MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp25

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001850	ATTTT	2	10	296	305	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001850	AAGTA	2	10	582	591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001850	AATTC	2	10	1284	1293	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_001850	TAAAT	2	10	1598	1607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001850	AATTC	2	10	1896	1905	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_001850	AGTCA	2	10	2710	2719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_001850	TAAAA	2	10	3298	3307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001850	ATTAC	2	10	3500	3509	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_001850	ACTCC	2	10	3905	3914	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_001850	ACAAA	2	10	4524	4533	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_001850	CAAAT	2	10	4728	4737	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_001850	TCTAA	2	10	5836	5845	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_001850	ACAAA	2	10	8640	8649	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_001850	TTAAA	2	10	9559	9568	60 %	40 %	0 %	0 %	11496635
15	NC_001850	TTATT	2	10	10343	10352	20 %	80 %	0 %	0 %	364556622
16	NC_001850	TTTAA	2	10	10573	10582	40 %	60 %	0 %	0 %	364556622
17	NC_001850	TAGAA	2	10	10802	10811	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001850	TCATT	2	10	12073	12082	20 %	60 %	0 %	20 %	11496613
19	NC_001850	TGTTT	2	10	12650	12659	0 %	80 %	20 %	0 %	11496614
20	NC_001850	TTTCA	2	10	13385	13394	20 %	60 %	0 %	20 %	11496608
21	NC_001850	TTTAA	2	10	14913	14922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001850	TTTAT	2	10	15886	15895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001850	TTTAA	2	10	16090	16099	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001850	TAAAT	2	10	18168	18177	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001850	TAGAA	2	10	18278	18287	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001850	TAATA	2	10	18313	18322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001850	ATTTT	2	10	19184	19193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001850	TTAAA	2	10	19891	19900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001850	TGTTT	2	10	21289	21298	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001850	TTATT	2	10	21645	21654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001850	TATAA	2	10	22687	22696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001850	GGAAT	2	10	22838	22847	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.