MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 chromosome

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001318	TATAA	2	10	65	74	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001318	GCTTT	2	10	2274	2283	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_001318	AATTT	2	10	8328	8337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001318	TAAAT	2	10	20016	20025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001318	AATTA	2	10	22741	22750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001318	AATAA	2	10	46679	46688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001318	AAATT	2	10	49264	49273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001318	AATTA	2	10	56807	56816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001318	TAAAA	2	10	75050	75059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001318	AAAAT	2	10	75130	75139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001318	AAAAT	2	10	80965	80974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001318	ATTAA	2	10	83927	83936	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001318	ATAAA	2	10	94099	94108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001318	AAAGT	2	10	98668	98677	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001318	ATAAA	2	10	101429	101438	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001318	TACAA	2	10	108203	108212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_001318	AAAAG	2	10	116855	116864	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001318	AAAAT	2	10	117594	117603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001318	TAAAA	2	10	131234	131243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001318	TTATA	2	10	131246	131255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001318	GAAAA	2	10	138245	138254	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001318	AAATA	2	10	138272	138281	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001318	AAAAT	2	10	141904	141913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001318	TATAA	2	10	144279	144288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001318	TAAAA	2	10	150895	150904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001318	TAAAA	2	10	150938	150947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001318	TAAAG	2	10	153059	153068	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001318	GACTT	2	10	158520	158529	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_001318	ATCAG	2	10	169457	169466	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_001318	TTTAA	2	10	189279	189288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001318	TAAAA	2	10	193688	193697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001318	AAATT	2	10	208655	208664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001318	ATTAT	2	10	208800	208809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001318	TCAAG	2	10	220662	220671	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_001318	TAAAA	2	10	244729	244738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001318	AGAAA	2	10	245507	245516	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001318	TAAAA	2	10	245639	245648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001318	AAAAT	2	10	245674	245683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001318	AGAAA	2	10	248477	248486	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001318	TAAAA	2	10	253069	253078	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001318	AACAA	2	10	263730	263739	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_001318	AAATT	2	10	267858	267867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001318	TAAAA	2	10	269218	269227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001318	CTTTG	2	10	273648	273657	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_001318	TATAA	3	15	273715	273729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001318	TTTTA	2	10	273758	273767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001318	ACTTA	2	10	298781	298790	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_001318	AAACA	2	10	318128	318137	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_001318	AGATT	2	10	318184	318193	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001318	TAATT	2	10	327870	327879	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001318	AAAGC	2	10	340015	340024	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_001318	ATAAA	2	10	355416	355425	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001318	TAAAA	2	10	361155	361164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001318	ATAAA	2	10	365673	365682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001318	AAAAT	2	10	388482	388491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001318	TAAAA	2	10	395244	395253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001318	AATTT	2	10	408523	408532	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001318	TTAAT	2	10	410693	410702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001318	CTCCC	2	10	437676	437685	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
60	NC_001318	CTCCC	2	10	440921	440930	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
61	NC_001318	AAAAG	2	10	444505	444514	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001318	TCGCT	2	10	444845	444854	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_001318	TTATT	2	10	446094	446103	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001318	AAAAC	2	10	449369	449378	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_001318	ACACA	2	10	458263	458272	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_001318	ATTCA	2	10	463952	463961	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_001318	TATTT	2	10	481175	481184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001318	TTATT	2	10	492036	492045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001318	ATAAA	2	10	494563	494572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001318	AGATA	2	10	496257	496266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001318	ATGAT	2	10	509287	509296	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001318	TTTGC	2	10	513197	513206	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_001318	TTCTT	2	10	533613	533622	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_001318	ATTTA	2	10	534196	534205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001318	ATTTG	2	10	540287	540296	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001318	TTTTG	2	10	540300	540309	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001318	TTTAT	2	10	564706	564715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001318	ATTTT	2	10	565329	565338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001318	TAATT	2	10	565896	565905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_001318	TATTT	2	10	575817	575826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001318	TAAAT	2	10	577256	577265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001318	TTTTA	2	10	584159	584168	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001318	TTTTA	2	10	587913	587922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001318	ATTTG	2	10	591067	591076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001318	GGATA	2	10	606992	607001	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001318	CAATT	2	10	607040	607049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_001318	GTTTT	2	10	618745	618754	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001318	TATAT	2	10	634477	634486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001318	TAAAT	2	10	634496	634505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001318	ATTTA	2	10	634522	634531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001318	ATTTT	2	10	636194	636203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_001318	TAATT	2	10	643255	643264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001318	TTTAT	2	10	645606	645615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001318	AATTA	2	10	649153	649162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_001318	TTAAA	2	10	662933	662942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001318	TGCTT	2	10	668633	668642	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_001318	AATTT	2	10	669106	669115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001318	ATTTT	2	10	669523	669532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001318	ATTTG	2	10	670798	670807	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001318	ATAAA	2	10	671438	671447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_001318	TTGAT	2	10	674898	674907	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001318	TATTT	2	10	705565	705574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001318	TCATT	2	10	711677	711686	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_001318	TAGAA	2	10	714917	714926	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001318	TATAA	2	10	724148	724157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001318	GATAT	2	10	733994	734003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001318	TTTTG	2	10	738822	738831	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001318	ATTTT	2	10	744862	744871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001318	TATTT	2	10	746897	746906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001318	ATTAA	2	10	783292	783301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001318	TTTTG	2	10	789247	789256	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001318	TTGAT	2	10	789293	789302	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001318	CTTAA	2	10	799079	799088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_001318	ATTAT	2	10	799091	799100	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001318	ATATT	2	10	804385	804394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001318	ATTTT	2	10	809570	809579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001318	AATTT	2	10	813278	813287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001318	TAAAT	2	10	813372	813381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001318	ATAAA	2	10	815431	815440	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001318	GTTTA	2	10	842452	842461	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001318	GTTTT	2	10	860202	860211	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001318	TTTTA	2	10	860312	860321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001318	TTTTA	2	10	869480	869489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001318	AGTTT	2	10	870062	870071	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001318	TAATT	2	10	870082	870091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001318	TATAT	2	10	899362	899371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001318	TATTG	2	10	903532	903541	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001318	TTTTA	2	10	905959	905968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001318	TAAAT	2	10	906002	906011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001318	TTTAA	2	10	906413	906422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001318	ACTTA	2	10	907164	907173	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_001318	GAATT	2	10	907358	907367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001318	AATTT	2	10	907536	907545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001318	GGATA	2	10	907593	907602	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001318	AAAAT	2	10	908034	908043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001318	TAAGG	2	10	908205	908214	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001318	AATAA	2	10	909646	909655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.