MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia solanacearum M4S plasmid pJTPS1

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001399	ATCG	2	8	419	426	25 %	25 %	25 %	25 %	10954630
2	NC_001399	CACC	2	8	619	626	25 %	0 %	0 %	75 %	10954631
3	NC_001399	CAGA	2	8	648	655	50 %	0 %	25 %	25 %	10954631
4	NC_001399	GTCG	2	8	879	886	0 %	25 %	50 %	25 %	10954632
5	NC_001399	CCAT	2	8	1287	1294	25 %	25 %	0 %	50 %	10954633
6	NC_001399	CGTG	2	8	1379	1386	0 %	25 %	50 %	25 %	10954634
7	NC_001399	CGCC	2	8	1873	1880	0 %	0 %	25 %	75 %	10954634
8	NC_001399	GCCT	2	8	2292	2299	0 %	25 %	25 %	50 %	10954634
9	NC_001399	GGAC	2	8	2467	2474	25 %	0 %	50 %	25 %	10954634
10	NC_001399	GCAG	2	8	2576	2583	25 %	0 %	50 %	25 %	10954634
11	NC_001399	CAGC	2	8	2936	2943	25 %	0 %	25 %	50 %	10954636
12	NC_001399	TGTA	2	8	3013	3020	25 %	50 %	25 %	0 %	10954636
13	NC_001399	CTTC	2	8	3328	3335	0 %	50 %	0 %	50 %	10954637
14	NC_001399	CTGG	2	8	4424	4431	0 %	25 %	50 %	25 %	10954642
15	NC_001399	GGCC	2	8	4660	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	10954642
16	NC_001399	CGTC	2	8	4706	4713	0 %	25 %	25 %	50 %	10954642
17	NC_001399	GGCA	2	8	5597	5604	25 %	0 %	50 %	25 %	10954643

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.