MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp25

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001850	TTAT	2	8	323	330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001850	CAAG	2	8	433	440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_001850	TTGC	2	8	906	913	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_001850	TATC	2	8	985	992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_001850	CTTT	2	8	1008	1015	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_001850	ATTC	2	8	1537	1544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_001850	TTAA	2	8	2073	2080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001850	TTTC	2	8	2743	2750	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_001850	GCTA	2	8	3328	3335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_001850	TCTT	2	8	3523	3530	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_001850	AAAC	2	8	3552	3559	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_001850	TTAA	2	8	4245	4252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001850	TATT	2	8	4536	4543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001850	TATT	2	8	4684	4691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001850	TAAT	2	8	5057	5064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001850	GAAG	2	8	5380	5387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001850	ATTT	2	8	5911	5918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001850	CATA	2	8	6063	6070	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_001850	ATTT	2	8	6116	6123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001850	ATTT	2	8	8204	8211	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001850	AATT	2	8	8470	8477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001850	TTTA	2	8	8507	8514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001850	AAAT	2	8	8652	8659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001850	TTTA	2	8	8666	8673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001850	TTAA	2	8	8721	8728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001850	TATT	2	8	8850	8857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001850	ATTT	2	8	8879	8886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001850	ATAA	3	12	9394	9405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001850	AATA	2	8	10738	10745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001850	TGAT	2	8	11024	11031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001850	TTAT	2	8	11074	11081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001850	ATTT	2	8	11303	11310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001850	ATTA	2	8	15774	15781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001850	TCAT	2	8	15849	15856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_001850	ATTA	2	8	15945	15952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001850	ATCT	2	8	16193	16200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_001850	CAAT	2	8	16267	16274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_001850	TAAA	2	8	16427	16434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001850	TAAG	2	8	16721	16728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001850	TTTA	2	8	16852	16859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001850	AAAT	2	8	16885	16892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001850	CATA	2	8	17194	17201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_001850	AAAT	2	8	17497	17504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001850	TAAA	2	8	18564	18571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001850	AATT	2	8	18934	18941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001850	AAGA	3	12	19158	19169	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001850	AGAA	2	8	19174	19181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001850	AGCA	2	8	19226	19233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_001850	TATT	2	8	19359	19366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001850	ATTA	2	8	19612	19619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001850	AGAT	2	8	19655	19662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001850	GAAA	2	8	20120	20127	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001850	AACA	2	8	20496	20503	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_001850	AAGA	2	8	20597	20604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001850	ATTT	2	8	21136	21143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001850	TAAT	2	8	21697	21704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001850	ATTC	2	8	22871	22878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_001850	ATTT	2	8	22881	22888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001850	AGTT	2	8	23026	23033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001850	ATTG	2	8	23418	23425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001850	TATG	2	8	23554	23561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001850	GATT	2	8	23942	23949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001850	TGCA	2	8	24147	24154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.