MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-2

Total Repeats: 294

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001852	ATT	2	6	142	147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496686
2	NC_001852	GGA	2	6	152	157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496686
3	NC_001852	AAT	2	6	215	220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496686
4	NC_001852	AAG	2	6	225	230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496686
5	NC_001852	AAG	2	6	246	251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496686
6	NC_001852	AGG	2	6	435	440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496686
7	NC_001852	CTA	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496686
8	NC_001852	GAA	2	6	461	466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496686
9	NC_001852	TGA	2	6	475	480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496686
10	NC_001852	AGA	2	6	496	501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496686
11	NC_001852	TTC	2	6	507	512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496686
12	NC_001852	TAA	2	6	573	578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496686
13	NC_001852	ATG	2	6	591	596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496686
14	NC_001852	CAT	2	6	624	629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496686
15	NC_001852	AAT	2	6	686	691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496686
16	NC_001852	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496686
17	NC_001852	TAT	2	6	805	810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496686
18	NC_001852	ATA	2	6	831	836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496686
19	NC_001852	TTA	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496686
20	NC_001852	AAG	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496686
21	NC_001852	TTA	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496686
22	NC_001852	ATA	3	9	1084	1092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496666
23	NC_001852	CTA	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496666
24	NC_001852	ATA	2	6	1147	1152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496666
25	NC_001852	AAT	2	6	1205	1210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496666
26	NC_001852	ATA	2	6	1234	1239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496666
27	NC_001852	TAA	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496666
28	NC_001852	CAA	2	6	1252	1257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496666
29	NC_001852	ATT	2	6	1320	1325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496666
30	NC_001852	AAG	2	6	1357	1362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496666
31	NC_001852	AGA	2	6	1454	1459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496666
32	NC_001852	ATT	2	6	1545	1550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496666
33	NC_001852	GTT	2	6	1626	1631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496666
34	NC_001852	CAA	2	6	1633	1638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496666
35	NC_001852	AGA	2	6	1721	1726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496666
36	NC_001852	TTA	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496666
37	NC_001852	AAG	2	6	1861	1866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496666
38	NC_001852	TCA	2	6	1885	1890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496666
39	NC_001852	TTA	2	6	5448	5453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496668
40	NC_001852	ATG	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496668
41	NC_001852	TAA	2	6	5524	5529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496668
42	NC_001852	ATT	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496668
43	NC_001852	GAA	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496668
44	NC_001852	GAT	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496668
45	NC_001852	TTA	2	6	5635	5640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496668
46	NC_001852	ATT	2	6	5827	5832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496668
47	NC_001852	TAT	2	6	5943	5948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496668
48	NC_001852	GAG	2	6	5969	5974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496669
49	NC_001852	CTT	2	6	5987	5992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496669
50	NC_001852	CAA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496669
51	NC_001852	TAA	2	6	6024	6029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496669
52	NC_001852	ATC	2	6	6089	6094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496669
53	NC_001852	TAA	2	6	6134	6139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496669
54	NC_001852	TGT	2	6	6162	6167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496669
55	NC_001852	AAG	2	6	6230	6235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496669
56	NC_001852	ATT	2	6	6278	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496669
57	NC_001852	AGA	2	6	6285	6290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496669
58	NC_001852	TAA	2	6	6419	6424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496669
59	NC_001852	AAT	2	6	6445	6450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496669
60	NC_001852	ATT	2	6	6472	6477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496669
61	NC_001852	TTA	2	6	6535	6540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496669
62	NC_001852	ATA	2	6	6601	6606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496669
63	NC_001852	TAC	2	6	6640	6645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496669
64	NC_001852	TAA	3	9	6756	6764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496670
65	NC_001852	GAA	2	6	6803	6808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496670
66	NC_001852	GAT	2	6	6863	6868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496670
67	NC_001852	GAA	2	6	7040	7045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496670
68	NC_001852	TGA	2	6	7089	7094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496670
69	NC_001852	TAA	2	6	7125	7130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496670
70	NC_001852	CAC	2	6	7131	7136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496670
71	NC_001852	TTA	2	6	7242	7247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496670
72	NC_001852	AGA	2	6	7255	7260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496670
73	NC_001852	TTG	2	6	11192	11197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496690
74	NC_001852	CGA	2	6	11209	11214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496690
75	NC_001852	TTG	2	6	11266	11271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496690
