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54	NC_001853	T	6	6	9995	10000	0 %	100 %	0 %	0 %	11496699
55	NC_001853	A	6	6	10317	10322	100 %	0 %	0 %	0 %	11496699
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57	NC_001853	T	6	6	11949	11954	0 %	100 %	0 %	0 %	11496733
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60	NC_001853	A	7	7	16590	16596	100 %	0 %	0 %	0 %	11496723
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62	NC_001853	A	6	6	16677	16682	100 %	0 %	0 %	0 %	11496723
63	NC_001853	A	6	6	16755	16760	100 %	0 %	0 %	0 %	11496723
64	NC_001853	A	6	6	16822	16827	100 %	0 %	0 %	0 %	11496723
65	NC_001853	A	6	6	16950	16955	100 %	0 %	0 %	0 %	11496723
66	NC_001853	A	6	6	17120	17125	100 %	0 %	0 %	0 %	11496723
67	NC_001853	A	7	7	17390	17396	100 %	0 %	0 %	0 %	11496723
68	NC_001853	A	9	9	17435	17443	100 %	0 %	0 %	0 %	11496705
69	NC_001853	A	6	6	17473	17478	100 %	0 %	0 %	0 %	11496705
70	NC_001853	A	7	7	17511	17517	100 %	0 %	0 %	0 %	11496705
71	NC_001853	T	7	7	17628	17634	0 %	100 %	0 %	0 %	11496705
72	NC_001853	T	6	6	17639	17644	0 %	100 %	0 %	0 %	11496705
73	NC_001853	A	6	6	17652	17657	100 %	0 %	0 %	0 %	11496705
74	NC_001853	A	6	6	17716	17721	100 %	0 %	0 %	0 %	11496705
75	NC_001853	A	6	6	17776	17781	100 %	0 %	0 %	0 %	11496705
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80	NC_001853	A	6	6	17955	17960	100 %	0 %	0 %	0 %	11496705
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83	NC_001853	A	6	6	18515	18520	100 %	0 %	0 %	0 %	11496706
84	NC_001853	A	6	6	18642	18647	100 %	0 %	0 %	0 %	11496706
85	NC_001853	A	6	6	18680	18685	100 %	0 %	0 %	0 %	11496706
86	NC_001853	T	6	6	18688	18693	0 %	100 %	0 %	0 %	11496706
87	NC_001853	A	6	6	18803	18808	100 %	0 %	0 %	0 %	11496707
88	NC_001853	A	6	6	19174	19179	100 %	0 %	0 %	0 %	11496707
89	NC_001853	A	6	6	19298	19303	100 %	0 %	0 %	0 %	11496707
90	NC_001853	A	8	8	19349	19356	100 %	0 %	0 %	0 %	11496707
91	NC_001853	A	6	6	19394	19399	100 %	0 %	0 %	0 %	11496707
92	NC_001853	A	6	6	21606	21611	100 %	0 %	0 %	0 %	11496708
93	NC_001853	A	8	8	21675	21682	100 %	0 %	0 %	0 %	11496708
94	NC_001853	A	6	6	21958	21963	100 %	0 %	0 %	0 %	11496708
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96	NC_001853	T	7	7	22936	22942	0 %	100 %	0 %	0 %	11496726
97	NC_001853	A	6	6	22951	22956	100 %	0 %	0 %	0 %	11496726
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99	NC_001853	T	6	6	25507	25512	0 %	100 %	0 %	0 %	11496730
100	NC_001853	T	6	6	25599	25604	0 %	100 %	0 %	0 %	11496730
101	NC_001853	A	6	6	25651	25656	100 %	0 %	0 %	0 %	11496730
102	NC_001853	T	7	7	25803	25809	0 %	100 %	0 %	0 %	11496730
103	NC_001853	A	6	6	25976	25981	100 %	0 %	0 %	0 %	11496730
104	NC_001853	T	8	8	25999	26006	0 %	100 %	0 %	0 %	11496730
105	NC_001853	T	8	8	26164	26171	0 %	100 %	0 %	0 %	11496730
106	NC_001853	T	6	6	26173	26178	0 %	100 %	0 %	0 %	11496730
107	NC_001853	T	7	7	26246	26252	0 %	100 %	0 %	0 %	11496730
108	NC_001853	T	10	10	26331	26340	0 %	100 %	0 %	0 %	11496730
109	NC_001853	T	7	7	27092	27098	0 %	100 %	0 %	0 %	11496700
110	NC_001853	T	6	6	27169	27174	0 %	100 %	0 %	0 %	11496700
111	NC_001853	A	7	7	27184	27190	100 %	0 %	0 %	0 %	11496700
112	NC_001853	A	6	6	27254	27259	100 %	0 %	0 %	0 %	11496700
113	NC_001853	T	8	8	27387	27394	0 %	100 %	0 %	0 %	11496700
114	NC_001853	T	7	7	27631	27637	0 %	100 %	0 %	0 %	11496701
115	NC_001853	T	6	6	27836	27841	0 %	100 %	0 %	0 %	11496701
116	NC_001853	T	6	6	28057	28062	0 %	100 %	0 %	0 %	11496701
117	NC_001853	T	7	7	28186	28192	0 %	100 %	0 %	0 %	11496701

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.