MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp25

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001850	ATT	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496612
2	NC_001850	CCA	2	6	6964	6969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496612
3	NC_001850	ATA	2	6	7046	7051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
4	NC_001850	AAT	2	6	7075	7080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
5	NC_001850	AAG	2	6	7121	7126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496612
6	NC_001850	ATA	2	6	7205	7210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
7	NC_001850	AAG	2	6	7343	7348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496612
8	NC_001850	ATA	2	6	7363	7368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496612
9	NC_001850	ATT	2	6	7559	7564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496612
10	NC_001850	ATG	2	6	7682	7687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496612
11	NC_001850	TGA	2	6	7749	7754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496612
12	NC_001850	ATG	2	6	7755	7760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496612
13	NC_001850	TGC	2	6	9781	9786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496635
14	NC_001850	ATT	2	6	9804	9809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496635
15	NC_001850	ATC	2	6	9955	9960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496635
16	NC_001850	TCA	2	6	10051	10056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496635
17	NC_001850	ATC	2	6	10068	10073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496635
18	NC_001850	CAA	2	6	10082	10087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496635
19	NC_001850	TAT	2	6	10091	10096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496635
20	NC_001850	TAA	2	6	10185	10190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496635
21	NC_001850	ATT	2	6	10281	10286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556622
22	NC_001850	TCA	2	6	10291	10296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556622
23	NC_001850	TCT	2	6	10327	10332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556622
24	NC_001850	AAT	2	6	10394	10399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556622
25	NC_001850	GAT	2	6	10436	10441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556622
26	NC_001850	CGT	2	6	10532	10537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	364556622
27	NC_001850	AAC	2	6	10623	10628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556622
28	NC_001850	TTC	2	6	10629	10634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556622
29	NC_001850	CTG	2	6	10660	10665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	364556622
30	NC_001850	TAA	2	6	10671	10676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556622
31	NC_001850	ATT	2	6	10693	10698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556622
32	NC_001850	TTC	2	6	11546	11551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496613
33	NC_001850	TCT	2	6	11622	11627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496613
34	NC_001850	CTT	2	6	11761	11766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496613
35	NC_001850	ATT	2	6	11940	11945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496613
36	NC_001850	TCA	2	6	11985	11990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496613
37	NC_001850	ATC	2	6	12243	12248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496614
38	NC_001850	TTA	2	6	12254	12259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496614
39	NC_001850	GTT	2	6	12282	12287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496614
40	NC_001850	TAA	2	6	12354	12359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496614
41	NC_001850	ATT	2	6	12400	12405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496614
42	NC_001850	AAT	2	6	12438	12443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496614
43	NC_001850	TAT	3	9	12465	12473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496614
44	NC_001850	TAA	2	6	12492	12497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496614
45	NC_001850	ATT	2	6	12588	12593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496614
46	NC_001850	GAA	2	6	12610	12615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496614
47	NC_001850	TTC	2	6	12678	12683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496614
48	NC_001850	AGA	2	6	12736	12741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496614
49	NC_001850	CCT	2	6	12802	12807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496614
50	NC_001850	TCC	2	6	12863	12868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496608
51	NC_001850	CTT	2	6	12987	12992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496608
52	NC_001850	AAT	2	6	13194	13199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496608
53	NC_001850	ATT	2	6	13344	13349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496608
54	NC_001850	ATT	2	6	13469	13474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496609
55	NC_001850	TGT	2	6	13541	13546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496609
56	NC_001850	TTA	2	6	13629	13634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496609
57	NC_001850	CTT	2	6	13768	13773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496609
58	NC_001850	TTA	2	6	13774	13779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496609
59	NC_001850	ATA	2	6	13871	13876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496609
60	NC_001850	TTG	2	6	13909	13914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496609
61	NC_001850	TAA	3	9	13936	13944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496609
62	NC_001850	TTA	2	6	14001	14006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496609
63	NC_001850	TAT	2	6	14050	14055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496609
64	NC_001850	TAG	2	6	14165	14170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496609
65	NC_001850	TAG	2	6	14205	14210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496609
66	NC_001850	TAG	2	6	14244	14249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496609
67	NC_001850	AGT	2	6	14284	14289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496609
68	NC_001850	CTT	2	6	14311	14316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496609
69	NC_001850	TTA	2	6	14388	14393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496609
70	NC_001850	TTA	2	6	14460	14465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496609
71	NC_001850	CCT	2	6	14479	14484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11496609
72	NC_001850	ATA	2	6	14516	14521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496609
73	NC_001850	ATT	2	6	15118	15123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556621
74	NC_001850	CTT	2	6	15145	15150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556621
75	NC_001850	TTA	2	6	15161	15166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556621
76	NC_001850	ATC	2	6	15309	15314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556621
77	NC_001850	TGG	2	6	15497	15502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556621
78	NC_001850	AAT	2	6	15504	15509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556621
79	NC_001850	AAT	2	6	15518	15523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556621
80	NC_001850	TTG	2	6	21977	21982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496611
81	NC_001850	ATC	2	6	22068	22073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496611
82	NC_001850	TAA	2	6	22083	22088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496611
83	NC_001850	ATA	2	6	22127	22132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496611
84	NC_001850	TTC	2	6	22232	22237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496611
85	NC_001850	AGG	2	6	22261	22266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496611
86	NC_001850	TAT	2	6	22376	22381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496611
87	NC_001850	ATG	2	6	22397	22402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496611
88	NC_001850	TTC	3	9	22452	22460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496611
89	NC_001850	ATC	2	6	22518	22523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496611
90	NC_001850	TTA	2	6	22546	22551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496611
91	NC_001850	TAA	2	6	22569	22574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496611
92	NC_001850	ATT	2	6	22587	22592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496611

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.