MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp17

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001849	ATT	2	6	220	225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823333
2	NC_001849	ATT	2	6	233	238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823333
3	NC_001849	TTA	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823333
4	NC_001849	AAT	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823333
5	NC_001849	GTC	2	6	334	339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365823333
6	NC_001849	ATT	2	6	396	401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823333
7	NC_001849	ATA	2	6	415	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496586
8	NC_001849	CTA	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496586
9	NC_001849	ATT	3	9	492	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496586
10	NC_001849	GGA	2	6	594	599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11496586
11	NC_001849	ACA	2	6	646	651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496586
12	NC_001849	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496586
13	NC_001849	TAG	4	12	728	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496586
14	NC_001849	TTA	2	6	740	745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496586
15	NC_001849	ATA	2	6	759	764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496586
16	NC_001849	ATT	2	6	786	791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496586
17	NC_001849	TAA	2	6	1471	1476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496585
18	NC_001849	ACA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496585
19	NC_001849	TAG	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496585
20	NC_001849	TTA	2	6	1617	1622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496585
21	NC_001849	AAC	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496585
22	NC_001849	TAA	2	6	1667	1672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496585
23	NC_001849	TAC	2	6	1704	1709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496585
24	NC_001849	ACT	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496585
25	NC_001849	ATG	2	6	3652	3657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823334
26	NC_001849	TTA	2	6	3667	3672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823334
27	NC_001849	ATA	2	6	3683	3688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823334
28	NC_001849	AGA	2	6	3732	3737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823334
29	NC_001849	AAG	2	6	3767	3772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823334
30	NC_001849	TCA	2	6	5380	5385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496595
31	NC_001849	ATA	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496595
32	NC_001849	TTA	2	6	5592	5597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496595
33	NC_001849	GAT	2	6	5608	5613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496595
34	NC_001849	GAA	2	6	5650	5655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496595
35	NC_001849	TTA	2	6	5717	5722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496595
36	NC_001849	CCA	2	6	5881	5886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11496594
37	NC_001849	ATC	2	6	5910	5915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496594
38	NC_001849	TTA	2	6	5938	5943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496594
39	NC_001849	CAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11496594
40	NC_001849	TGC	2	6	5985	5990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496594
41	NC_001849	TAT	2	6	5993	5998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496594
42	NC_001849	CAA	2	6	6011	6016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496594
43	NC_001849	ATA	2	6	6040	6045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496594
44	NC_001849	TGT	2	6	6087	6092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496594
45	NC_001849	TAA	2	6	6130	6135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496594
46	NC_001849	ACA	2	6	6136	6141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496594
47	NC_001849	TTA	2	6	6194	6199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496594
48	NC_001849	AAT	2	6	6323	6328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496594
49	NC_001849	AGA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496592
50	NC_001849	AGA	2	6	7940	7945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496592
51	NC_001849	AGA	2	6	7974	7979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496592
52	NC_001849	ATA	2	6	8270	8275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
53	NC_001849	TAA	2	6	8305	8310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
54	NC_001849	AGA	2	6	8323	8328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496591
55	NC_001849	ATA	2	6	8520	8525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
56	NC_001849	TAA	2	6	8530	8535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
57	NC_001849	ATA	2	6	8550	8555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
58	NC_001849	TAA	2	6	8613	8618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
59	NC_001849	ATT	2	6	8705	8710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496591
60	NC_001849	TAA	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
61	NC_001849	CAA	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496591
62	NC_001849	AAT	2	6	8804	8809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496591
63	NC_001849	TAG	2	6	8967	8972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496591
64	NC_001849	CAA	2	6	9022	9027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11496591
65	NC_001849	GAA	2	6	9086	9091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496591
66	NC_001849	GAT	2	6	9160	9165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496591
67	NC_001849	ATT	2	6	9290	9295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496591
68	NC_001849	GAA	2	6	9655	9660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365823335
69	NC_001849	TAT	3	9	9674	9682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823335
70	NC_001849	TAA	2	6	9834	9839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823335
71	NC_001849	ATA	2	6	9857	9862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823335
72	NC_001849	ATT	2	6	9910	9915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823335
73	NC_001849	ATT	2	6	9979	9984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823335
74	NC_001849	TAG	2	6	11043	11048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496588
75	NC_001849	TGT	3	9	11051	11059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11496588
76	NC_001849	TTA	2	6	11108	11113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496588
77	NC_001849	ATT	2	6	11162	11167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496588
78	NC_001849	TCT	2	6	11183	11188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496588
79	NC_001849	ATA	2	6	11242	11247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496588
80	NC_001849	TCG	2	6	11276	11281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11496588
81	NC_001849	ATT	2	6	11303	11308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496588
82	NC_001849	TAA	2	6	11349	11354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496588
83	NC_001849	GGT	2	6	13369	13374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11496587
84	NC_001849	TTC	2	6	13467	13472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11496587
85	NC_001849	GAA	2	6	13527	13532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496587
86	NC_001849	AGT	2	6	13548	13553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496587
87	NC_001849	AGA	2	6	13609	13614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496587
88	NC_001849	GAT	2	6	13654	13659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496587
89	NC_001849	GAA	2	6	13736	13741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496587
90	NC_001849	TTA	2	6	13763	13768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496587
91	NC_001849	AGA	2	6	13818	13823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496587
92	NC_001849	ATT	2	6	13873	13878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496587
93	NC_001849	TAA	2	6	13890	13895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496587
94	NC_001849	ATT	2	6	14015	14020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496587
95	NC_001849	AGA	2	6	14096	14101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11496589
96	NC_001849	ATT	2	6	14103	14108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496589
97	NC_001849	ATG	2	6	14149	14154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11496589
98	NC_001849	TTA	2	6	14155	14160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496589
99	NC_001849	TAA	2	6	14337	14342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496589
100	NC_001849	TAA	2	6	15763	15768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823336
101	NC_001849	TAG	2	6	15837	15842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823336
102	NC_001849	TTG	2	6	15848	15853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365823336
103	NC_001849	TAA	2	6	15930	15935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496597
104	NC_001849	TTA	3	9	15947	15955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496597
105	NC_001849	TAA	3	9	15994	16002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11496597
106	NC_001849	ATT	2	6	16106	16111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11496597

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.