MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 chromosome

Total Repeats: 651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001318	AAAACC	2	12	3255	3266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_001318	ATAAAG	2	12	3528	3539	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365992270
3	NC_001318	AAGAAA	2	12	7151	7162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365992272
4	NC_001318	CAATAG	2	12	8653	8664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	365992273
5	NC_001318	CAATAA	2	12	9076	9087	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365992273
6	NC_001318	TCTATT	2	12	9108	9119	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	365992273
7	NC_001318	AATAAA	2	12	9516	9527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594355
8	NC_001318	TAAAGA	2	12	9942	9953	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15594355
9	NC_001318	TAAAAA	2	12	9986	9997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594355
10	NC_001318	TAAGCA	2	12	11827	11838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15594358
11	NC_001318	AAAACA	2	12	13952	13963	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15594360
12	NC_001318	GAAAAA	2	12	15847	15858	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001318	TACTAA	2	12	15903	15914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_001318	CTTGGG	2	12	16292	16303	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	365992276
15	NC_001318	TTAAAA	2	12	16801	16812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992276
16	NC_001318	AAATTA	2	12	22620	22631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594369
17	NC_001318	TTCAAA	2	12	22658	22669	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594369
18	NC_001318	CAAATA	2	12	27131	27142	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594374
19	NC_001318	TCAAAC	2	12	28723	28734	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15594377
20	NC_001318	ATTTAA	2	12	32158	32169	50 %	50 %	0 %	0 %	15594381
21	NC_001318	TCAATT	2	12	32235	32246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15594381
22	NC_001318	TATCAA	2	12	32818	32829	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594381
23	NC_001318	AGAAGC	2	12	33728	33739	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15594381
24	NC_001318	TAAATT	2	12	37838	37849	50 %	50 %	0 %	0 %	552542318
25	NC_001318	ATTTTT	2	12	38687	38698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15594385
26	NC_001318	TAAATT	2	12	38951	38962	50 %	50 %	0 %	0 %	15594385
27	NC_001318	GAAAGA	2	12	39009	39020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15594385
28	NC_001318	AATATA	2	12	39855	39866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594386
29	NC_001318	AAAATC	2	12	41078	41089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594388
30	NC_001318	TAAATT	2	12	43773	43784	50 %	50 %	0 %	0 %	365992277
31	NC_001318	AATTAA	2	12	45364	45375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001318	AAATAA	2	12	48376	48387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	365992279
33	NC_001318	TAAAAA	2	12	49647	49658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594399
34	NC_001318	TAAAAA	2	12	50446	50457	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	365992280
35	NC_001318	TCAAAT	2	12	51457	51468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594402
36	NC_001318	TTTAAA	2	12	54464	54475	50 %	50 %	0 %	0 %	15594404
37	NC_001318	TTAAAA	2	12	57342	57353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594408
38	NC_001318	AAATTT	2	12	57363	57374	50 %	50 %	0 %	0 %	15594408
39	NC_001318	AAAAAT	2	12	57683	57694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594408
40	NC_001318	AGAAAA	2	12	57845	57856	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15594408
41	NC_001318	TGAAAA	2	12	65864	65875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	552542320
42	NC_001318	ATTCAA	2	12	67788	67799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594418
43	NC_001318	AAAAAT	2	12	67875	67886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594418
44	NC_001318	ACTATC	2	12	68532	68543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15594418
45	NC_001318	ATTCAA	2	12	68882	68893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594418
46	NC_001318	ATAAAA	2	12	69636	69647	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594419
47	NC_001318	ACCAAA	2	12	71529	71540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15594421
48	NC_001318	AATTGA	2	12	72185	72196	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15594421
49	NC_001318	TAGAAA	2	12	72283	72294	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15594421
50	NC_001318	AATAGA	2	12	73319	73330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15594422
51	NC_001318	GAAAAC	2	12	73844	73855	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	552542321
52	NC_001318	CAATGA	2	12	74407	74418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	552542321
53	NC_001318	ATTTCC	2	12	75504	75515	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_001318	TTGCTA	2	12	76232	76243	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	365992284
55	NC_001318	ATTCCA	2	12	77116	77127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15594427
56	NC_001318	TGGAAT	2	12	77426	77437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15594427
57	NC_001318	AAAAGA	2	12	77675	77686	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15594427
58	NC_001318	TCAATG	2	12	78076	78087	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15594428
59	NC_001318	CCATTC	2	12	78487	78498	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15594428
