MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid large ECE

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001732	TTTTA	2	10	2822	2831	20 %	80 %	0 %	0 %	10954496
2	NC_001732	ACCTT	2	10	6950	6959	20 %	40 %	0 %	40 %	10954499
3	NC_001732	CATTG	2	10	8029	8038	20 %	40 %	20 %	20 %	10954500
4	NC_001732	ATGGT	2	10	8358	8367	20 %	40 %	40 %	0 %	10954501
5	NC_001732	CAAAA	2	10	9355	9364	80 %	0 %	0 %	20 %	10954503
6	NC_001732	GATTG	2	10	10888	10897	20 %	40 %	40 %	0 %	10954504
7	NC_001732	AAAAG	2	10	11969	11978	80 %	0 %	20 %	0 %	10954504
8	NC_001732	AAAAC	2	10	12473	12482	80 %	0 %	0 %	20 %	10954504
9	NC_001732	TTAAC	2	10	15036	15045	40 %	40 %	0 %	20 %	10954505
10	NC_001732	TTTAT	2	10	15517	15526	20 %	80 %	0 %	0 %	10954506
11	NC_001732	TAAAT	2	10	15872	15881	60 %	40 %	0 %	0 %	10954506
12	NC_001732	TTTGG	2	10	16511	16520	0 %	60 %	40 %	0 %	10954506
13	NC_001732	CAATA	2	10	21254	21263	60 %	20 %	0 %	20 %	10954507
14	NC_001732	ATTTA	2	10	22921	22930	40 %	60 %	0 %	0 %	10954509
15	NC_001732	TAATT	2	10	23737	23746	40 %	60 %	0 %	0 %	10954510
16	NC_001732	CAACA	2	10	25805	25814	60 %	0 %	0 %	40 %	10954512
17	NC_001732	CAATT	2	10	26237	26246	40 %	40 %	0 %	20 %	10954512
18	NC_001732	ACATA	2	10	27386	27395	60 %	20 %	0 %	20 %	10954512
19	NC_001732	ATTTT	2	10	27582	27591	20 %	80 %	0 %	0 %	10954512
20	NC_001732	ATTAT	2	10	28505	28514	40 %	60 %	0 %	0 %	10954513
21	NC_001732	ATTGC	2	10	29177	29186	20 %	40 %	20 %	20 %	10954515
22	NC_001732	ATTTC	2	10	29294	29303	20 %	60 %	0 %	20 %	10954515
23	NC_001732	AAGTT	2	10	29926	29935	40 %	40 %	20 %	0 %	10954515
24	NC_001732	AACCT	2	10	30716	30725	40 %	20 %	0 %	40 %	10954516
25	NC_001732	TTTTC	2	10	31689	31698	0 %	80 %	0 %	20 %	10954517
26	NC_001732	TACAA	2	10	33015	33024	60 %	20 %	0 %	20 %	10954517
27	NC_001732	CATAA	2	10	33582	33591	60 %	20 %	0 %	20 %	10954517
28	NC_001732	AGGAG	2	10	34230	34239	40 %	0 %	60 %	0 %	10954517
29	NC_001732	GTATA	2	10	34284	34293	40 %	40 %	20 %	0 %	10954517
30	NC_001732	CATAA	2	10	37497	37506	60 %	20 %	0 %	20 %	10954518
31	NC_001732	TTAGT	2	10	39982	39991	20 %	60 %	20 %	0 %	10954519
32	NC_001732	TTGTT	2	10	42456	42465	0 %	80 %	20 %	0 %	10954521
33	NC_001732	TTTAA	2	10	45545	45554	40 %	60 %	0 %	0 %	10954523
34	NC_001732	AATAT	2	10	47744	47753	60 %	40 %	0 %	0 %	10954525
35	NC_001732	TTTAA	2	10	47771	47780	40 %	60 %	0 %	0 %	10954525
36	NC_001732	TAAAG	2	10	49007	49016	60 %	20 %	20 %	0 %	10954526
37	NC_001732	TTGTA	2	10	51340	51349	20 %	60 %	20 %	0 %	10954527
38	NC_001732	TAATT	2	10	51500	51509	40 %	60 %	0 %	0 %	10954527
39	NC_001732	TTTTC	2	10	52191	52200	0 %	80 %	0 %	20 %	10954527
40	NC_001732	TCCCC	2	10	53751	53760	0 %	20 %	0 %	80 %	10954528
41	NC_001732	CTTCT	2	10	54312	54321	0 %	60 %	0 %	40 %	10954529
42	NC_001732	GAATT	2	10	57925	57934	40 %	40 %	20 %	0 %	10954531
43	NC_001732	TTTTC	2	10	58097	58106	0 %	80 %	0 %	20 %	10954531

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.