MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid large ECE

Total Repeats: 678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001732	TAT	2	6	298	303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
2	NC_001732	GAA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
3	NC_001732	ATA	3	9	425	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
4	NC_001732	ATG	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
5	NC_001732	ATG	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
6	NC_001732	GAA	2	6	599	604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
7	NC_001732	TTA	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
8	NC_001732	ATT	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
9	NC_001732	TTA	2	6	732	737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954493
10	NC_001732	GAA	2	6	770	775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
11	NC_001732	AAT	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
12	NC_001732	TAA	2	6	867	872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954493
13	NC_001732	ACT	2	6	921	926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954493
14	NC_001732	GAA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
15	NC_001732	TGA	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954493
16	NC_001732	GAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954493
17	NC_001732	TAT	2	6	1080	1085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954494
18	NC_001732	ATT	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954494
19	NC_001732	ATA	3	9	1238	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
20	NC_001732	TAC	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
21	NC_001732	TTG	2	6	1312	1317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954494
22	NC_001732	TTC	2	6	1331	1336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954494
23	NC_001732	ATA	2	6	1347	1352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
24	NC_001732	CCA	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10954494
25	NC_001732	ATC	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
26	NC_001732	ATA	2	6	1447	1452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954494
27	NC_001732	TCA	3	9	1459	1467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954494
28	NC_001732	TCA	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954495
29	NC_001732	ACC	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10954495
30	NC_001732	AGA	3	9	1948	1956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
31	NC_001732	AAC	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
32	NC_001732	GAA	3	9	2019	2027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
33	NC_001732	TTA	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
34	NC_001732	CAA	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
35	NC_001732	TAT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
36	NC_001732	TTA	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
37	NC_001732	TCA	2	6	2321	2326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954496
38	NC_001732	ATG	2	6	2333	2338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
39	NC_001732	TGA	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
40	NC_001732	GAG	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
41	NC_001732	CAA	2	6	2613	2618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954496
42	NC_001732	GAG	2	6	2882	2887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
43	NC_001732	TGG	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10954496
44	NC_001732	TTG	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
45	NC_001732	TTG	2	6	3147	3152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
46	NC_001732	GAT	2	6	3158	3163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954496
47	NC_001732	TTG	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954496
48	NC_001732	AGA	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954496
49	NC_001732	TAT	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954496
50	NC_001732	GGA	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954496
51	NC_001732	ATT	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954489
52	NC_001732	GAA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954489
53	NC_001732	ATA	3	9	3301	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954489
54	NC_001732	ATC	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954489
55	NC_001732	AAC	2	6	3407	3412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954489
56	NC_001732	AGA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954489
57	NC_001732	TAT	2	6	3904	3909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954497
58	NC_001732	TCC	2	6	3917	3922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954497
59	NC_001732	CTC	2	6	3938	3943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954497
60	NC_001732	TTC	2	6	4075	4080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954497
61	NC_001732	AAT	2	6	4109	4114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954497
62	NC_001732	TTA	2	6	4679	4684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954498
63	NC_001732	CTT	2	6	4746	4751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954498
64	NC_001732	ATC	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
65	NC_001732	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
66	NC_001732	CCT	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954498
67	NC_001732	AGT	2	6	4954	4959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954498
68	NC_001732	TGT	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954498
69	NC_001732	TAA	2	6	5046	5051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
70	NC_001732	TGC	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10954498
71	NC_001732	TAT	2	6	5268	5273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954498
72	NC_001732	GTG	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10954498
73	NC_001732	ATT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954498
74	NC_001732	TCA	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
75	NC_001732	TCT	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954498
76	NC_001732	CTT	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954498
77	NC_001732	CTA	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
78	NC_001732	ATA	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
79	NC_001732	ACT	2	6	5693	5698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