60	NC_001318	TAAATC	2	12	78618	78629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594428
61	NC_001318	AGGAAT	2	12	80222	80233	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15594430
62	NC_001318	TTTTAT	2	12	80694	80705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15594430
63	NC_001318	TACAAA	2	12	81310	81321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594431
64	NC_001318	ATTTTC	2	12	81563	81574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15594432
65	NC_001318	AATACT	2	12	85829	85840	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_001318	AGATAA	2	12	87976	87987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	552542322
67	NC_001318	CAATTT	2	12	88683	88694	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	552542322
68	NC_001318	CAGAAA	2	12	90664	90675	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15594439
69	NC_001318	ACATCA	2	12	92085	92096	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	552542323
70	NC_001318	TCTTTT	2	12	95358	95369	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15594444
71	NC_001318	GAAATA	2	12	96288	96299	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15594444
72	NC_001318	CAAAAT	2	12	97957	97968	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594446
73	NC_001318	AACATA	2	12	98537	98548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594446
74	NC_001318	TTAAAC	2	12	100028	100039	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365992288
75	NC_001318	TGGACT	2	12	100102	100113	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	365992288
76	NC_001318	AAATTC	2	12	103767	103778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594451
77	NC_001318	GAAATA	2	12	105350	105361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001318	AAAATC	2	12	111719	111730	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594459
79	NC_001318	CAATAT	2	12	111920	111931	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594460
80	NC_001318	AAATAG	2	12	114521	114532	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365992292
81	NC_001318	TAAAAA	2	12	116448	116459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	365992293
82	NC_001318	CATTAA	2	12	117196	117207	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_001318	AATTTT	2	12	117491	117502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001318	AAGATC	2	12	117839	117850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15594465
85	NC_001318	AAATCA	2	12	117906	117917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594465
86	NC_001318	AATTTC	2	12	119845	119856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15594468
87	NC_001318	ACACAA	2	12	122433	122444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15594471
88	NC_001318	TTTCTC	2	12	122878	122889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365992294
89	NC_001318	AATTCT	2	12	124905	124916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15594474
90	NC_001318	CATCAA	2	12	125279	125290	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15594474
91	NC_001318	ATCCGA	2	12	128209	128220	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15594477
92	NC_001318	TGATAT	2	12	132304	132315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365992295
93	NC_001318	ATTTTT	2	12	132666	132677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	365992296
94	NC_001318	ATCAAA	2	12	133461	133472	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365992296
95	NC_001318	TTAAAA	2	12	135373	135384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594481
96	NC_001318	ACAAAA	2	12	135676	135687	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15594481
97	NC_001318	AAAATA	2	12	135762	135773	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594481
98	NC_001318	AAACTA	2	12	137134	137145	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594482
99	NC_001318	ATTTCA	2	12	137953	137964	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15594483
100	NC_001318	ATTTTA	2	12	139906	139917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001318	TAGAAT	2	12	141056	141067	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001318	AACTAA	2	12	142859	142870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365992298
103	NC_001318	AAAAGA	2	12	144154	144165	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365992299
104	NC_001318	AAAAAT	2	12	145431	145442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594489
105	NC_001318	AAATCA	2	12	146616	146627	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594491
106	NC_001318	TTTCAT	2	12	147307	147318	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15594491
107	NC_001318	CATTGC	2	12	147695	147706	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15594492
108	NC_001318	AAATTT	2	12	148674	148685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001318	ATAGCA	2	12	148753	148764	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_001318	TCAACT	2	12	149745	149756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552542324
111	NC_001318	CAAGAA	2	12	152664	152675	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15594497
112	NC_001318	TTGGAA	2	12	152763	152774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15594497
113	NC_001318	AATTCA	2	12	153564	153575	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365992300
114	NC_001318	TTTGCT	2	12	154156	154167	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15594499
115	NC_001318	TTAAAT	2	12	155077	155088	50 %	50 %	0 %	0 %	15594499
116	NC_001318	AACTAC	2	12	155148	155159	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15594499
117	NC_001318	TAAAAA	2	12	156749	156760	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594500
118	NC_001318	AATACT	2	12	156882	156893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594500
