MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid large ECE

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001732	ATAATT	2	12	1905	1916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001732	ATCATT	2	12	2201	2212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10954496
3	NC_001732	ACAAAA	2	12	2294	2305	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10954496
4	NC_001732	ATGATA	2	12	3045	3056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10954496
5	NC_001732	AAGAAC	2	12	4351	4362	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_001732	ATTTTT	2	12	6402	6413	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10954499
7	NC_001732	GCTTTG	2	12	13065	13076	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	18656943
8	NC_001732	AACCCA	2	12	18528	18539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_001732	CCTAAT	2	12	18776	18787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_001732	AAAATA	2	12	20395	20406	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001732	AGGGGA	2	12	20436	20447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001732	TATGAA	2	12	22109	22120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001732	TATTTC	2	12	23328	23339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10954510
14	NC_001732	TACATT	2	12	23747	23758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10954510
15	NC_001732	AGCATA	2	12	25895	25906	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10954512
16	NC_001732	TTCATT	2	12	32215	32226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10954517
17	NC_001732	TCATCT	2	12	32726	32737	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	10954517
18	NC_001732	AATTTT	2	12	37698	37709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954492
19	NC_001732	TATCAT	2	12	39796	39807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10954519
20	NC_001732	TTTATC	2	12	40602	40613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10954520
21	NC_001732	TTAATT	2	12	43893	43904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954522
22	NC_001732	AAAATA	2	12	45207	45218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001732	AAAATG	2	12	47295	47306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10954525
24	NC_001732	TTTTCA	2	12	48158	48169	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_001732	TTTAAC	2	12	48231	48242	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_001732	ATTATG	2	12	51272	51283	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10954527
27	NC_001732	TTTATA	2	12	51790	51801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954527
28	NC_001732	ATCTTC	2	12	55587	55598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	10954529
29	NC_001732	TTAGAT	2	12	55855	55866	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10954529
30	NC_001732	TTATTG	2	12	56263	56274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10954530
31	NC_001732	GATTTT	2	12	56346	56357	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10954530
32	NC_001732	ATAGAT	2	12	57560	57571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10954531
33	NC_001732	CTAAAA	2	12	58339	58350	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.