MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid small ECE

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001733	T	7	7	640	646	0 %	100 %	0 %	0 %	10954533
2	NC_001733	T	7	7	687	693	0 %	100 %	0 %	0 %	10954533
3	NC_001733	T	6	6	1107	1112	0 %	100 %	0 %	0 %	10954533
4	NC_001733	T	7	7	1177	1183	0 %	100 %	0 %	0 %	10954533
5	NC_001733	T	6	6	1378	1383	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
6	NC_001733	T	6	6	1753	1758	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
7	NC_001733	T	6	6	1897	1902	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
8	NC_001733	T	6	6	1968	1973	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
9	NC_001733	T	7	7	2177	2183	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
10	NC_001733	T	7	7	2186	2192	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
11	NC_001733	T	6	6	2235	2240	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
12	NC_001733	T	6	6	2307	2312	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
13	NC_001733	T	7	7	2636	2642	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
14	NC_001733	T	6	6	2837	2842	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
15	NC_001733	T	6	6	2859	2864	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
16	NC_001733	T	7	7	2868	2874	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
17	NC_001733	A	6	6	3625	3630	100 %	0 %	0 %	0 %	10954534
18	NC_001733	T	6	6	3846	3851	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
19	NC_001733	T	6	6	3951	3956	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
20	NC_001733	T	6	6	4008	4013	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
21	NC_001733	T	6	6	4047	4052	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
22	NC_001733	T	6	6	4128	4133	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
23	NC_001733	T	6	6	4245	4250	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
24	NC_001733	T	6	6	4428	4433	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
25	NC_001733	T	6	6	4530	4535	0 %	100 %	0 %	0 %	10954534
26	NC_001733	A	6	6	4824	4829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001733	T	6	6	4951	4956	0 %	100 %	0 %	0 %	10954535
28	NC_001733	T	6	6	4977	4982	0 %	100 %	0 %	0 %	10954535
29	NC_001733	T	6	6	5028	5033	0 %	100 %	0 %	0 %	10954535
30	NC_001733	A	6	6	5097	5102	100 %	0 %	0 %	0 %	10954535
31	NC_001733	T	6	6	5401	5406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001733	T	6	6	5747	5752	0 %	100 %	0 %	0 %	10954536
33	NC_001733	T	6	6	5809	5814	0 %	100 %	0 %	0 %	10954536
34	NC_001733	A	6	6	6246	6251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001733	T	6	6	6427	6432	0 %	100 %	0 %	0 %	10954537
36	NC_001733	T	6	6	6435	6440	0 %	100 %	0 %	0 %	10954537
37	NC_001733	T	6	6	7428	7433	0 %	100 %	0 %	0 %	10954538
38	NC_001733	T	6	6	9875	9880	0 %	100 %	0 %	0 %	10954540
39	NC_001733	T	6	6	10958	10963	0 %	100 %	0 %	0 %	10954540
40	NC_001733	T	6	6	10970	10975	0 %	100 %	0 %	0 %	10954540
41	NC_001733	T	6	6	11021	11026	0 %	100 %	0 %	0 %	10954540
42	NC_001733	T	7	7	11263	11269	0 %	100 %	0 %	0 %	10954540
43	NC_001733	T	6	6	11292	11297	0 %	100 %	0 %	0 %	10954540
44	NC_001733	A	6	6	12460	12465	100 %	0 %	0 %	0 %	10954541
45	NC_001733	T	8	8	12562	12569	0 %	100 %	0 %	0 %	10954541
46	NC_001733	T	6	6	12715	12720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001733	T	7	7	13275	13281	0 %	100 %	0 %	0 %	10954542
48	NC_001733	T	7	7	13618	13624	0 %	100 %	0 %	0 %	10954542
49	NC_001733	T	7	7	13697	13703	0 %	100 %	0 %	0 %	10954542
50	NC_001733	T	6	6	13822	13827	0 %	100 %	0 %	0 %	10954542
51	NC_001733	T	6	6	13852	13857	0 %	100 %	0 %	0 %	10954542
52	NC_001733	A	6	6	14236	14241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001733	A	6	6	14869	14874	100 %	0 %	0 %	0 %	161579527
54	NC_001733	A	6	6	15083	15088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001733	A	6	6	15199	15204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001733	T	7	7	15289	15295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001733	T	6	6	15514	15519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001733	T	6	6	15978	15983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001733	T	7	7	16488	16494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.