MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid large ECE

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001732	T	6	6	419	424	0 %	100 %	0 %	0 %	10954493
2	NC_001732	A	6	6	792	797	100 %	0 %	0 %	0 %	10954493
3	NC_001732	T	6	6	1286	1291	0 %	100 %	0 %	0 %	10954494
4	NC_001732	A	6	6	2287	2292	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
5	NC_001732	T	6	6	2563	2568	0 %	100 %	0 %	0 %	10954496
6	NC_001732	A	6	6	2719	2724	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
7	NC_001732	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
8	NC_001732	A	6	6	3056	3061	100 %	0 %	0 %	0 %	10954496
9	NC_001732	A	6	6	3316	3321	100 %	0 %	0 %	0 %	10954489
10	NC_001732	T	6	6	4066	4071	0 %	100 %	0 %	0 %	10954497
11	NC_001732	T	6	6	4660	4665	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
12	NC_001732	T	6	6	4759	4764	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
13	NC_001732	T	7	7	4923	4929	0 %	100 %	0 %	0 %	10954498
14	NC_001732	A	6	6	5530	5535	100 %	0 %	0 %	0 %	10954498
15	NC_001732	T	6	6	5880	5885	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
16	NC_001732	T	7	7	6468	6474	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
17	NC_001732	T	7	7	6524	6530	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
18	NC_001732	T	7	7	6581	6587	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
19	NC_001732	T	6	6	6612	6617	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
20	NC_001732	T	6	6	7264	7269	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
21	NC_001732	T	6	6	7342	7347	0 %	100 %	0 %	0 %	10954499
22	NC_001732	A	6	6	7941	7946	100 %	0 %	0 %	0 %	10954500
23	NC_001732	A	7	7	7980	7986	100 %	0 %	0 %	0 %	10954500
24	NC_001732	A	6	6	8369	8374	100 %	0 %	0 %	0 %	10954501
25	NC_001732	A	6	6	8460	8465	100 %	0 %	0 %	0 %	10954501
26	NC_001732	A	6	6	8871	8876	100 %	0 %	0 %	0 %	10954502
27	NC_001732	A	6	6	9274	9279	100 %	0 %	0 %	0 %	10954503
28	NC_001732	A	6	6	9488	9493	100 %	0 %	0 %	0 %	10954503
29	NC_001732	A	6	6	10711	10716	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
30	NC_001732	A	6	6	10746	10751	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
31	NC_001732	A	6	6	10810	10815	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
32	NC_001732	A	6	6	11074	11079	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
33	NC_001732	T	6	6	11153	11158	0 %	100 %	0 %	0 %	10954504
34	NC_001732	A	7	7	11267	11273	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
35	NC_001732	A	6	6	12015	12020	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
36	NC_001732	A	6	6	12164	12169	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
37	NC_001732	A	7	7	12192	12198	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
38	NC_001732	A	6	6	12251	12256	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
39	NC_001732	A	6	6	12438	12443	100 %	0 %	0 %	0 %	10954504
40	NC_001732	T	6	6	12759	12764	0 %	100 %	0 %	0 %	18656943
41	NC_001732	T	7	7	12843	12849	0 %	100 %	0 %	0 %	18656943
42	NC_001732	A	6	6	12915	12920	100 %	0 %	0 %	0 %	18656943
43	NC_001732	A	7	7	13052	13058	100 %	0 %	0 %	0 %	18656943
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45	NC_001732	T	6	6	13287	13292	0 %	100 %	0 %	0 %	18656943
46	NC_001732	T	6	6	13898	13903	0 %	100 %	0 %	0 %	18656943
47	NC_001732	T	6	6	14681	14686	0 %	100 %	0 %	0 %	10954505
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49	NC_001732	T	6	6	14889	14894	0 %	100 %	0 %	0 %	10954505
50	NC_001732	T	6	6	15609	15614	0 %	100 %	0 %	0 %	10954506
51	NC_001732	G	6	6	16082	16087	0 %	0 %	100 %	0 %	10954506
52	NC_001732	T	6	6	16145	16150	0 %	100 %	0 %	0 %	10954506
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63	NC_001732	T	6	6	25793	25798	0 %	100 %	0 %	0 %	10954512
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66	NC_001732	T	7	7	26690	26696	0 %	100 %	0 %	0 %	10954512
67	NC_001732	C	6	6	27344	27349	0 %	0 %	0 %	100 %	10954512
68	NC_001732	A	7	7	27615	27621	100 %	0 %	0 %	0 %	10954512
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70	NC_001732	A	6	6	28364	28369	100 %	0 %	0 %	0 %	10954513
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72	NC_001732	A	7	7	28918	28924	100 %	0 %	0 %	0 %	10954514
73	NC_001732	A	6	6	28938	28943	100 %	0 %	0 %	0 %	10954514
74	NC_001732	A	6	6	28963	28968	100 %	0 %	0 %	0 %	10954514
75	NC_001732	A	6	6	28980	28985	100 %	0 %	0 %	0 %	10954514
76	NC_001732	A	6	6	29003	29008	100 %	0 %	0 %	0 %	10954514
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90	NC_001732	T	6	6	33317	33322	0 %	100 %	0 %	0 %	10954517
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113	NC_001732	T	6	6	39902	39907	0 %	100 %	0 %	0 %	10954519
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.