MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-2

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001852	TTTA	2	8	10	17	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001852	GTTT	2	8	126	133	0 %	75 %	25 %	0 %	11496686
3	NC_001852	TAAT	2	8	333	340	50 %	50 %	0 %	0 %	11496686
4	NC_001852	AATT	2	8	531	538	50 %	50 %	0 %	0 %	11496686
5	NC_001852	TGAT	2	8	729	736	25 %	50 %	25 %	0 %	11496686
6	NC_001852	CTTT	2	8	765	772	0 %	75 %	0 %	25 %	11496686
7	NC_001852	AAGA	2	8	940	947	75 %	0 %	25 %	0 %	11496686
8	NC_001852	AAAT	2	8	1051	1058	75 %	25 %	0 %	0 %	11496666
9	NC_001852	AAAT	2	8	1403	1410	75 %	25 %	0 %	0 %	11496666
10	NC_001852	ATAA	2	8	2035	2042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001852	GGAA	2	8	2340	2347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001852	TCTA	2	8	3104	3111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_001852	AATA	2	8	3423	3430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001852	TCTT	2	8	3935	3942	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_001852	ATCA	2	8	4592	4599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_001852	AAGA	3	12	4728	4739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001852	GAAA	2	8	5129	5136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001852	AAAT	2	8	5266	5273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001852	AATC	2	8	5570	5577	50 %	25 %	0 %	25 %	11496668
20	NC_001852	ATTT	2	8	5595	5602	25 %	75 %	0 %	0 %	11496668
21	NC_001852	AATT	2	8	6104	6111	50 %	50 %	0 %	0 %	11496669
22	NC_001852	TTTA	2	8	7078	7085	25 %	75 %	0 %	0 %	11496670
23	NC_001852	CTAA	2	8	7532	7539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_001852	TTCG	2	8	7941	7948	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_001852	GTTT	2	8	7965	7972	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001852	CAAA	2	8	8318	8325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_001852	CTTT	2	8	8750	8757	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_001852	GATC	2	8	8831	8838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_001852	CTTT	2	8	9038	9045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_001852	TTTA	2	8	9916	9923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001852	TCGC	2	8	9947	9954	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_001852	TTTG	2	8	10450	10457	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001852	GTTC	2	8	10823	10830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_001852	AAAC	2	8	10838	10845	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_001852	AATT	2	8	11107	11114	50 %	50 %	0 %	0 %	11496690
36	NC_001852	ATTA	2	8	11480	11487	50 %	50 %	0 %	0 %	11496690
37	NC_001852	AATC	2	8	12097	12104	50 %	25 %	0 %	25 %	364556647
38	NC_001852	AAGT	2	8	12697	12704	50 %	25 %	25 %	0 %	11496676
39	NC_001852	AATT	2	8	12979	12986	50 %	50 %	0 %	0 %	364556648
40	NC_001852	AAAG	2	8	13168	13175	75 %	0 %	25 %	0 %	11496677
41	NC_001852	TAAA	2	8	13277	13284	75 %	25 %	0 %	0 %	11496677
42	NC_001852	TTTG	2	8	13386	13393	0 %	75 %	25 %	0 %	11496677
43	NC_001852	AACA	2	8	13649	13656	75 %	0 %	0 %	25 %	11496678
44	NC_001852	ATCT	2	8	14906	14913	25 %	50 %	0 %	25 %	11496680
45	NC_001852	ATTT	2	8	15414	15421	25 %	75 %	0 %	0 %	11496680
46	NC_001852	TTTC	2	8	15519	15526	0 %	75 %	0 %	25 %	11496681
47	NC_001852	CTTA	2	8	15529	15536	25 %	50 %	0 %	25 %	11496681
48	NC_001852	TGAA	2	8	15787	15794	50 %	25 %	25 %	0 %	11496681
49	NC_001852	GTTT	2	8	16646	16653	0 %	75 %	25 %	0 %	11496682
50	NC_001852	GCAA	2	8	16714	16721	50 %	0 %	25 %	25 %	11496682
51	NC_001852	ATTG	2	8	17488	17495	25 %	50 %	25 %	0 %	11496682
52	NC_001852	TTTC	2	8	17554	17561	0 %	75 %	0 %	25 %	11496682
53	NC_001852	AAAG	2	8	17961	17968	75 %	0 %	25 %	0 %	364556650
54	NC_001852	AATA	2	8	18115	18122	75 %	25 %	0 %	0 %	11496683
55	NC_001852	AATT	2	8	18254	18261	50 %	50 %	0 %	0 %	11496683
56	NC_001852	TTTG	2	8	18465	18472	0 %	75 %	25 %	0 %	11496683
57	NC_001852	TACC	2	8	18834	18841	25 %	25 %	0 %	50 %	11496684
58	NC_001852	ATTG	2	8	21345	21352	25 %	50 %	25 %	0 %	364556646
59	NC_001852	TGCT	2	8	22013	22020	0 %	50 %	25 %	25 %	364556646
60	NC_001852	TTGT	2	8	22547	22554	0 %	75 %	25 %	0 %	11496665
61	NC_001852	GGTT	2	8	22558	22565	0 %	50 %	50 %	0 %	11496665
62	NC_001852	AAGA	2	8	22593	22600	75 %	0 %	25 %	0 %	11496665
63	NC_001852	TTAC	2	8	23397	23404	25 %	50 %	0 %	25 %	11496671
64	NC_001852	AATC	2	8	23422	23429	50 %	25 %	0 %	25 %	11496671
65	NC_001852	AATA	2	8	23486	23493	75 %	25 %	0 %	0 %	11496671
66	NC_001852	AGAT	2	8	24042	24049	50 %	25 %	25 %	0 %	11496694
67	NC_001852	ATTT	2	8	24082	24089	25 %	75 %	0 %	0 %	11496694
68	NC_001852	TAAA	2	8	24169	24176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001852	CTAG	2	8	24184	24191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_001852	TGCA	2	8	24421	24428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_001852	TGAT	2	8	24676	24683	25 %	50 %	25 %	0 %	11496672
72	NC_001852	GGAA	2	8	25618	25625	50 %	0 %	50 %	0 %	11496672
73	NC_001852	GATA	2	8	26995	27002	50 %	25 %	25 %	0 %	364556645
74	NC_001852	ATCA	2	8	27005	27012	50 %	25 %	0 %	25 %	364556645
75	NC_001852	TAAA	2	8	27417	27424	75 %	25 %	0 %	0 %	11496674
76	NC_001852	ACAT	2	8	27504	27511	50 %	25 %	0 %	25 %	11496674
77	NC_001852	ATTA	2	8	28807	28814	50 %	50 %	0 %	0 %	11496675
78	NC_001852	TTGA	2	8	29064	29071	25 %	50 %	25 %	0 %	11496696
79	NC_001852	TAAT	2	8	29272	29279	50 %	50 %	0 %	0 %	11496696
80	NC_001852	ATTC	2	8	29543	29550	25 %	50 %	0 %	25 %	11496696
81	NC_001852	ATTT	2	8	29553	29560	25 %	75 %	0 %	0 %	11496696

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.