MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp28-1

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001851	ATT	2	6	472	477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823338
2	NC_001851	CTT	2	6	587	592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365823338
3	NC_001851	AGA	2	6	640	645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
4	NC_001851	GAA	2	6	851	856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
5	NC_001851	GAA	2	6	893	898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
6	NC_001851	AGT	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823338
7	NC_001851	TAA	2	6	1033	1038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823338
8	NC_001851	ATA	2	6	1077	1082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823338
9	NC_001851	GAA	2	6	1139	1144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
10	NC_001851	TAA	2	6	1186	1191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823338
11	NC_001851	TGG	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365823338
12	NC_001851	AGA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
13	NC_001851	AAG	2	6	1279	1284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
14	NC_001851	AGA	2	6	1360	1365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
15	NC_001851	AAT	2	6	1421	1426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823338
16	NC_001851	GAA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823338
17	NC_001851	CTT	2	6	1779	1784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496642
18	NC_001851	AAT	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496642
19	NC_001851	ATT	2	6	1877	1882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496642
20	NC_001851	CTA	2	6	1910	1915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496642
21	NC_001851	GAC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11496641
22	NC_001851	ACT	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496641
23	NC_001851	AAC	2	6	2179	2184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496641
24	NC_001851	TAG	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496641
25	NC_001851	TAG	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496641
26	NC_001851	TAA	2	6	2570	2575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496641
27	NC_001851	GTT	2	6	2604	2609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496641
28	NC_001851	TAA	2	6	3262	3267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496640
29	NC_001851	ACA	2	6	3286	3291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496640
30	NC_001851	GCT	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496640
31	NC_001851	AGT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496640
32	NC_001851	TTA	2	6	4294	4299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823339
33	NC_001851	AGA	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823339
34	NC_001851	AGA	2	6	4356	4361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823339
35	NC_001851	GCA	2	6	4362	4367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365823339
36	NC_001851	ACA	2	6	4377	4382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365823339
37	NC_001851	AAG	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823339
38	NC_001851	TCC	2	6	7393	7398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	365823340
39	NC_001851	GTA	2	6	7471	7476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823340
40	NC_001851	TCT	2	6	7484	7489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365823340
41	NC_001851	ATA	2	6	7521	7526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823340
42	NC_001851	GAA	2	6	7614	7619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823340
43	NC_001851	TCA	2	6	7856	7861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365823340
44	NC_001851	ATT	2	6	8911	8916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823341
45	NC_001851	TTA	2	6	8917	8922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823341
46	NC_001851	TTA	2	6	9016	9021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823341
47	NC_001851	TAT	2	6	10727	10732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823342
48	NC_001851	AGA	2	6	10758	10763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823342
49	NC_001851	TAT	2	6	10781	10786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823342
50	NC_001851	ATC	2	6	10887	10892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365823342
51	NC_001851	TTC	2	6	12453	12458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496647
52	NC_001851	CTA	2	6	12634	12639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496647
53	NC_001851	ATC	2	6	12762	12767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496647
54	NC_001851	TTC	2	6	12866	12871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496647
55	NC_001851	TCA	2	6	12904	12909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496647
56	NC_001851	ATT	2	6	12921	12926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496647
57	NC_001851	CTT	2	6	13058	13063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496646
58	NC_001851	TAA	2	6	13217	13222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496646
59	NC_001851	CTT	2	6	13274	13279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496646
60	NC_001851	TAT	2	6	13338	13343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496646
61	NC_001851	ACA	2	6	13373	13378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496646
62	NC_001851	AGG	2	6	13392	13397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496646
63	NC_001851	ATT	3	9	13422	13430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496646
64	NC_001851	TAA	2	6	13458	13463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496646
65	NC_001851	TCT	2	6	13483	13488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496646
66	NC_001851	ATT	3	9	13533	13541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496646
67	NC_001851	GTA	2	6	13593	13598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496646
68	NC_001851	AAT	2	6	13716	13721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496646
69	NC_001851	TTA	2	6	13766	13771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496646
70	NC_001851	TCC	2	6	13805	13810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496645
71	NC_001851	ATT	2	6	13860	13865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496645
72	NC_001851	TAA	2	6	13912	13917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496645
73	NC_001851	TGT	2	6	14006	14011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496645
74	NC_001851	ATA	2	6	14063	14068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496645
75	NC_001851	TCA	2	6	14082	14087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496645
76	NC_001851	TTA	2	6	14130	14135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496645
77	NC_001851	TTA	2	6	14178	14183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496645
78	NC_001851	TAA	2	6	14315	14320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496645
79	NC_001851	TTA	2	6	14382	14387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496644
80	NC_001851	AAT	2	6	14467	14472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496644
81	NC_001851	ATT	2	6	14543	14548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496644
82	NC_001851	TCT	2	6	14620	14625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496644
83	NC_001851	CTT	2	6	14752	14757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496644
84	NC_001851	TTG	2	6	14777	14782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496644
85	NC_001851	CTT	2	6	15013	15018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496644
86	NC_001851	TAT	2	6	15019	15024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496644
87	NC_001851	ACT	2	6	15059	15064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496644
88	NC_001851	TTA	2	6	15081	15086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496644
89	NC_001851	CTT	2	6	15295	15300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496644
90	NC_001851	TCT	2	6	15311	15316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496644
91	NC_001851	TAT	3	9	15319	15327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496644
92	NC_001851	TAA	2	6	15333	15338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496644
93	NC_001851	ATT	2	6	17126	17131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823343
94	NC_001851	AAT	2	6	17135	17140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823343
95	NC_001851	AAC	2	6	27032	27037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365823345
96	NC_001851	TTA	2	6	27049	27054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823345
97	NC_001851	GAC	2	6	27081	27086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365823345
98	NC_001851	CAA	2	6	27088	27093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365823345
99	NC_001851	TGG	2	6	27155	27160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365823345
100	NC_001851	TAG	2	6	27163	27168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823345
101	NC_001851	TAC	2	6	27224	27229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365823345
102	NC_001851	AGT	2	6	27297	27302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823345
103	NC_001851	ACG	2	6	27303	27308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365823345
104	NC_001851	GTT	2	6	27374	27379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365823345
105	NC_001851	CTG	2	6	27430	27435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823345
106	NC_001851	TTG	2	6	27523	27528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365823345
107	NC_001851	GCT	2	6	27531	27536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823345
108	NC_001851	TGC	3	9	27563	27571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823345
109	NC_001851	AAT	2	6	27582	27587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823345
110	NC_001851	GTT	2	6	27602	27607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365823345
111	NC_001851	TGC	3	9	27620	27628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823345
112	NC_001851	GCT	2	6	27645	27650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823345
113	NC_001851	GGC	2	6	27656	27661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	365823345
114	NC_001851	GCT	2	6	27714	27719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823345
115	NC_001851	AAG	2	6	27741	27746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823345
116	NC_001851	GAG	2	6	27750	27755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	365823345
117	NC_001851	TGC	3	9	27770	27778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823345
118	NC_001851	GAT	2	6	27831	27836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823345
119	NC_001851	TGC	3	9	27842	27850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823345
120	NC_001851	GCT	2	6	27936	27941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823345
121	NC_001851	GCT	2	6	28035	28040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823345
122	NC_001851	CCT	2	6	28053	28058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	365823345

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.