MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-2

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001852	AGATA	2	10	655	664	60 %	20 %	20 %	0 %	11496686
2	NC_001852	TAAAT	2	10	1067	1076	60 %	40 %	0 %	0 %	11496666
3	NC_001852	AAAAC	2	10	1685	1694	80 %	0 %	0 %	20 %	11496666
4	NC_001852	ACTAT	2	10	1789	1798	40 %	40 %	0 %	20 %	11496666
5	NC_001852	ACTTA	2	10	1825	1834	40 %	40 %	0 %	20 %	11496666
6	NC_001852	ATAGA	2	10	6852	6861	60 %	20 %	20 %	0 %	11496670
7	NC_001852	AAATA	2	10	6874	6883	80 %	20 %	0 %	0 %	11496670
8	NC_001852	ATTTT	2	10	6957	6966	20 %	80 %	0 %	0 %	11496670
9	NC_001852	CTGTA	2	10	14081	14090	20 %	40 %	20 %	20 %	11496678
10	NC_001852	TTCAT	2	10	15476	15485	20 %	60 %	0 %	20 %	11496681
11	NC_001852	TGGTG	2	10	16409	16418	0 %	40 %	60 %	0 %	11496681
12	NC_001852	CAAGC	2	10	17090	17099	40 %	0 %	20 %	40 %	11496682
13	NC_001852	TTGAT	2	10	17172	17181	20 %	60 %	20 %	0 %	11496682
14	NC_001852	TGCTT	2	10	17421	17430	0 %	60 %	20 %	20 %	11496682
15	NC_001852	TATTT	2	10	18741	18750	20 %	80 %	0 %	0 %	11496683
16	NC_001852	TCAAG	2	10	19055	19064	40 %	20 %	20 %	20 %	11496684
17	NC_001852	CTTTT	2	10	19200	19209	0 %	80 %	0 %	20 %	11496684
18	NC_001852	AATGC	2	10	20096	20105	40 %	20 %	20 %	20 %	364556646
19	NC_001852	ACATA	2	10	21461	21470	60 %	20 %	0 %	20 %	364556646
20	NC_001852	TAGTT	2	10	21693	21702	20 %	60 %	20 %	0 %	364556646
21	NC_001852	CTTGA	2	10	22232	22241	20 %	40 %	20 %	20 %	364556646
22	NC_001852	TCGGT	2	10	22311	22320	0 %	40 %	40 %	20 %	11496665
23	NC_001852	GCGGA	2	10	27166	27175	20 %	0 %	60 %	20 %	11496674
24	NC_001852	CTTTA	2	10	28847	28856	20 %	60 %	0 %	20 %	11496696

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.