MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-2

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001852	TAATAT	2	12	2094	2105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001852	ATTAAT	2	12	2121	2132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001852	TTAAAT	2	12	2776	2787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001852	ATTCTT	2	12	6122	6133	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11496669
5	NC_001852	TAGAAA	2	12	6910	6921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11496670
6	NC_001852	AAAAGA	2	12	7341	7352	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001852	TATCAA	2	12	7414	7425	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_001852	TGAGCT	2	12	9836	9847	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_001852	GCTCTC	2	12	10788	10799	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_001852	TGATCT	2	12	11664	11675	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	364556647
11	NC_001852	TTCAAT	2	12	13529	13540	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	11496678
12	NC_001852	GTTGCA	2	12	14698	14709	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	11496679
13	NC_001852	CTCAGC	2	12	15258	15269	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	11496680
14	NC_001852	TCTTTA	2	12	19477	19488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11496684
15	NC_001852	CATTAA	2	12	19991	20002	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	364556646
16	NC_001852	CTCGTA	2	12	20691	20702	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	364556646
17	NC_001852	AAGGAA	2	12	24883	24894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496672
18	NC_001852	AGAGAA	2	12	25698	25709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496672
19	NC_001852	GCAAAC	2	12	25763	25774	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	11496672
20	NC_001852	TGAAAA	2	12	27145	27156	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11496674

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.