76	NC_001852	TCT	3	9	11400	11408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496690
77	NC_001852	TTG	2	6	11491	11496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496690
78	NC_001852	CCT	2	6	11497	11502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	364556647
79	NC_001852	GAA	2	6	11510	11515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556647
80	NC_001852	CCA	2	6	11644	11649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556647
81	NC_001852	ATT	2	6	11750	11755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556647
82	NC_001852	TTA	2	6	11817	11822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556647
83	NC_001852	GTT	2	6	11904	11909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556647
84	NC_001852	TTG	2	6	11929	11934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556647
85	NC_001852	TCA	2	6	11991	11996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556647
86	NC_001852	TAG	2	6	12042	12047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556647
87	NC_001852	TAC	2	6	12052	12057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556647
88	NC_001852	CTT	2	6	12058	12063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556647
89	NC_001852	TAG	2	6	12190	12195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556647
90	NC_001852	ATT	3	9	12215	12223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556647
91	NC_001852	AAT	2	6	12455	12460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496676
92	NC_001852	GTT	2	6	12676	12681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496676
93	NC_001852	TTC	2	6	12735	12740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496676
94	NC_001852	TCT	2	6	12820	12825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556648
95	NC_001852	CTG	2	6	12847	12852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	364556648
96	NC_001852	TGC	2	6	12872	12877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	364556648
97	NC_001852	GTT	3	9	12914	12922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556648
98	NC_001852	TCT	2	6	12999	13004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556648
99	NC_001852	ATT	2	6	13310	13315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496677
100	NC_001852	ATA	2	6	13470	13475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496677
101	NC_001852	CTT	2	6	13543	13548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496678
102	NC_001852	ATT	2	6	13563	13568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496678
103	NC_001852	CTG	2	6	13570	13575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496678
104	NC_001852	TGA	2	6	13607	13612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496678
105	NC_001852	ACA	2	6	13639	13644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496678
106	NC_001852	CTT	2	6	13741	13746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496678
107	NC_001852	TAA	2	6	13781	13786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496678
108	NC_001852	TCA	2	6	13827	13832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496678
109	NC_001852	GAA	2	6	14123	14128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496678
110	NC_001852	TAC	2	6	14131	14136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496678
111	NC_001852	ATA	2	6	14210	14215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496678
112	NC_001852	ATC	2	6	14241	14246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496678
113	NC_001852	TAT	2	6	14288	14293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496678
114	NC_001852	ACT	2	6	14437	14442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496679
115	NC_001852	AAG	2	6	14527	14532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496679
116	NC_001852	TGA	2	6	14771	14776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496679
117	NC_001852	TAA	2	6	14939	14944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496680
118	NC_001852	TGT	2	6	15068	15073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496680
119	NC_001852	TCT	2	6	15286	15291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496680
120	NC_001852	TTC	2	6	15342	15347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496680
121	NC_001852	TCA	2	6	15575	15580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496681
122	NC_001852	TGA	2	6	15666	15671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496681
123	NC_001852	ATC	2	6	15865	15870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496681
124	NC_001852	ATC	2	6	15884	15889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496681
125	NC_001852	ATT	2	6	16000	16005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496681
126	NC_001852	ATA	2	6	16046	16051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496681
127	NC_001852	TGC	2	6	16053	16058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496681
128	NC_001852	AGA	2	6	16087	16092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496681
129	NC_001852	CAA	2	6	16149	16154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496681
130	NC_001852	ATC	2	6	16210	16215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496681
131	NC_001852	ACT	2	6	16226	16231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496681
132	NC_001852	ATT	2	6	16297	16302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496681
133	NC_001852	AAT	2	6	16307	16312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496681
134	NC_001852	CAT	2	6	16323	16328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496681
135	NC_001852	TCT	2	6	16576	16581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496682
136	NC_001852	TCA	2	6	16591	16596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496682
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139	NC_001852	TTA	2	6	16798	16803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496682
140	NC_001852	TAC	2	6	16841	16846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496682
141	NC_001852	TAA	2	6	16856	16861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496682
142	NC_001852	TTC	2	6	16883	16888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496682
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164	NC_001852	CTT	2	6	18499	18504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496683
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254	NC_001852	AAG	2	6	26021	26026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556649
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256	NC_001852	AGA	2	6	26164	26169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556649
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.