MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp17

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001849	AAAT	2	8	324	331	75 %	25 %	0 %	0 %	365823333
2	NC_001849	AAAG	2	8	513	520	75 %	0 %	25 %	0 %	11496586
3	NC_001849	ATAC	2	8	686	693	50 %	25 %	0 %	25 %	11496586
4	NC_001849	AATA	2	8	1118	1125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001849	ATAA	2	8	1381	1388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001849	ATAG	2	8	1569	1576	50 %	25 %	25 %	0 %	11496585
7	NC_001849	ATTA	2	8	1893	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001849	ATGG	2	8	2291	2298	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001849	TAAT	2	8	2932	2939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001849	TAAT	2	8	4042	4049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001849	ACAA	2	8	4097	4104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_001849	CATT	2	8	4174	4181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_001849	TTTA	2	8	4288	4295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001849	ATAA	3	12	4490	4501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001849	ATTA	2	8	5173	5180	50 %	50 %	0 %	0 %	11496595
16	NC_001849	TCTA	2	8	5186	5193	25 %	50 %	0 %	25 %	11496595
17	NC_001849	AATC	2	8	5250	5257	50 %	25 %	0 %	25 %	11496595
18	NC_001849	AATG	2	8	5320	5327	50 %	25 %	25 %	0 %	11496595
19	NC_001849	CAAT	2	8	5435	5442	50 %	25 %	0 %	25 %	11496595
20	NC_001849	CTAA	2	8	6241	6248	50 %	25 %	0 %	25 %	11496594
21	NC_001849	AAAT	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	11496594
22	NC_001849	TATT	2	8	6477	6484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001849	TAAT	2	8	6523	6530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001849	TACT	2	8	6708	6715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_001849	CAAA	2	8	6790	6797	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_001849	AGAA	2	8	7440	7447	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001849	GAAA	2	8	8003	8010	75 %	0 %	25 %	0 %	11496592
28	NC_001849	ACAA	2	8	8466	8473	75 %	0 %	0 %	25 %	11496591
29	NC_001849	ATCA	2	8	8563	8570	50 %	25 %	0 %	25 %	11496591
30	NC_001849	ATAA	2	8	8927	8934	75 %	25 %	0 %	0 %	11496591
31	NC_001849	TAAA	2	8	9234	9241	75 %	25 %	0 %	0 %	11496591
32	NC_001849	AGTA	2	8	9310	9317	50 %	25 %	25 %	0 %	11496591
33	NC_001849	AATT	2	8	9374	9381	50 %	50 %	0 %	0 %	11496591
34	NC_001849	ATCT	2	8	9786	9793	25 %	50 %	0 %	25 %	365823335
35	NC_001849	TTAT	2	8	9805	9812	25 %	75 %	0 %	0 %	365823335
36	NC_001849	TTTC	2	8	9891	9898	0 %	75 %	0 %	25 %	365823335
37	NC_001849	TAAA	2	8	10207	10214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001849	ATTA	2	8	10223	10230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001849	TTTA	2	8	10371	10378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001849	AGAT	2	8	10387	10394	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001849	TTAT	2	8	10529	10536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001849	TAAG	2	8	10568	10575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001849	AAAT	2	8	10632	10639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001849	ATTT	2	8	11539	11546	25 %	75 %	0 %	0 %	11496588
45	NC_001849	AAAG	2	8	11581	11588	75 %	0 %	25 %	0 %	11496588
46	NC_001849	TAAA	2	8	11724	11731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001849	AAAT	2	8	11888	11895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001849	ATTT	2	8	11924	11931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001849	AATT	2	8	12017	12024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001849	GTAA	2	8	12041	12048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001849	ACCA	2	8	12188	12195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_001849	AGAT	2	8	12262	12269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001849	AAAT	2	8	12309	12316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001849	ATAA	2	8	12317	12324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001849	AAGC	2	8	12465	12472	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_001849	TTAT	2	8	12649	12656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001849	TAAT	2	8	13152	13159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001849	TAAT	2	8	13173	13180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001849	TAAT	2	8	13194	13201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001849	TAAT	2	8	13215	13222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001849	TAAT	2	8	13236	13243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001849	TAAT	2	8	13257	13264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001849	TAAT	2	8	13278	13285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001849	TAAT	2	8	13299	13306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001849	TTAT	2	8	13410	13417	25 %	75 %	0 %	0 %	11496587
66	NC_001849	AGCA	2	8	13457	13464	50 %	0 %	25 %	25 %	11496587
67	NC_001849	GATG	2	8	13533	13540	25 %	25 %	50 %	0 %	11496587
68	NC_001849	TTTG	2	8	13661	13668	0 %	75 %	25 %	0 %	11496587
69	NC_001849	ATTT	2	8	14438	14445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001849	ATAA	2	8	14544	14551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001849	AAAT	2	8	15016	15023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001849	GATT	2	8	15070	15077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001849	AATT	2	8	15593	15600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001849	CTTT	2	8	15676	15683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_001849	CAAT	2	8	15873	15880	50 %	25 %	0 %	25 %	365823336
76	NC_001849	ATTG	2	8	15901	15908	25 %	50 %	25 %	0 %	11496597
77	NC_001849	TAAT	2	8	15957	15964	50 %	50 %	0 %	0 %	11496597
78	NC_001849	TTTA	2	8	16402	16409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001849	TAAA	2	8	16416	16423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.