119	NC_001318	AATTAA	2	12	157227	157238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594500
120	NC_001318	ATTATA	2	12	157587	157598	50 %	50 %	0 %	0 %	15594500
121	NC_001318	TAAAAA	2	12	158483	158494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001318	CGAAAA	2	12	159446	159457	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15594504
123	NC_001318	CTAGAA	2	12	160562	160573	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15594505
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241	NC_001318	GAAAAA	2	12	323719	323730	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15594662
242	NC_001318	ATAAAA	2	12	326273	326284	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594664
243	NC_001318	ATCTAA	2	12	327639	327650	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594667
244	NC_001318	TGTCAA	2	12	329361	329372	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15594669
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246	NC_001318	AATTTA	2	12	331841	331852	50 %	50 %	0 %	0 %	15594671
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248	NC_001318	GCAATT	2	12	332803	332814	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15594671
249	NC_001318	TTAAAA	2	12	334820	334831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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351	NC_001318	GTTTTT	2	12	486378	486389	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15594810
352	NC_001318	AATTTA	2	12	488071	488082	50 %	50 %	0 %	0 %	15594812
353	NC_001318	CTTTTG	2	12	488565	488576	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15594813
354	NC_001318	AGTTTT	2	12	491602	491613	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	365992357
355	NC_001318	ATTTTT	2	12	492195	492206	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
356	NC_001318	AAGGCT	2	12	496339	496350	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15594822
357	NC_001318	CTGTTA	2	12	496660	496671	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15594823
358	NC_001318	ATGTTT	2	12	497943	497954	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	365992359
359	NC_001318	AAAATT	2	12	500141	500152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594829
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368	NC_001318	ATGAAA	2	12	520296	520307	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15594857
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392	NC_001318	ATTTTT	2	12	553826	553837	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_001318	TTTTTC	2	12	669996	670007	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
470	NC_001318	TTTTTG	2	12	670982	670993	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
471	NC_001318	TCAAAA	2	12	671062	671073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
472	NC_001318	AATTTC	2	12	671142	671153	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
473	NC_001318	ATTTTT	2	12	672151	672162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	365992382
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475	NC_001318	CCCCAA	2	12	674835	674846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
476	NC_001318	TCCTTT	2	12	680700	680711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15594987
477	NC_001318	TTGTTT	2	12	682527	682538	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
478	NC_001318	TTTATT	2	12	685129	685140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15594991
479	NC_001318	AATGAA	2	12	687204	687215	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	552542348
480	NC_001318	GCTCTT	2	12	687526	687537	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	552542348
481	NC_001318	GGAATG	2	12	690076	690087	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15594994
482	NC_001318	TTGATG	2	12	691817	691828	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15594997
483	NC_001318	ACTTTA	2	12	692233	692244	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15594997
484	NC_001318	TGATTT	2	12	693045	693056	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15594998
485	NC_001318	TAGGAT	2	12	696329	696340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15595001
486	NC_001318	CTTTTT	2	12	699876	699887	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15595004
487	NC_001318	AATTTA	2	12	699942	699953	50 %	50 %	0 %	0 %	15595004
488	NC_001318	GTTTTT	2	12	701810	701821	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
489	NC_001318	AATGAT	2	12	702857	702868	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365992388
490	NC_001318	TTTTGT	2	12	703282	703293	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15595010
491	NC_001318	TTTATA	2	12	703635	703646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15595010
492	NC_001318	CAAAAG	2	12	703696	703707	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15595010
493	NC_001318	TAAATA	2	12	704660	704671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992389
494	NC_001318	AAAATA	2	12	707833	707844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15595014
495	NC_001318	ATTCTA	2	12	709288	709299	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15595015
496	NC_001318	ATTTTA	2	12	710499	710510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15595015
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498	NC_001318	ATATTG	2	12	711390	711401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15595017
499	NC_001318	GAATTT	2	12	712324	712335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15595019
500	NC_001318	TATTAG	2	12	712790	712801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15595019

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