MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 chromosome

Total Repeats: 585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001318	ATAAAG	2	12	3528	3539	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365992270
2	NC_001318	AAGAAA	2	12	7151	7162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365992272
3	NC_001318	CAATAG	2	12	8653	8664	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	365992273
4	NC_001318	CAATAA	2	12	9076	9087	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365992273
5	NC_001318	TCTATT	2	12	9108	9119	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	365992273
6	NC_001318	AATAAA	2	12	9516	9527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594355
7	NC_001318	TAAAGA	2	12	9942	9953	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15594355
8	NC_001318	TAAAAA	2	12	9986	9997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594355
9	NC_001318	TAAGCA	2	12	11827	11838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15594358
10	NC_001318	AAAACA	2	12	13952	13963	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15594360
11	NC_001318	CTTGGG	2	12	16292	16303	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	365992276
12	NC_001318	TTAAAA	2	12	16801	16812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992276
13	NC_001318	AAATTA	2	12	22620	22631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594369
14	NC_001318	TTCAAA	2	12	22658	22669	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594369
15	NC_001318	CAAATA	2	12	27131	27142	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594374
16	NC_001318	TCAAAC	2	12	28723	28734	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15594377
17	NC_001318	ATTTAA	2	12	32158	32169	50 %	50 %	0 %	0 %	15594381
18	NC_001318	TCAATT	2	12	32235	32246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15594381
19	NC_001318	TATCAA	2	12	32818	32829	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594381
20	NC_001318	AGAAGC	2	12	33728	33739	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15594381
21	NC_001318	TAAATT	2	12	37838	37849	50 %	50 %	0 %	0 %	552542318
22	NC_001318	ATTTTT	2	12	38687	38698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15594385
23	NC_001318	TAAATT	2	12	38951	38962	50 %	50 %	0 %	0 %	15594385
24	NC_001318	GAAAGA	2	12	39009	39020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15594385
25	NC_001318	AATATA	2	12	39855	39866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594386
26	NC_001318	AAAATC	2	12	41078	41089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594388
27	NC_001318	TAAATT	2	12	43773	43784	50 %	50 %	0 %	0 %	365992277
28	NC_001318	AAATAA	2	12	48376	48387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	365992279
29	NC_001318	TAAAAA	2	12	49647	49658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594399
30	NC_001318	TAAAAA	2	12	50446	50457	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	365992280
31	NC_001318	TCAAAT	2	12	51457	51468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594402
32	NC_001318	TTTAAA	2	12	54464	54475	50 %	50 %	0 %	0 %	15594404
33	NC_001318	TTAAAA	2	12	57342	57353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594408
34	NC_001318	AAATTT	2	12	57363	57374	50 %	50 %	0 %	0 %	15594408
35	NC_001318	AAAAAT	2	12	57683	57694	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594408
36	NC_001318	AGAAAA	2	12	57845	57856	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15594408
37	NC_001318	TGAAAA	2	12	65864	65875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	552542320
38	NC_001318	ATTCAA	2	12	67788	67799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594418
39	NC_001318	AAAAAT	2	12	67875	67886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594418
40	NC_001318	ACTATC	2	12	68532	68543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15594418
41	NC_001318	ATTCAA	2	12	68882	68893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594418
42	NC_001318	ATAAAA	2	12	69636	69647	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594419
43	NC_001318	ACCAAA	2	12	71529	71540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15594421
44	NC_001318	AATTGA	2	12	72185	72196	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15594421
45	NC_001318	TAGAAA	2	12	72283	72294	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15594421
46	NC_001318	AATAGA	2	12	73319	73330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15594422
47	NC_001318	GAAAAC	2	12	73844	73855	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	552542321
48	NC_001318	CAATGA	2	12	74407	74418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	552542321
49	NC_001318	TTGCTA	2	12	76232	76243	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	365992284
50	NC_001318	ATTCCA	2	12	77116	77127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15594427
51	NC_001318	TGGAAT	2	12	77426	77437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15594427
52	NC_001318	AAAAGA	2	12	77675	77686	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15594427
53	NC_001318	TCAATG	2	12	78076	78087	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15594428
54	NC_001318	CCATTC	2	12	78487	78498	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15594428
55	NC_001318	TAAATC	2	12	78618	78629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594428
56	NC_001318	AGGAAT	2	12	80222	80233	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15594430
57	NC_001318	TTTTAT	2	12	80694	80705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15594430
58	NC_001318	TACAAA	2	12	81310	81321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594431
59	NC_001318	ATTTTC	2	12	81563	81574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15594432
60	NC_001318	AGATAA	2	12	87976	87987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	552542322
61	NC_001318	CAATTT	2	12	88683	88694	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	552542322
62	NC_001318	CAGAAA	2	12	90664	90675	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15594439
