MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-2

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001852	AT	3	6	44	49	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001852	AT	4	8	80	87	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001852	TA	3	6	135	140	50 %	50 %	0 %	0 %	11496686
4	NC_001852	TA	3	6	267	272	50 %	50 %	0 %	0 %	11496686
5	NC_001852	AG	3	6	820	825	50 %	0 %	50 %	0 %	11496686
6	NC_001852	TA	3	6	1350	1355	50 %	50 %	0 %	0 %	11496666
7	NC_001852	GA	3	6	1377	1382	50 %	0 %	50 %	0 %	11496666
8	NC_001852	CT	3	6	2670	2675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_001852	AT	3	6	4021	4026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001852	TA	4	8	4246	4253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001852	AT	3	6	5480	5485	50 %	50 %	0 %	0 %	11496668
12	NC_001852	CA	3	6	5486	5491	50 %	0 %	0 %	50 %	11496668
13	NC_001852	TA	3	6	6272	6277	50 %	50 %	0 %	0 %	11496669
14	NC_001852	AG	3	6	6720	6725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001852	TA	3	6	7311	7316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001852	AT	3	6	7742	7747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001852	TA	3	6	9960	9965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001852	TC	3	6	10147	10152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_001852	TA	3	6	11792	11797	50 %	50 %	0 %	0 %	364556647
20	NC_001852	GA	3	6	13213	13218	50 %	0 %	50 %	0 %	11496677
21	NC_001852	TG	3	6	16203	16208	0 %	50 %	50 %	0 %	11496681
22	NC_001852	CA	4	8	16979	16986	50 %	0 %	0 %	50 %	11496682
23	NC_001852	AC	3	6	17154	17159	50 %	0 %	0 %	50 %	11496682
24	NC_001852	TC	3	6	17251	17256	0 %	50 %	0 %	50 %	11496682
25	NC_001852	AT	3	6	18053	18058	50 %	50 %	0 %	0 %	11496683
26	NC_001852	AG	3	6	18715	18720	50 %	0 %	50 %	0 %	11496683
27	NC_001852	GT	3	6	19718	19723	0 %	50 %	50 %	0 %	364556646
28	NC_001852	TG	3	6	19864	19869	0 %	50 %	50 %	0 %	364556646
29	NC_001852	AT	3	6	20321	20326	50 %	50 %	0 %	0 %	364556646
30	NC_001852	GT	3	6	20839	20844	0 %	50 %	50 %	0 %	364556646
31	NC_001852	AT	3	6	21019	21024	50 %	50 %	0 %	0 %	364556646
32	NC_001852	TC	3	6	21412	21417	0 %	50 %	0 %	50 %	364556646
33	NC_001852	AT	3	6	24332	24337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001852	AT	3	6	24485	24490	50 %	50 %	0 %	0 %	11496672
35	NC_001852	TA	3	6	24906	24911	50 %	50 %	0 %	0 %	11496672
36	NC_001852	GA	3	6	25824	25829	50 %	0 %	50 %	0 %	11496672
37	NC_001852	AT	3	6	26219	26224	50 %	50 %	0 %	0 %	364556649
38	NC_001852	AT	3	6	26290	26295	50 %	50 %	0 %	0 %	364556649
39	NC_001852	AG	3	6	26641	26646	50 %	0 %	50 %	0 %	364556645
40	NC_001852	GT	3	6	26829	26834	0 %	50 %	50 %	0 %	364556645
41	NC_001852	AG	3	6	27796	27801	50 %	0 %	50 %	0 %	11496674
42	NC_001852	AT	3	6	28073	28078	50 %	50 %	0 %	0 %	11496675
43	NC_001852	AT	3	6	28284	28289	50 %	50 %	0 %	0 %	11496675
44	NC_001852	AT	3	6	28371	28376	50 %	50 %	0 %	0 %	11496675
45	NC_001852	TA	3	6	29627	29632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.