MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 chromosome

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001318	AAAACC	2	12	3255	3266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_001318	GAAAAA	2	12	15847	15858	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001318	TACTAA	2	12	15903	15914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_001318	AATTAA	2	12	45364	45375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001318	ATTTCC	2	12	75504	75515	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_001318	AATACT	2	12	85829	85840	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_001318	GAAATA	2	12	105350	105361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001318	CATTAA	2	12	117196	117207	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_001318	AATTTT	2	12	117491	117502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001318	ATTTTA	2	12	139906	139917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001318	TAGAAT	2	12	141056	141067	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001318	AAATTT	2	12	148674	148685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001318	ATAGCA	2	12	148753	148764	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_001318	TAAAAA	2	12	158483	158494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001318	TTTATT	2	12	190062	190073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001318	TAAATT	2	12	228917	228928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001318	TTTTAA	2	12	250122	250133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001318	AAATTC	2	12	267944	267955	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_001318	TAAAAA	2	12	269292	269303	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001318	TTAAAA	2	12	334820	334831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001318	TAATTT	2	12	338317	338328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001318	ATTAAA	2	12	374166	374177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001318	TTCAAA	2	12	416596	416607	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_001318	TTAATT	2	12	418363	418374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001318	ATTTTT	2	12	422214	422225	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001318	AAAAAC	2	12	435171	435182	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_001318	ATTAGT	2	12	435335	435346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001318	TCGCTT	2	12	437531	437542	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_001318	ATAAAA	2	12	438388	438399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001318	TAAAAA	2	12	438415	438426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001318	ATTAGT	2	12	438580	438591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001318	TCGCTT	2	12	440776	440787	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_001318	AATAAA	2	12	443308	443319	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001318	TTCGCC	2	12	445367	445378	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_001318	ATTAAG	2	12	481315	481326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001318	ATTTTT	2	12	492195	492206	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001318	ATTTAA	2	12	516260	516271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001318	ATTTTG	2	12	527519	527530	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001318	ATTTTT	2	12	527854	527865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001318	TTTTAA	2	12	527872	527883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001318	ATTTGA	2	12	532686	532697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001318	AATAAG	2	12	547789	547800	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001318	ATTTTT	2	12	553826	553837	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001318	ATTTTC	2	12	565271	565282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_001318	TTAGTT	2	12	628951	628962	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001318	ATTTAT	2	12	648328	648339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001318	TATTTT	2	12	669068	669079	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_001318	TTTTTC	2	12	669996	670007	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_001318	TTTTTG	2	12	670982	670993	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001318	TCAAAA	2	12	671062	671073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_001318	AATTTC	2	12	671142	671153	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_001318	CCCCAA	2	12	674835	674846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_001318	TTGTTT	2	12	682527	682538	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001318	GTTTTT	2	12	701810	701821	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001318	AATTTT	2	12	757757	757768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001318	TTTAAG	2	12	775478	775489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001318	AAATTT	2	12	777659	777670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001318	TTAATT	2	12	793665	793676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001318	TAATGT	2	12	829114	829125	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001318	AAAAGC	2	12	848508	848519	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_001318	TTCTAT	2	12	904915	904926	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_001318	ATTTTT	2	12	905032	905043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001318	TAATTT	2	12	905523	905534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001318	CATTTT	2	12	905632	905643	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_001318	TTATAA	2	12	906965	906976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001318	ATTTAT	2	12	910209	910220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.