63	NC_001318	ACATCA	2	12	92085	92096	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	552542323
64	NC_001318	TCTTTT	2	12	95358	95369	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15594444
65	NC_001318	GAAATA	2	12	96288	96299	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15594444
66	NC_001318	CAAAAT	2	12	97957	97968	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594446
67	NC_001318	AACATA	2	12	98537	98548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594446
68	NC_001318	TTAAAC	2	12	100028	100039	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365992288
69	NC_001318	TGGACT	2	12	100102	100113	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	365992288
70	NC_001318	AAATTC	2	12	103767	103778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594451
71	NC_001318	AAAATC	2	12	111719	111730	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594459
72	NC_001318	CAATAT	2	12	111920	111931	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594460
73	NC_001318	AAATAG	2	12	114521	114532	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365992292
74	NC_001318	TAAAAA	2	12	116448	116459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	365992293
75	NC_001318	AAGATC	2	12	117839	117850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15594465
76	NC_001318	AAATCA	2	12	117906	117917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594465
77	NC_001318	AATTTC	2	12	119845	119856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15594468
78	NC_001318	ACACAA	2	12	122433	122444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15594471
79	NC_001318	TTTCTC	2	12	122878	122889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365992294
80	NC_001318	AATTCT	2	12	124905	124916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15594474
81	NC_001318	CATCAA	2	12	125279	125290	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15594474
82	NC_001318	ATCCGA	2	12	128209	128220	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15594477
83	NC_001318	TGATAT	2	12	132304	132315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365992295
84	NC_001318	ATTTTT	2	12	132666	132677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	365992296
85	NC_001318	ATCAAA	2	12	133461	133472	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365992296
86	NC_001318	TTAAAA	2	12	135373	135384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594481
87	NC_001318	ACAAAA	2	12	135676	135687	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15594481
88	NC_001318	AAAATA	2	12	135762	135773	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594481
89	NC_001318	AAACTA	2	12	137134	137145	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594482
90	NC_001318	ATTTCA	2	12	137953	137964	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15594483
91	NC_001318	AACTAA	2	12	142859	142870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365992298
92	NC_001318	AAAAGA	2	12	144154	144165	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365992299
93	NC_001318	AAAAAT	2	12	145431	145442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594489
94	NC_001318	AAATCA	2	12	146616	146627	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594491
95	NC_001318	TTTCAT	2	12	147307	147318	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15594491
96	NC_001318	CATTGC	2	12	147695	147706	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15594492
97	NC_001318	TCAACT	2	12	149745	149756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552542324
98	NC_001318	CAAGAA	2	12	152664	152675	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15594497
99	NC_001318	TTGGAA	2	12	152763	152774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15594497
100	NC_001318	AATTCA	2	12	153564	153575	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365992300
101	NC_001318	TTTGCT	2	12	154156	154167	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15594499
102	NC_001318	TTAAAT	2	12	155077	155088	50 %	50 %	0 %	0 %	15594499
103	NC_001318	AACTAC	2	12	155148	155159	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15594499
104	NC_001318	TAAAAA	2	12	156749	156760	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15594500
105	NC_001318	AATACT	2	12	156882	156893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15594500
106	NC_001318	AATTAA	2	12	157227	157238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15594500
107	NC_001318	ATTATA	2	12	157587	157598	50 %	50 %	0 %	0 %	15594500
108	NC_001318	CGAAAA	2	12	159446	159457	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15594504
109	NC_001318	CTAGAA	2	12	160562	160573	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15594505
110	NC_001318	ATTTTT	2	12	160977	160988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15594505
111	NC_001318	TCATAT	2	12	161445	161456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	365992302
112	NC_001318	ATCTTT	2	12	161966	161977	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	365992302
113	NC_001318	AAATAT	2	12	165036	165047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365992303
114	NC_001318	ATAAAA	2	12	165441	165452	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	365992303
115	NC_001318	AATCAA	2	12	168239	168250	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15594511
116	NC_001318	CTTTTT	2	12	169348	169359	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15594511
117	NC_001318	AAAGAC	2	12	170587	170598	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365992304
118	NC_001318	TTTTAT	2	12	172354	172365	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	365992306
119	NC_001318	AACTTC	2	12	173186	173197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365992306
120	NC_001318	ATTGGA	2	12	173336	173347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365992306
121	NC_001318	TAAAAA	2	12	174893	174904	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	365992307
122	NC_001318	CTAAAA	2	12	175138	175149	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	552542325
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