80	NC_001732	TCA	2	6	5699	5704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954498
81	NC_001732	TAA	3	9	5784	5792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954498
82	NC_001732	TCT	2	6	5854	5859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954499
83	NC_001732	CCT	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954499
84	NC_001732	CAT	2	6	5873	5878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
85	NC_001732	GAA	2	6	5914	5919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954499
86	NC_001732	ACT	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
87	NC_001732	TGC	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10954499
88	NC_001732	CTT	2	6	6197	6202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954499
89	NC_001732	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
90	NC_001732	CCT	2	6	6317	6322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954499
91	NC_001732	TAA	2	6	6416	6421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954499
92	NC_001732	TCA	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
93	NC_001732	CAT	2	6	6500	6505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
94	NC_001732	GCA	2	6	6649	6654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10954499
95	NC_001732	GAA	2	6	6679	6684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954499
96	NC_001732	TTG	2	6	6941	6946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954499
97	NC_001732	TAC	2	6	6977	6982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
98	NC_001732	ATC	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954499
99	NC_001732	ATT	2	6	7080	7085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954499
100	NC_001732	AGA	2	6	7122	7127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954499
101	NC_001732	ATT	2	6	7128	7133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954499
102	NC_001732	TTC	2	6	7140	7145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954499
103	NC_001732	AGA	2	6	7243	7248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954499
104	NC_001732	CTT	2	6	7287	7292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954499
105	NC_001732	ACA	2	6	7354	7359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954499
106	NC_001732	CAA	2	6	7364	7369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954499
107	NC_001732	AGA	2	6	7809	7814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954500
108	NC_001732	TTG	2	6	7823	7828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954500
109	NC_001732	AAC	2	6	7832	7837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954500
110	NC_001732	AGA	2	6	7842	7847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954500
111	NC_001732	AAC	2	6	7883	7888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954500
112	NC_001732	GAA	2	6	7921	7926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954500
113	NC_001732	ACA	2	6	7958	7963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10954500
114	NC_001732	ATT	2	6	7965	7970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954500
115	NC_001732	ATA	2	6	8045	8050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954500
116	NC_001732	TAA	2	6	8081	8086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954500
117	NC_001732	GAA	2	6	8244	8249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954501
118	NC_001732	AGG	2	6	8303	8308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954501
119	NC_001732	ATT	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954501
120	NC_001732	TCA	2	6	8572	8577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954501
121	NC_001732	TAA	2	6	8636	8641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954501
122	NC_001732	TAA	2	6	8843	8848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954502
123	NC_001732	ATT	2	6	8853	8858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954502
124	NC_001732	TCA	2	6	8910	8915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954502
125	NC_001732	CTC	2	6	8919	8924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954502
126	NC_001732	AAT	2	6	8965	8970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954502
127	NC_001732	TCC	2	6	9017	9022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954502
128	NC_001732	AAG	2	6	9038	9043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954502
129	NC_001732	TTA	2	6	9174	9179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954503
130	NC_001732	TTC	2	6	9204	9209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954503
131	NC_001732	TAT	2	6	9260	9265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954503
132	NC_001732	GGA	2	6	9345	9350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954503
133	NC_001732	ATG	2	6	9457	9462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954503
134	NC_001732	TAA	2	6	9484	9489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10954503
135	NC_001732	ATG	2	6	9580	9585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954503
136	NC_001732	GAT	2	6	9588	9593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10954503
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139	NC_001732	AGA	2	6	9717	9722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954503
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260	NC_001732	AGA	2	6	22021	22026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954508
261	NC_001732	AGG	2	6	22976	22981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10954509
262	NC_001732	TTG	2	6	23076	23081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10954509
263	NC_001732	GAA	2	6	23145	23150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954509
264	NC_001732	AGA	2	6	23245	23250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954509
265	NC_001732	AGA	2	6	23300	23305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10954510
266	NC_001732	TCA	2	6	23320	23325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10954510
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269	NC_001732	CTT	2	6	23486	23491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954510
270	NC_001732	CCT	2	6	23511	23516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10954510
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287	NC_001732	ACC	2	6	25055	25060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10954511
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386	NC_001732	CTT	2	6	32749	32754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10954517
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